MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 6383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009785	T	6	6	1530	1535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009785	CTA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009785	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009785	ATAA	2	8	1652	1659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009785	CCT	2	6	3547	3552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009785	AAAT	2	8	3571	3578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009785	TA	4	8	6181	6188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009785	ATTC	2	8	6203	6210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009785	AAG	2	6	7906	7911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009785	TA	3	6	7987	7992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009785	GAG	2	6	8056	8061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009785	GAT	2	6	9093	9098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009785	TAT	2	6	9120	9125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009785	CTA	2	6	9157	9162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009785	TA	3	6	9161	9166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009785	AT	3	6	10688	10693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009785	TTTTA	2	10	10702	10711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009785	TTA	2	6	12278	12283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009785	GAAA	2	8	12322	12329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009785	TGT	2	6	12341	12346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009785	CAT	2	6	12364	12369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009785	ATA	2	6	12378	12383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009785	AGA	2	6	14967	14972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009785	A	7	7	14997	15003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009785	AGA	2	6	15008	15013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009785	A	6	6	15042	15047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009785	TAT	2	6	15071	15076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009785	ATT	2	6	19053	19058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009785	TAAA	2	8	19105	19112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009785	ATG	2	6	19168	19173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009785	T	7	7	19864	19870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009785	TAAA	2	8	21530	21537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009785	A	6	6	21535	21540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009785	AAAAT	2	10	21587	21596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009785	CTTT	2	8	21621	21628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009785	GATA	2	8	21716	21723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009785	A	6	6	21734	21739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009785	TAG	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009785	TTTG	2	8	22449	22456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009785	AGCAC	2	10	22515	22524	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009785	TAAA	2	8	23694	23701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009785	GATTT	2	10	24337	24346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009785	ATG	2	6	24371	24376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009785	A	6	6	26388	26393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009785	ACA	2	6	26415	26420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009785	ATA	2	6	26438	26443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009785	A	7	7	26477	26483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009785	ATT	2	6	26493	26498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009785	T	9	9	26560	26568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009785	ACA	2	6	26578	26583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009785	GAT	2	6	26599	26604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009785	CAAT	2	8	26606	26613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009785	T	6	6	26684	26689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009785	GA	3	6	29167	29172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009785	CAGT	2	8	30885	30892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009785	GTA	2	6	30914	30919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009785	AAAGAT	2	12	30930	30941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009785	T	6	6	34149	34154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009785	AAGG	2	8	34167	34174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009785	A	7	7	34185	34191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009785	GAAA	2	8	40303	40310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009785	ATT	2	6	41904	41909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009785	A	6	6	44285	44290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009785	TA	3	6	44341	44346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009785	CAAA	2	8	44353	44360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009785	ATATA	2	10	44406	44415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009785	TAA	2	6	44438	44443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009785	T	6	6	44468	44473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009785	ACT	2	6	44474	44479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009785	T	6	6	45200	45205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009785	A	6	6	45251	45256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009785	T	7	7	45275	45281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009785	TTA	2	6	45289	45294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009785	ATTA	2	8	45296	45303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009785	AGG	2	6	47616	47621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009785	A	6	6	49783	49788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009785	TCCTC	2	10	49853	49862	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_009785	T	6	6	49863	49868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009785	AAAT	2	8	49871	49878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009785	A	6	6	49913	49918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009785	A	6	6	51088	51093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009785	TAA	2	6	51196	51201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009785	AAG	2	6	51238	51243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009785	A	6	6	51262	51267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009785	TCA	2	6	51294	51299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009785	ATCC	2	8	52392	52399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009785	TGG	2	6	52418	52423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009785	AAT	2	6	52433	52438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009785	T	6	6	54342	54347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009785	CCT	2	6	54348	54353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009785	A	6	6	54364	54369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009785	TA	4	8	54374	54381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009785	ATT	2	6	54382	54387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009785	TA	4	8	54389	54396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009785	TA	3	6	54400	54405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009785	AT	3	6	54431	54436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009785	TA	4	8	54445	54452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009785	T	7	7	54454	54460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009785	TATT	2	8	54523	54530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009785	AAAT	2	8	57495	57502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009785	TAATG	2	10	59067	59076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009785	AAG	2	6	59090	59095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009785	CAT	2	6	59101	59106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009785	AGG	2	6	59114	59119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009785	CTG	2	6	59621	59626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009785	T	6	6	59638	59643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009785	T	6	6	59688	59693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009785	ATG	2	6	59771	59776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009785	AAGA	2	8	59784	59791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009785	GA	3	6	59807	59812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009785	ATA	2	6	59823	59828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009785	A	8	8	59849	59856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009785	ACAAA	2	10	59911	59920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009785	TAG	2	6	60242	60247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009785	AGAA	2	8	60278	60285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009785	GA	3	6	63847	63852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009785	AG	4	8	74216	74223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009785	TC	3	6	74235	74240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009785	CT	3	6	74257	74262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009785	TAG	2	6	74307	74312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009785	TAGCTA	2	12	74364	74375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009785	T	6	6	75887	75892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009785	A	6	6	75920	75925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009785	A	7	7	75955	75961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009785	TA	3	6	76015	76020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009785	TTAG	2	8	76036	76043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009785	TTAT	2	8	76205	76212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009785	ATG	2	6	78346	78351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009785	CAA	2	6	78364	78369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009785	TGT	2	6	78384	78389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009785	AATG	2	8	78396	78403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009785	TAT	2	6	78420	78425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009785	AGA	2	6	78505	78510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009785	AT	3	6	78535	78540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009785	A	6	6	78585	78590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009785	A	7	7	78601	78607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009785	A	6	6	79081	79086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009785	TGA	2	6	79113	79118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009785	AG	3	6	79132	79137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009785	GTTC	2	8	79144	79151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009785	TC	3	6	79150	79155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009785	T	6	6	79156	79161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009785	TAG	2	6	79214	79219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009785	TTG	2	6	79573	79578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009785	TTTATA	2	12	79602	79613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009785	TCT	2	6	79625	79630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009785	AC	3	6	79641	79646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009785	AGA	2	6	79672	79677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009785	GTTAA	2	10	79680	79689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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