MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009641	ATC	2	6	2623037	2623042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_009641	TA	4	8	2623074	2623081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_009641	TAT	2	6	2623150	2623155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_009641	ATA	2	6	2623156	2623161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_009641	CATTT	2	10	2624967	2624976	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11506	NC_009641	TAA	2	6	2625041	2625046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_009641	AATT	2	8	2625068	2625075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_009641	TAA	2	6	2625101	2625106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_009641	TAA	2	6	2625109	2625114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_009641	AT	3	6	2625197	2625202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_009641	CATT	2	8	2625510	2625517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_009641	TAA	2	6	2625522	2625527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_009641	A	6	6	2625531	2625536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_009641	T	6	6	2625553	2625558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_009641	ACAT	2	8	2625563	2625570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11516	NC_009641	AT	3	6	2625569	2625574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_009641	GT	3	6	2625954	2625959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_009641	AGTA	2	8	2625985	2625992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_009641	A	7	7	2626003	2626009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_009641	ATA	2	6	2626156	2626161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_009641	TAT	2	6	2626175	2626180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_009641	ATTTC	2	10	2626213	2626222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11523	NC_009641	TTA	2	6	2626243	2626248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_009641	AAT	2	6	2627476	2627481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_009641	CCA	2	6	2627491	2627496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_009641	T	6	6	2627499	2627504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_009641	CTT	2	6	2627509	2627514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_009641	CT	3	6	2627520	2627525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11529	NC_009641	AATT	2	8	2627539	2627546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_009641	ATT	2	6	2627575	2627580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_009641	ATAC	2	8	2627588	2627595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11532	NC_009641	CATA	2	8	2627608	2627615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11533	NC_009641	ACT	2	6	2627628	2627633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11535	NC_009641	A	7	7	2627685	2627691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_009641	TCA	2	6	2627763	2627768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_009641	GTT	2	6	2627777	2627782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_009641	TAT	2	6	2627817	2627822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_009641	ATT	2	6	2627834	2627839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_009641	TTAC	2	8	2632370	2632377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_009641	ATT	2	6	2632449	2632454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_009641	TA	3	6	2632456	2632461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_009641	ATT	3	9	2632492	2632500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_009641	AAT	2	6	2632515	2632520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_009641	TAAAA	2	10	2632570	2632579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_009641	A	6	6	2632576	2632581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_009641	ATA	2	6	2633037	2633042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_009641	TAA	2	6	2633058	2633063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_009641	AT	3	6	2633070	2633075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_009641	GCTA	2	8	2633088	2633095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11551	NC_009641	ATTTTG	2	12	2633122	2633133	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_009641	ATA	2	6	2633155	2633160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_009641	TTAT	2	8	2633196	2633203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_009641	TA	4	8	2633208	2633215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_009641	TA	4	8	2633217	2633224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_009641	ATA	2	6	2633278	2633283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_009641	TAG	2	6	2633307	2633312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_009641	ATAAA	2	10	2634090	2634099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_009641	TAC	2	6	2634110	2634115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_009641	TAAA	2	8	2634130	2634137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_009641	CTTT	2	8	2634151	2634158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_009641	TAT	2	6	2634167	2634172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_009641	CTA	2	6	2634182	2634187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_009641	TA	3	6	2634186	2634191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_009641	ATT	2	6	2635238	2635243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_009641	TTTTAA	2	12	2635258	2635269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_009641	A	6	6	2635268	2635273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_009641	TCT	2	6	2635727	2635732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_009641	TTG	2	6	2635741	2635746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11571	NC_009641	TCT	2	6	2635781	2635786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_009641	TCT	2	6	2635844	2635849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_009641	AAT	2	6	2635852	2635857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_009641	ACC	2	6	2635921	2635926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11575	NC_009641	TCT	2	6	2635958	2635963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_009641	ATT	2	6	2635981	2635986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_009641	TCT	3	9	2636060	2636068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_009641	ATTT	2	8	2638176	2638183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_009641	A	7	7	2638234	2638240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_009641	TAA	2	6	2638247	2638252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_009641	TTG	2	6	2638263	2638268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_009641	T	6	6	2638289	2638294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_009641	ATT	2	6	2638295	2638300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_009641	AT	4	8	2638311	2638318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_009641	T	6	6	2638361	2638366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_009641	TACT	2	8	2638368	2638375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11587	NC_009641	TAAAT	2	10	2638379	2638388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_009641	CATA	2	8	2638423	2638430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11589	NC_009641	CAT	2	6	2638449	2638454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_009641	TTTG	2	8	2638521	2638528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_009641	ATT	2	6	2638538	2638543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_009641	TAA	2	6	2638604	2638609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_009641	TC	3	6	2638683	2638688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_009641	ATCA	2	8	2638697	2638704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11596	NC_009641	A	7	7	2638771	2638777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_009641	TCT	2	6	2639231	2639236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11599	NC_009641	ACTT	2	8	2639266	2639273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_009641	TCT	2	6	2639285	2639290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_009641	TCT	2	6	2639348	2639353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_009641	AAT	2	6	2639356	2639361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_009641	ACC	2	6	2639425	2639430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_009641	TCT	2	6	2639462	2639467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_009641	ATT	2	6	2639485	2639490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_009641	TCT	3	9	2639564	2639572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_009641	T	6	6	2641877	2641882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_009641	TAA	2	6	2641888	2641893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_009641	A	6	6	2641931	2641936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_009641	TAT	2	6	2641990	2641995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_009641	TCA	2	6	2642025	2642030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_009641	CA	3	6	2642042	2642047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_009641	T	6	6	2642057	2642062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_009641	T	7	7	2642070	2642076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_009641	AT	3	6	2642269	2642274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_009641	CTCTTT	2	12	2643679	2643690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11618	NC_009641	ATA	2	6	2643730	2643735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_009641	TA	3	6	2643734	2643739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_009641	CAA	2	6	2643752	2643757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_009641	CTT	2	6	2645348	2645353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_009641	TTA	2	6	2646097	2646102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_009641	CTTT	2	8	2646117	2646124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11624	NC_009641	ACC	2	6	2646143	2646148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_009641	ATTTAA	2	12	2646157	2646168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_009641	CCT	2	6	2646970	2646975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11627	NC_009641	TGA	2	6	2646990	2646995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_009641	TAT	2	6	2647040	2647045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_009641	ACTC	2	8	2647091	2647098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11631	NC_009641	CTA	2	6	2647115	2647120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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