MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009641	AATG	2	8	2513278	2513285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_009641	TCA	2	6	2514481	2514486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_009641	ATTT	2	8	2514492	2514499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_009641	T	6	6	2514497	2514502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_009641	TA	3	6	2514524	2514529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_009641	AT	4	8	2514602	2514609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_009641	TAT	2	6	2514612	2514617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_009641	TTAT	2	8	2514650	2514657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_009641	CAT	2	6	2514713	2514718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_009641	ATT	2	6	2514728	2514733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_009641	T	7	7	2514760	2514766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_009641	ACGTT	2	10	2514796	2514805	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11013	NC_009641	ACA	2	6	2514819	2514824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_009641	AGG	2	6	2514827	2514832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_009641	CATTTA	2	12	2515517	2515528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11016	NC_009641	AT	3	6	2515533	2515538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_009641	TGA	2	6	2515564	2515569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_009641	TAA	2	6	2515573	2515578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_009641	TGC	2	6	2515612	2515617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_009641	A	6	6	2515659	2515664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_009641	ACA	2	6	2515688	2515693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_009641	A	6	6	2515704	2515709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_009641	TAA	2	6	2515710	2515715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_009641	ACA	2	6	2516489	2516494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_009641	AAT	2	6	2516512	2516517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_009641	A	7	7	2516642	2516648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_009641	AGA	2	6	2516675	2516680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_009641	ATGT	2	8	2517397	2517404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_009641	TCC	2	6	2525420	2525425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11030	NC_009641	T	7	7	2525509	2525515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_009641	ATA	2	6	2525589	2525594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_009641	AT	3	6	2525674	2525679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_009641	TC	3	6	2525680	2525685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_009641	CTTA	2	8	2525695	2525702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_009641	ATTT	2	8	2525706	2525713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_009641	T	6	6	2525711	2525716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_009641	ATA	2	6	2529434	2529439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_009641	A	7	7	2529448	2529454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_009641	TTTTGT	2	12	2530249	2530260	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_009641	A	7	7	2530352	2530358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_009641	AT	3	6	2530366	2530371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_009641	ATTT	2	8	2530387	2530394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_009641	AGCA	2	8	2530396	2530403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11044	NC_009641	AT	3	6	2530407	2530412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_009641	TAT	3	9	2530430	2530438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_009641	T	6	6	2530991	2530996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_009641	ATTTT	2	10	2531012	2531021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_009641	AAAT	2	8	2531024	2531031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_009641	TTA	2	6	2531111	2531116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_009641	CT	3	6	2531124	2531129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_009641	A	6	6	2531136	2531141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_009641	GAA	2	6	2531166	2531171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_009641	TC	3	6	2532134	2532139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_009641	TTTC	2	8	2532151	2532158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_009641	ACG	2	6	2532216	2532221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_009641	ATC	2	6	2532436	2532441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_009641	ATT	2	6	2532465	2532470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_009641	A	6	6	2532487	2532492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_009641	CAA	2	6	2532508	2532513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_009641	A	6	6	2533111	2533116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_009641	CCT	2	6	2534725	2534730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_009641	TA	3	6	2534757	2534762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_009641	ATA	2	6	2534799	2534804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_009641	ATA	2	6	2534908	2534913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_009641	A	7	7	2534918	2534924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_009641	ATTG	2	8	2535328	2535335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_009641	ATT	2	6	2535351	2535356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009641	CAT	2	6	2535384	2535389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_009641	TAC	2	6	2535417	2535422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_009641	ATC	2	6	2535429	2535434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_009641	ATC	2	6	2535462	2535467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_009641	AAT	2	6	2535512	2535517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_009641	TAA	2	6	2535521	2535526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_009641	AC	3	6	2535549	2535554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11075	NC_009641	A	7	7	2535597	2535603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_009641	CTA	2	6	2535604	2535609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11078	NC_009641	CTA	2	6	2535659	2535664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_009641	TAA	2	6	2535764	2535769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_009641	CAA	2	6	2535791	2535796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_009641	CTA	2	6	2536795	2536800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_009641	AACT	2	8	2536810	2536817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_009641	TAAT	2	8	2536825	2536832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_009641	ACT	2	6	2536864	2536869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_009641	AT	3	6	2536928	2536933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_009641	ATAAA	2	10	2536968	2536977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_009641	A	7	7	2536975	2536981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_009641	ATT	2	6	2536986	2536991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_009641	AG	3	6	2537020	2537025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_009641	ACA	2	6	2538309	2538314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_009641	CAT	2	6	2538330	2538335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_009641	AT	3	6	2540596	2540601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_009641	CTTATT	2	12	2540605	2540616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11094	NC_009641	TA	3	6	2540692	2540697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_009641	TAA	2	6	2542088	2542093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_009641	TAA	2	6	2542119	2542124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_009641	TTC	2	6	2542142	2542147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_009641	C	6	6	2542162	2542167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11099	NC_009641	A	6	6	2542177	2542182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_009641	AC	3	6	2542185	2542190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11101	NC_009641	A	6	6	2542225	2542230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_009641	TTA	2	6	2542242	2542247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_009641	AGT	2	6	2542286	2542291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_009641	ATA	2	6	2542300	2542305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_009641	AGG	2	6	2542314	2542319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_009641	TCG	2	6	2542350	2542355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_009641	ATT	2	6	2542402	2542407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_009641	AAT	2	6	2542427	2542432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_009641	ACTC	2	8	2542554	2542561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11110	NC_009641	GAT	2	6	2543326	2543331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_009641	TTTTC	2	10	2543345	2543354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11112	NC_009641	AT	3	6	2543356	2543361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_009641	CATTTT	2	12	2543422	2543433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11114	NC_009641	T	6	6	2543430	2543435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_009641	ACC	2	6	2543456	2543461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11116	NC_009641	TAA	2	6	2543462	2543467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_009641	A	6	6	2543511	2543516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_009641	T	6	6	2543517	2543522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_009641	TAA	2	6	2543544	2543549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_009641	CCT	2	6	2543555	2543560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11121	NC_009641	TA	3	6	2543569	2543574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_009641	ACC	2	6	2544471	2544476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_009641	TAGTA	2	10	2544483	2544492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_009641	ATGA	2	8	2544501	2544508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_009641	ATTTTA	2	12	2544512	2544523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_009641	ATTC	2	8	2544569	2544576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11127	NC_009641	AAT	2	6	2544589	2544594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_009641	TGTT	2	8	2544645	2544652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_009641	TAG	2	6	2544694	2544699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11131	NC_009641	TCT	2	6	2544794	2544799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11255	NC_009641	AT	3	6	2568591	2568596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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