MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_009641	TAT	2	6	2419393	2419398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_009641	A	6	6	2419554	2419559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_009641	CA	3	6	2419579	2419584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_009641	TCTT	2	8	2419607	2419614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10505	NC_009641	GA	3	6	2419628	2419633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_009641	AGG	2	6	2419696	2419701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_009641	CAA	2	6	2420539	2420544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_009641	TTG	2	6	2420558	2420563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_009641	T	6	6	2420566	2420571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_009641	A	7	7	2420582	2420588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_009641	TAA	2	6	2420642	2420647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_009641	ACA	2	6	2420655	2420660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_009641	AC	3	6	2420672	2420677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_009641	AATT	2	8	2420761	2420768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_009641	TTACA	2	10	2420796	2420805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10516	NC_009641	TA	4	8	2420928	2420935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_009641	TGA	2	6	2422370	2422375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_009641	TTC	2	6	2422386	2422391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_009641	CAT	2	6	2422438	2422443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_009641	AAC	2	6	2423528	2423533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_009641	TTAAAA	2	12	2423551	2423562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_009641	ATG	2	6	2423590	2423595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_009641	CAT	2	6	2423609	2423614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_009641	TA	4	8	2423628	2423635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_009641	CCA	2	6	2423667	2423672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_009641	ATT	2	6	2423673	2423678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_009641	TAA	2	6	2423687	2423692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_009641	TAA	2	6	2423698	2423703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_009641	ATA	2	6	2423742	2423747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_009641	AAAT	2	8	2424206	2424213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_009641	ATTA	2	8	2424221	2424228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_009641	TTA	2	6	2424261	2424266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_009641	T	7	7	2424282	2424288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_009641	AAG	2	6	2424319	2424324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_009641	TCA	2	6	2424351	2424356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_009641	A	7	7	2424399	2424405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_009641	GGA	2	6	2424419	2424424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_009641	GAT	2	6	2424943	2424948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_009641	TCA	2	6	2424984	2424989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_009641	A	6	6	2424989	2424994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_009641	TCT	2	6	2425259	2425264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_009641	TAT	2	6	2426259	2426264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_009641	C	6	6	2426286	2426291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10544	NC_009641	TTG	2	6	2426332	2426337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_009641	TAT	2	6	2427566	2427571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_009641	CAT	2	6	2427620	2427625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_009641	ATG	2	6	2427640	2427645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_009641	TA	3	6	2427668	2427673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_009641	T	6	6	2427677	2427682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_009641	TAAC	2	8	2427701	2427708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10551	NC_009641	AC	3	6	2427707	2427712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10552	NC_009641	GTT	2	6	2428652	2428657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_009641	CAT	2	6	2428669	2428674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_009641	A	7	7	2428711	2428717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_009641	TCA	2	6	2428737	2428742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_009641	AGAC	2	8	2428748	2428755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10557	NC_009641	TAA	2	6	2428768	2428773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_009641	TTTA	2	8	2428833	2428840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_009641	CATAAT	2	12	2428850	2428861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10560	NC_009641	ATG	2	6	2428867	2428872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_009641	GAT	2	6	2428888	2428893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_009641	T	7	7	2428914	2428920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_009641	ATT	2	6	2428931	2428936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_009641	A	7	7	2428981	2428987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_009641	TA	4	8	2432477	2432484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_009641	TAA	2	6	2432503	2432508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_009641	CA	3	6	2432541	2432546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10568	NC_009641	AATT	2	8	2432559	2432566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_009641	GTT	2	6	2432590	2432595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_009641	ATC	2	6	2432661	2432666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_009641	AAT	2	6	2432683	2432688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_009641	ATT	2	6	2432693	2432698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_009641	TTA	2	6	2432747	2432752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_009641	TAA	2	6	2432764	2432769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_009641	TCACC	2	10	2432770	2432779	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10576	NC_009641	TAA	2	6	2432823	2432828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_009641	CTA	2	6	2432847	2432852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10578	NC_009641	TAAAT	2	10	2432878	2432887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_009641	AAATC	2	10	2432909	2432918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10580	NC_009641	TAAA	2	8	2432925	2432932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_009641	TCTA	2	8	2433011	2433018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10582	NC_009641	CAC	2	6	2434014	2434019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10583	NC_009641	TATT	2	8	2434057	2434064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_009641	T	7	7	2434079	2434085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_009641	T	6	6	2434112	2434117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_009641	T	6	6	2434122	2434127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_009641	CCA	2	6	2434946	2434951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10588	NC_009641	ATCATT	2	12	2434960	2434971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10589	NC_009641	TTA	3	9	2434972	2434980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_009641	CAA	2	6	2434998	2435003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_009641	CTT	2	6	2435016	2435021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_009641	A	7	7	2435034	2435040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_009641	GAAAG	2	10	2435070	2435079	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_009641	TAA	2	6	2435084	2435089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_009641	TGT	2	6	2435100	2435105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_009641	TA	3	6	2435137	2435142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_009641	T	6	6	2435199	2435204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_009641	T	8	8	2435238	2435245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_009641	AT	3	6	2435297	2435302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_009641	AGG	2	6	2435311	2435316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_009641	CAG	2	6	2436022	2436027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_009641	GAT	2	6	2436031	2436036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_009641	TGC	2	6	2436056	2436061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_009641	TAC	2	6	2436170	2436175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_009641	A	7	7	2436208	2436214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_009641	CTG	2	6	2436251	2436256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_009641	CAT	2	6	2436340	2436345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_009641	ATC	2	6	2436362	2436367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_009641	TAA	2	6	2437421	2437426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_009641	TTAT	2	8	2437811	2437818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_009641	TTA	2	6	2437830	2437835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_009641	TTC	2	6	2437859	2437864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_009641	TA	3	6	2437926	2437931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_009641	AT	3	6	2438005	2438010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_009641	AT	3	6	2438013	2438018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_009641	AT	3	6	2438021	2438026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_009641	T	6	6	2438050	2438055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_009641	A	7	7	2438069	2438075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_009641	AAAC	2	8	2438103	2438110	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10620	NC_009641	ACA	2	6	2438171	2438176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_009641	TAA	2	6	2438188	2438193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_009641	AT	3	6	2438195	2438200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_009641	TA	3	6	2439103	2439108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_009641	ATA	2	6	2439128	2439133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_009641	CAT	2	6	2439141	2439146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_009641	AAAC	2	8	2439231	2439238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10627	NC_009641	ATTC	2	8	2439254	2439261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10628	NC_009641	AT	3	6	2439263	2439268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_009641	TAA	2	6	2439287	2439292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_009641	ATA	2	6	2439332	2439337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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