MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009641	ATT	2	6	2300041	2300046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_009641	AAT	2	6	2300083	2300088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_009641	TTA	2	6	2300139	2300144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_009641	ATT	2	6	2300175	2300180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_009641	TACT	2	8	2300247	2300254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10006	NC_009641	A	6	6	2300315	2300320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_009641	CTTT	2	8	2300385	2300392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_009641	A	6	6	2300441	2300446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_009641	TAAA	2	8	2300458	2300465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009641	TCT	2	6	2300504	2300509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_009641	GAA	2	6	2300510	2300515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_009641	AT	3	6	2300526	2300531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009641	AGG	2	6	2300540	2300545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_009641	GTG	2	6	2300667	2300672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_009641	GT	3	6	2300682	2300687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009641	AAC	2	6	2300786	2300791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_009641	GT	3	6	2300851	2300856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009641	ATG	2	6	2300876	2300881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_009641	TCC	2	6	2300902	2300907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_009641	ATG	2	6	2300946	2300951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_009641	CACGA	2	10	2301001	2301010	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10022	NC_009641	GAC	2	6	2301014	2301019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_009641	CAC	2	6	2301027	2301032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_009641	TTC	2	6	2301104	2301109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_009641	GCA	2	6	2301223	2301228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_009641	TCC	2	6	2301368	2301373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_009641	A	6	6	2301489	2301494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009641	CG	3	6	2301502	2301507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_009641	AAT	2	6	2301518	2301523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_009641	GCT	2	6	2301558	2301563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_009641	TTAC	2	8	2301616	2301623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_009641	TTC	2	6	2301631	2301636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_009641	TAA	2	6	2301639	2301644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_009641	TCA	2	6	2301669	2301674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_009641	CTG	2	6	2301726	2301731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_009641	TTACC	2	10	2301820	2301829	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10037	NC_009641	TAGG	2	8	2301953	2301960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009641	CCG	2	6	2301984	2301989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_009641	AAGC	2	8	2302002	2302009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_009641	CGC	2	6	2302046	2302051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_009641	ATG	2	6	2302094	2302099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_009641	AAT	2	6	2302122	2302127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_009641	ATTT	2	8	2302224	2302231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_009641	TTTA	2	8	2302262	2302269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_009641	TTC	2	6	2302321	2302326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_009641	CGT	2	6	2302341	2302346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_009641	GAC	2	6	2302351	2302356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_009641	T	6	6	2302396	2302401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_009641	CTT	2	6	2302427	2302432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_009641	AT	3	6	2302535	2302540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_009641	CAT	2	6	2303644	2303649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_009641	TAAA	2	8	2303702	2303709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_009641	A	7	7	2303707	2303713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_009641	TAT	2	6	2303724	2303729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009641	ACT	2	6	2303743	2303748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_009641	ATT	2	6	2303752	2303757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_009641	TCC	2	6	2305207	2305212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_009641	AGT	2	6	2305270	2305275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_009641	ATA	2	6	2305282	2305287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009641	AAG	2	6	2305288	2305293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_009641	ATA	2	6	2305300	2305305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009641	ATT	2	6	2305310	2305315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009641	TAA	2	6	2305380	2305385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009641	TTTAT	2	10	2305386	2305395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009641	TAT	2	6	2305457	2305462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_009641	TTC	2	6	2305466	2305471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_009641	AAG	2	6	2305483	2305488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_009641	CCT	2	6	2305999	2306004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_009641	TAA	2	6	2306008	2306013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_009641	TAT	2	6	2306048	2306053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_009641	CCT	2	6	2307444	2307449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_009641	TA	3	6	2307452	2307457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_009641	TTTA	2	8	2307458	2307465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009641	TTTA	2	8	2307472	2307479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_009641	AAT	2	6	2307482	2307487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_009641	TACAA	2	10	2307542	2307551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10077	NC_009641	TAA	2	6	2307574	2307579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_009641	A	7	7	2307578	2307584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_009641	CCT	2	6	2309510	2309515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_009641	TAA	2	6	2309533	2309538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_009641	A	6	6	2310155	2310160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_009641	ATG	2	6	2310199	2310204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_009641	A	7	7	2310507	2310513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_009641	TCAT	2	8	2310514	2310521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_009641	ATGA	2	8	2310534	2310541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_009641	T	7	7	2310542	2310548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_009641	AT	3	6	2310625	2310630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_009641	AATC	2	8	2312004	2312011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10089	NC_009641	TA	3	6	2312037	2312042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_009641	AACA	2	8	2312060	2312067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10091	NC_009641	TATG	2	8	2312099	2312106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_009641	AAT	2	6	2312117	2312122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_009641	TTA	2	6	2312128	2312133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_009641	A	6	6	2312172	2312177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_009641	T	6	6	2312211	2312216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_009641	TAT	2	6	2315260	2315265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_009641	T	6	6	2315306	2315311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_009641	TA	3	6	2315332	2315337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_009641	TAA	2	6	2315345	2315350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_009641	ATC	2	6	2315409	2315414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_009641	CAA	2	6	2315525	2315530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_009641	A	6	6	2315535	2315540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_009641	GTA	2	6	2315581	2315586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_009641	GTA	2	6	2316691	2316696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_009641	ATA	2	6	2319659	2319664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_009641	ATCATT	2	12	2319668	2319679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10107	NC_009641	ATCT	2	8	2319696	2319703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10108	NC_009641	TTA	2	6	2321725	2321730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_009641	TTA	2	6	2321757	2321762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_009641	GA	3	6	2321781	2321786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009641	ATA	2	6	2321787	2321792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_009641	ATT	2	6	2321809	2321814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009641	A	6	6	2321824	2321829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009641	A	7	7	2321851	2321857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_009641	CAG	2	6	2321858	2321863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_009641	CTG	2	6	2321894	2321899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_009641	TAC	2	6	2322006	2322011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_009641	TTTTAC	2	12	2322026	2322037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10119	NC_009641	A	6	6	2322046	2322051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_009641	AAT	2	6	2322091	2322096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_009641	TAA	2	6	2322131	2322136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_009641	ACTAA	2	10	2322142	2322151	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10123	NC_009641	ATG	2	6	2323308	2323313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_009641	TAA	2	6	2323327	2323332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_009641	GATA	2	8	2323370	2323377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_009641	TGA	2	6	2323411	2323416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_009641	TCA	2	6	2323421	2323426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_009641	T	7	7	2324371	2324377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_009641	TGA	2	6	2324393	2324398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_009641	AGTTAA	2	12	2325207	2325218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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10245	NC_009641	TA	4	8	2351401	2351408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10249	NC_009641	TA	3	6	2351506	2351511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_009641	TTC	2	6	2351541	2351546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10253	NC_009641	A	7	7	2351612	2351618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_009641	CTG	2	6	2351620	2351625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10257	NC_009641	TTAA	2	8	2353073	2353080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_009641	ATT	2	6	2353089	2353094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_009641	TAC	2	6	2353109	2353114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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