MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 chromosome

Total Repeats: 9472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009636	A	8	8	3624348	3624355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_009636	GCC	2	6	3624391	3624396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_009636	AGG	2	6	3624468	3624473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_009636	GCA	2	6	3625577	3625582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_009636	AAT	2	6	3625599	3625604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_009636	CG	3	6	3625626	3625631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_009636	ATC	2	6	3625633	3625638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_009636	TA	3	6	3625641	3625646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_009636	CCG	2	6	3625657	3625662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9010	NC_009636	CT	3	6	3625811	3625816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9011	NC_009636	GCCT	2	8	3626040	3626047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9012	NC_009636	C	6	6	3626083	3626088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9013	NC_009636	CGC	2	6	3626106	3626111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9014	NC_009636	GA	3	6	3626262	3626267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_009636	CGG	2	6	3626323	3626328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_009636	ATT	2	6	3626343	3626348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_009636	CTCG	2	8	3626389	3626396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9018	NC_009636	CTT	2	6	3626400	3626405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_009636	GAG	2	6	3626432	3626437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_009636	GCGAAG	2	12	3626532	3626543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9021	NC_009636	GAC	2	6	3626609	3626614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_009636	GGC	2	6	3626702	3626707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_009636	CGAA	2	8	3626752	3626759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_009636	CGG	2	6	3626761	3626766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_009636	CGA	2	6	3626773	3626778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_009636	ACGGC	2	10	3626817	3626826	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9027	NC_009636	GGCA	2	8	3626828	3626835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_009636	GAC	2	6	3626852	3626857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_009636	TTG	2	6	3626887	3626892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_009636	AGCG	2	8	3626904	3626911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9031	NC_009636	ACC	2	6	3626931	3626936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9032	NC_009636	CAT	2	6	3626945	3626950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_009636	GCC	2	6	3627033	3627038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_009636	GGC	2	6	3627077	3627082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_009636	CAG	2	6	3627086	3627091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_009636	CCG	2	6	3627114	3627119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_009636	CG	3	6	3627118	3627123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_009636	AGC	3	9	3627165	3627173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_009636	CGG	2	6	3627224	3627229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_009636	GAA	2	6	3627248	3627253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_009636	CGCC	2	8	3627291	3627298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9042	NC_009636	TCCTT	2	10	3627392	3627401	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9043	NC_009636	TCA	2	6	3627437	3627442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_009636	CCG	2	6	3627446	3627451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9045	NC_009636	CGA	2	6	3627519	3627524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_009636	AGC	2	6	3627553	3627558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_009636	GAC	2	6	3627633	3627638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_009636	CTG	2	6	3627648	3627653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_009636	CTC	2	6	3627850	3627855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9050	NC_009636	CTA	2	6	3627945	3627950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_009636	GTC	2	6	3629293	3629298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_009636	GTC	2	6	3631446	3631451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_009636	GCGA	2	8	3631464	3631471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9054	NC_009636	TA	3	6	3631487	3631492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_009636	CTG	3	9	3631496	3631504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_009636	AAGAC	2	10	3631532	3631541	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9057	NC_009636	GCA	2	6	3631544	3631549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_009636	CAT	2	6	3631638	3631643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_009636	TCA	2	6	3631657	3631662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_009636	GGA	2	6	3631707	3631712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_009636	GGC	2	6	3631733	3631738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_009636	CAAA	2	8	3632561	3632568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9063	NC_009636	A	6	6	3632566	3632571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_009636	CG	3	6	3632589	3632594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9065	NC_009636	GC	3	6	3634360	3634365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9066	NC_009636	TGGCTC	2	12	3634437	3634448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9070	NC_009636	AAG	2	6	3634666	3634671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_009636	GC	3	6	3634823	3634828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_009636	GC	3	6	3634838	3634843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9073	NC_009636	TCT	2	6	3634924	3634929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_009636	GCT	2	6	3634945	3634950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9077	NC_009636	GGCTT	2	10	3636401	3636410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9078	NC_009636	TGG	3	9	3636451	3636459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9082	NC_009636	CTT	2	6	3636589	3636594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_009636	GAC	2	6	3638622	3638627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9085	NC_009636	GGGA	2	8	3639027	3639034	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_009636	CGAT	2	8	3639702	3639709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9087	NC_009636	GC	4	8	3641642	3641649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9088	NC_009636	GCCT	2	8	3641666	3641673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9089	NC_009636	CGAG	3	12	3641739	3641750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9090	NC_009636	CGCC	2	8	3643567	3643574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9091	NC_009636	T	6	6	3643667	3643672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9094	NC_009636	T	7	7	3649535	3649541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_009636	CCGC	2	8	3649570	3649577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9096	NC_009636	GCAAC	2	10	3650064	3650073	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9097	NC_009636	CG	4	8	3651061	3651068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9098	NC_009636	GGC	2	6	3651082	3651087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9101	NC_009636	CCGC	2	8	3652918	3652925	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9102	NC_009636	GGC	2	6	3652950	3652955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_009636	CCTTT	2	10	3652978	3652987	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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9110	NC_009636	GCGGA	2	10	3655926	3655935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9111	NC_009636	ACG	2	6	3655991	3655996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9113	NC_009636	GA	3	6	3657187	3657192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_009636	TTC	2	6	3659307	3659312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9117	NC_009636	GCT	2	6	3660049	3660054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9119	NC_009636	TC	3	6	3660107	3660112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_009636	CAT	2	6	3660143	3660148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9122	NC_009636	TCC	2	6	3660203	3660208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_009636	TA	3	6	3660317	3660322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_009636	GCT	2	6	3661433	3661438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_009636	GCTTT	2	10	3661441	3661450	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9126	NC_009636	CT	3	6	3661457	3661462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_009636	CAG	2	6	3662325	3662330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9131	NC_009636	TGG	2	6	3662657	3662662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.