MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 chromosome

Total Repeats: 9472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009636	CGAG	2	8	3174944	3174951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_009636	TCA	2	6	3174955	3174960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_009636	CAA	2	6	3174995	3175000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_009636	CGC	2	6	3175468	3175473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_009636	CAA	2	6	3175505	3175510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_009636	GAGAG	2	10	3175526	3175535	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_009636	TAGTCT	2	12	3175558	3175569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8008	NC_009636	TGCC	2	8	3176768	3176775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8009	NC_009636	AG	3	6	3177208	3177213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_009636	CGT	2	6	3178293	3178298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_009636	GTG	2	6	3178377	3178382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_009636	GGCC	2	8	3178387	3178394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_009636	AAG	2	6	3178412	3178417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_009636	CCG	2	6	3179467	3179472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_009636	GC	4	8	3180558	3180565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_009636	GCC	2	6	3180569	3180574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_009636	GT	3	6	3180636	3180641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_009636	TTA	2	6	3180646	3180651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_009636	TAA	2	6	3180667	3180672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009636	GGCC	2	8	3180679	3180686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_009636	ATCC	2	8	3180692	3180699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_009636	CCAGA	2	10	3180730	3180739	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8023	NC_009636	ACA	2	6	3180790	3180795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_009636	CTC	2	6	3180796	3180801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_009636	TCG	2	6	3180887	3180892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_009636	CGA	2	6	3180897	3180902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_009636	CTG	2	6	3180933	3180938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_009636	GCG	2	6	3180947	3180952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_009636	CAT	2	6	3180963	3180968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_009636	TGA	2	6	3180977	3180982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_009636	TCG	2	6	3181060	3181065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_009636	CGT	2	6	3181109	3181114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_009636	TCT	2	6	3181127	3181132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_009636	CG	3	6	3181146	3181151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_009636	CAA	2	6	3181196	3181201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_009636	GGA	2	6	3181238	3181243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_009636	CCG	2	6	3181250	3181255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_009636	CGGC	2	8	3181267	3181274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_009636	CTG	2	6	3181314	3181319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_009636	TCGACC	2	12	3181333	3181344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_009636	GAA	2	6	3181374	3181379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_009636	TTC	2	6	3181455	3181460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_009636	TGC	2	6	3181501	3181506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_009636	CAT	2	6	3181517	3181522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_009636	GTC	2	6	3181551	3181556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_009636	TGG	2	6	3181573	3181578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_009636	GAG	2	6	3181611	3181616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_009636	GCTTC	2	10	3181675	3181684	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8049	NC_009636	TGC	2	6	3181686	3181691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_009636	CGG	2	6	3181706	3181711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_009636	TCC	2	6	3182538	3182543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_009636	TCC	4	12	3184827	3184838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_009636	CTC	2	6	3191118	3191123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_009636	TCC	2	6	3192098	3192103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_009636	CGG	2	6	3192105	3192110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_009636	ACG	2	6	3193319	3193324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_009636	CGG	2	6	3193389	3193394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_009636	GCG	2	6	3193554	3193559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_009636	ACGCGA	2	12	3193607	3193618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_009636	T	7	7	3193623	3193629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_009636	GTT	2	6	3193658	3193663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_009636	GCG	3	9	3193664	3193672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_009636	GAG	2	6	3194309	3194314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009636	AGA	2	6	3194315	3194320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_009636	T	6	6	3195328	3195333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_009636	CAGCCG	2	12	3195334	3195345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8067	NC_009636	CTT	2	6	3195364	3195369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_009636	T	6	6	3195392	3195397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_009636	CGA	2	6	3195418	3195423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_009636	GCC	2	6	3195430	3195435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_009636	CAT	2	6	3197617	3197622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_009636	TA	3	6	3197631	3197636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_009636	AAT	3	9	3198591	3198599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_009636	T	8	8	3198613	3198620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_009636	T	6	6	3198653	3198658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_009636	AGC	2	6	3198748	3198753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_009636	GA	3	6	3198757	3198762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_009636	ACG	2	6	3200534	3200539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_009636	T	6	6	3200609	3200614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_009636	GCT	2	6	3200769	3200774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_009636	CGG	2	6	3200832	3200837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_009636	CGG	3	9	3203544	3203552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_009636	GGC	2	6	3203569	3203574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_009636	TGC	2	6	3204333	3204338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_009636	ACA	2	6	3204357	3204362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_009636	GGC	2	6	3204408	3204413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_009636	GCC	2	6	3205329	3205334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_009636	AT	3	6	3206708	3206713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_009636	CGC	2	6	3206731	3206736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8090	NC_009636	CGCT	2	8	3207336	3207343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_009636	CTC	2	6	3207348	3207353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_009636	GTC	2	6	3207373	3207378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_009636	ATG	2	6	3207379	3207384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_009636	CGGG	2	8	3207386	3207393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_009636	CTC	2	6	3207961	3207966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_009636	A	7	7	3208018	3208024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_009636	GCC	2	6	3208025	3208030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_009636	GGC	2	6	3208037	3208042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_009636	GGC	2	6	3209525	3209530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_009636	CTG	2	6	3209538	3209543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_009636	CG	3	6	3209707	3209712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_009636	AGG	3	9	3209731	3209739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_009636	TTA	2	6	3209786	3209791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_009636	GCG	2	6	3212819	3212824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_009636	CCG	2	6	3212922	3212927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_009636	GGCA	2	8	3213642	3213649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_009636	GCG	2	6	3215478	3215483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_009636	CAA	2	6	3215490	3215495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_009636	TCC	2	6	3216498	3216503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_009636	TTGG	2	8	3216509	3216516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_009636	G	6	6	3216593	3216598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_009636	AATC	2	8	3216603	3216610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8113	NC_009636	CGGT	2	8	3216638	3216645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8114	NC_009636	CGG	2	6	3216676	3216681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_009636	AGC	2	6	3217952	3217957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_009636	CG	3	6	3218023	3218028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_009636	GCG	2	6	3218082	3218087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_009636	GCGGCA	2	12	3218105	3218116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_009636	GAC	2	6	3218157	3218162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_009636	GGCC	2	8	3218177	3218184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_009636	TCG	2	6	3218207	3218212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_009636	GCC	2	6	3218840	3218845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8123	NC_009636	CCGGT	2	10	3218922	3218931	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8124	NC_009636	GCC	2	6	3218951	3218956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_009636	CCT	2	6	3218962	3218967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8126	NC_009636	CGGG	2	8	3219004	3219011	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_009636	GAC	2	6	3219026	3219031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_009636	CG	3	6	3219034	3219039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_009636	GC	3	6	3219048	3219053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8130	NC_009636	GCC	2	6	3219058	3219063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8253	NC_009636	GC	3	6	3265463	3265468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8258	NC_009636	A	6	6	3265624	3265629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_009636	GCC	2	6	3265640	3265645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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