MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009632	AT	3	6	2696801	2696806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_009632	TGA	2	6	2696814	2696819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_009632	TGA	2	6	2696875	2696880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_009632	TCC	2	6	2697695	2697700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_009632	GTC	2	6	2697715	2697720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_009632	AT	3	6	2697801	2697806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_009632	AT	3	6	2697878	2697883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_009632	A	6	6	2697943	2697948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_009632	TAA	2	6	2697976	2697981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_009632	A	6	6	2699387	2699392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_009632	TAT	2	6	2699419	2699424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_009632	CCA	2	6	2699440	2699445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_009632	CGT	2	6	2699452	2699457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_009632	CAAA	2	8	2699474	2699481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11515	NC_009632	A	7	7	2699479	2699485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_009632	AT	3	6	2699517	2699522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_009632	ATTA	2	8	2700222	2700229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_009632	TAT	2	6	2700257	2700262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_009632	AT	3	6	2700274	2700279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_009632	TAA	2	6	2700332	2700337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_009632	ATT	2	6	2700351	2700356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_009632	ATA	2	6	2700864	2700869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_009632	TAACA	2	10	2700897	2700906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11524	NC_009632	T	6	6	2700956	2700961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_009632	ATC	2	6	2701163	2701168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11527	NC_009632	ATCT	2	8	2701277	2701284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11528	NC_009632	CAGA	2	8	2701298	2701305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_009632	CTT	2	6	2701308	2701313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_009632	T	6	6	2701312	2701317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_009632	CT	4	8	2703992	2703999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_009632	TTTAT	2	10	2704003	2704012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_009632	ATCAA	2	10	2704069	2704078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11534	NC_009632	ACT	2	6	2704137	2704142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11536	NC_009632	TG	3	6	2704196	2704201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_009632	T	6	6	2704206	2704211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_009632	T	6	6	2704218	2704223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_009632	TATT	2	8	2704286	2704293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_009632	TTTTGT	2	12	2704294	2704305	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_009632	TTA	2	6	2704345	2704350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_009632	AT	3	6	2704354	2704359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_009632	ATT	2	6	2704386	2704391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_009632	ATG	2	6	2704410	2704415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_009632	T	7	7	2704440	2704446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_009632	CATT	2	8	2704753	2704760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_009632	TATC	2	8	2704778	2704785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11548	NC_009632	GAT	2	6	2704806	2704811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_009632	T	7	7	2704811	2704817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_009632	AAC	2	6	2705890	2705895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_009632	T	6	6	2705923	2705928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_009632	GTC	2	6	2706903	2706908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11556	NC_009632	TTA	2	6	2706958	2706963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_009632	ATG	2	6	2706991	2706996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_009632	CTT	2	6	2707387	2707392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_009632	ATTT	2	8	2707875	2707882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_009632	TTA	2	6	2707883	2707888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_009632	TTA	2	6	2707920	2707925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_009632	TTA	2	6	2708041	2708046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_009632	TCA	2	6	2708047	2708052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11565	NC_009632	CAT	2	6	2708067	2708072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_009632	TTCA	2	8	2708174	2708181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11567	NC_009632	A	7	7	2710313	2710319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_009632	AACA	2	8	2710329	2710336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11570	NC_009632	TAT	2	6	2710412	2710417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11572	NC_009632	ATC	2	6	2710460	2710465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11574	NC_009632	TTG	2	6	2710515	2710520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_009632	TTCAA	2	10	2710545	2710554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11576	NC_009632	TAT	2	6	2713486	2713491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11578	NC_009632	CT	3	6	2713560	2713565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11579	NC_009632	A	7	7	2713586	2713592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_009632	TCA	2	6	2713596	2713601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11583	NC_009632	TTA	2	6	2713645	2713650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_009632	CAT	2	6	2714538	2714543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11586	NC_009632	TAT	2	6	2714660	2714665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_009632	GAGGT	2	10	2714690	2714699	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_009632	CAT	2	6	2714940	2714945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11590	NC_009632	CTTTT	2	10	2715045	2715054	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11591	NC_009632	AATT	2	8	2715123	2715130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11597	NC_009632	A	7	7	2715284	2715290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_009632	A	6	6	2715743	2715748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_009632	T	6	6	2715800	2715805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_009632	GACT	2	8	2715837	2715844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11601	NC_009632	T	6	6	2717183	2717188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_009632	ACT	2	6	2717201	2717206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11604	NC_009632	TGATA	2	10	2717361	2717370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_009632	CAG	2	6	2718616	2718621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11608	NC_009632	ATT	2	6	2718710	2718715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_009632	T	6	6	2719328	2719333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_009632	ATAA	2	8	2719338	2719345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_009632	GTC	2	6	2719346	2719351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_009632	TA	3	6	2719359	2719364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_009632	TGC	2	6	2719389	2719394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_009632	TAC	2	6	2719414	2719419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_009632	TTAAA	2	10	2719452	2719461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_009632	TTA	2	6	2719492	2719497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_009632	TTA	2	6	2719511	2719516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_009632	AC	3	6	2719523	2719528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_009632	TAT	2	6	2719568	2719573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_009632	CAATTG	2	12	2719587	2719598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11621	NC_009632	TA	3	6	2719599	2719604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_009632	T	6	6	2719633	2719638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_009632	A	7	7	2719648	2719654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_009632	T	7	7	2721837	2721843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_009632	ATA	2	6	2724286	2724291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_009632	TTTA	2	8	2724341	2724348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_009632	AAT	2	6	2724349	2724354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_009632	A	6	6	2724416	2724421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_009632	CCT	2	6	2726977	2726982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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