MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009632	TA	3	6	2579049	2579054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_009632	ACATA	2	10	2579082	2579091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11003	NC_009632	CAT	2	6	2579101	2579106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_009632	ATT	2	6	2579193	2579198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_009632	A	6	6	2580187	2580192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_009632	T	6	6	2580222	2580227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_009632	ATTAA	2	10	2580252	2580261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_009632	TAA	3	9	2580280	2580288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_009632	ATA	2	6	2580337	2580342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_009632	TAAA	2	8	2580370	2580377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_009632	TAA	2	6	2580389	2580394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_009632	TCA	2	6	2580416	2580421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_009632	ATTA	2	8	2580457	2580464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_009632	CAA	2	6	2580519	2580524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_009632	TTA	2	6	2580535	2580540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_009632	CAAA	2	8	2580575	2580582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11017	NC_009632	A	6	6	2580580	2580585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_009632	A	7	7	2580627	2580633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_009632	TAA	2	6	2580670	2580675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_009632	AT	3	6	2580684	2580689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_009632	TAT	3	9	2580687	2580695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_009632	TTAA	2	8	2580696	2580703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_009632	TAAA	2	8	2580706	2580713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_009632	AGAA	2	8	2580719	2580726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_009632	GAC	2	6	2582695	2582700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11030	NC_009632	ATT	2	6	2588241	2588246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11035	NC_009632	TATC	2	8	2588422	2588429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11036	NC_009632	TAT	2	6	2588467	2588472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11039	NC_009632	TAT	2	6	2592041	2592046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11041	NC_009632	ATA	2	6	2592068	2592073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_009632	TTA	2	6	2592103	2592108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_009632	CAT	2	6	2592115	2592120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_009632	AT	3	6	2592119	2592124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_009632	TAT	2	6	2592225	2592230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_009632	ATT	2	6	2592324	2592329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_009632	ATT	2	6	2592481	2592486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_009632	ATTT	2	8	2592680	2592687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_009632	CTC	2	6	2593333	2593338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_009632	AT	3	6	2593348	2593353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_009632	CTTCA	2	10	2593399	2593408	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11052	NC_009632	TA	3	6	2593549	2593554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_009632	ACA	2	6	2593566	2593571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_009632	ATC	2	6	2594746	2594751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_009632	TAT	2	6	2594757	2594762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11057	NC_009632	TGA	2	6	2595520	2595525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_009632	T	6	6	2595545	2595550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_009632	TACA	2	8	2595571	2595578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11060	NC_009632	AC	3	6	2595582	2595587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11061	NC_009632	TA	3	6	2595594	2595599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_009632	TA	3	6	2595603	2595608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_009632	ATCT	2	8	2596879	2596886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11064	NC_009632	TTC	2	6	2596896	2596901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_009632	TA	3	6	2597508	2597513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_009632	GT	3	6	2598229	2598234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_009632	TTAT	2	8	2599111	2599118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009632	AT	4	8	2599137	2599144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11072	NC_009632	A	7	7	2599265	2599271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_009632	TTA	2	6	2599280	2599285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11075	NC_009632	T	6	6	2599333	2599338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11078	NC_009632	AT	3	6	2600846	2600851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_009632	GAG	2	6	2600901	2600906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11087	NC_009632	T	6	6	2605043	2605048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11089	NC_009632	TAAT	2	8	2605108	2605115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_009632	TAA	2	6	2605135	2605140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_009632	GTC	2	6	2607740	2607745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11097	NC_009632	CTG	2	6	2607863	2607868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11099	NC_009632	TAA	2	6	2607894	2607899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_009632	GTT	3	9	2608910	2608918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_009632	TAC	2	6	2608930	2608935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_009632	CA	3	6	2608979	2608984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_009632	AC	3	6	2609006	2609011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_009632	GT	3	6	2609042	2609047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_009632	ACTT	2	8	2609055	2609062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11106	NC_009632	ATA	2	6	2609090	2609095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11108	NC_009632	AT	3	6	2610563	2610568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_009632	TAAA	2	8	2610602	2610609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_009632	T	6	6	2610618	2610623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_009632	AAT	2	6	2610635	2610640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_009632	ATA	2	6	2610669	2610674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_009632	ATT	2	6	2610731	2610736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_009632	T	6	6	2610758	2610763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_009632	TCT	2	6	2610799	2610804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_009632	CCT	2	6	2612454	2612459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_009632	TCCT	2	8	2614330	2614337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_009632	A	6	6	2614341	2614346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_009632	ATAAA	2	10	2614364	2614373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_009632	CAT	2	6	2614427	2614432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11122	NC_009632	TTTG	2	8	2614525	2614532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_009632	ATG	2	6	2614573	2614578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11125	NC_009632	ATT	3	9	2614588	2614596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_009632	T	6	6	2614628	2614633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_009632	TCA	2	6	2614804	2614809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_009632	GACA	2	8	2614893	2614900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11129	NC_009632	A	7	7	2614906	2614912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_009632	CAAC	2	8	2614913	2614920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11131	NC_009632	GTT	2	6	2614935	2614940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_009632	TGT	3	9	2614956	2614964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_009632	TCA	2	6	2615592	2615597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11134	NC_009632	TAT	2	6	2615626	2615631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11135	NC_009632	AT	3	6	2615630	2615635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11137	NC_009632	A	6	6	2615683	2615688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11138	NC_009632	TAT	3	9	2615699	2615707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11142	NC_009632	AC	5	10	2617440	2617449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11260	NC_009632	TTAT	2	8	2646139	2646146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11262	NC_009632	TC	4	8	2646160	2646167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11263	NC_009632	TATT	2	8	2646168	2646175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11398	NC_009632	AT	3	6	2674089	2674094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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