MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009632	AATA	2	8	92379	92386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009632	ATA	2	6	92395	92400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009632	A	6	6	92415	92420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009632	ATT	2	6	92436	92441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009632	A	6	6	92461	92466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009632	GTT	2	6	92527	92532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009632	AGCA	2	8	92613	92620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_009632	TGA	2	6	92635	92640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009632	TAT	2	6	92671	92676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009632	AGA	2	6	92680	92685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009632	AATT	2	8	92746	92753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009632	TGA	2	6	92773	92778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009632	AC	3	6	92807	92812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_009632	GAT	2	6	92878	92883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009632	AGA	2	6	92929	92934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009632	T	6	6	92960	92965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009632	GAA	2	6	93016	93021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009632	ATG	2	6	93036	93041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009632	AAAG	2	8	93064	93071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009632	ATT	2	6	93076	93081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009632	TTC	2	6	93146	93151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_009632	CCAA	2	8	93183	93190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_009632	AGA	2	6	93217	93222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009632	CAA	2	6	93338	93343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009632	CCA	2	6	93398	93403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_009632	ACT	2	6	93416	93421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_009632	TTA	2	6	93422	93427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009632	AT	3	6	93432	93437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009632	TAG	2	6	93447	93452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009632	CTAAA	2	10	93474	93483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_009632	CAAAA	2	10	93505	93514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_009632	GAT	2	6	93527	93532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009632	TACT	2	8	93542	93549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_009632	TAA	2	6	93592	93597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009632	AT	3	6	93612	93617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009632	GAA	2	6	93638	93643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009632	TAC	2	6	93861	93866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009632	AAT	2	6	93875	93880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009632	AGA	2	6	93932	93937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009632	AGA	2	6	93962	93967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009632	ATG	2	6	93982	93987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009632	TTA	2	6	94027	94032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009632	A	6	6	94039	94044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009632	GAA	2	6	94053	94058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009632	AGA	2	6	94106	94111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009632	AATT	2	8	94124	94131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009632	TTAA	2	8	94164	94171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009632	AAAG	2	8	94179	94186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009632	CAA	2	6	94187	94192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009632	TTA	2	6	94198	94203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009632	AGA	3	9	94229	94237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009632	ATA	2	6	94255	94260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009632	CAA	2	6	94269	94274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009632	TTA	2	6	94275	94280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009632	ACA	2	6	94283	94288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009632	GTTAGA	2	12	94289	94300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009632	A	8	8	94308	94315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009632	AAAAGA	2	12	94343	94354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009632	ATTA	2	8	94358	94365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009632	ACA	2	6	94480	94485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009632	ATG	2	6	94489	94494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009632	ATT	3	9	94580	94588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009632	TAA	2	6	94595	94600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009632	TATT	2	8	94607	94614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009632	AATT	2	8	94645	94652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009632	AGT	2	6	94709	94714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009632	ACG	2	6	94719	94724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009632	TATG	2	8	94742	94749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009632	ACT	2	6	94774	94779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009632	TATT	2	8	94780	94787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009632	AGC	2	6	94814	94819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009632	A	7	7	94841	94847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009632	AAG	2	6	94957	94962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009632	CAAT	2	8	94991	94998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_009632	A	6	6	95035	95040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009632	TAA	3	9	95117	95125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009632	AGT	2	6	95228	95233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009632	ATT	2	6	95237	95242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009632	TGA	2	6	95246	95251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009632	AAGG	2	8	95268	95275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009632	CAG	2	6	95314	95319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009632	CAA	2	6	95349	95354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009632	ATA	2	6	95476	95481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009632	AAGA	2	8	95550	95557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009632	AAAG	2	8	95619	95626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009632	A	6	6	95645	95650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009632	TA	3	6	95652	95657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009632	AGCT	2	8	96202	96209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_009632	T	6	6	96212	96217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009632	TA	3	6	96222	96227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009632	AAT	2	6	96265	96270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009632	TAAT	2	8	96276	96283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009632	A	6	6	96336	96341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009632	TAAT	2	8	96348	96355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009632	AGAA	2	8	96367	96374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009632	AAT	2	6	97377	97382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009632	ATT	2	6	97418	97423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009632	ACT	2	6	97427	97432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009632	TAA	2	6	97454	97459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009632	CAA	2	6	97462	97467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_009632	TAT	2	6	97468	97473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009632	TTGT	2	8	97486	97493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009632	ATA	2	6	97504	97509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009632	AT	3	6	97540	97545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009632	AACAAA	2	12	97552	97563	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
606	NC_009632	AGA	2	6	97575	97580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009632	TAA	2	6	100026	100031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009632	AGA	2	6	100067	100072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009632	AATC	2	8	100876	100883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_009632	ATA	3	9	100892	100900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009632	AAT	2	6	101738	101743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009632	T	6	6	104063	104068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009632	A	6	6	104089	104094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009632	TGT	2	6	104112	104117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009632	ATAA	2	8	104125	104132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009632	ATG	2	6	104146	104151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009632	AATATA	2	12	106853	106864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009632	ATT	2	6	107081	107086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009632	ATA	2	6	107113	107118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009632	A	6	6	107132	107137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009632	A	6	6	107192	107197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009632	ATAA	2	8	107205	107212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009632	ATT	2	6	108965	108970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009632	AT	3	6	108976	108981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009632	TTA	2	6	109015	109020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009632	ATG	2	6	109071	109076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009632	CAAT	2	8	109077	109084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_009632	TCA	2	6	109099	109104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_009632	A	7	7	109104	109110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009632	CCA	2	6	110988	110993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_009632	ATC	2	6	112036	112041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_009632	A	6	6	112069	112074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009632	AGGG	2	8	112131	112138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009632	AGA	2	6	112139	112144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009632	AAT	2	6	112185	112190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009632	AAT	2	6	113549	113554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009632	GTAAT	2	10	113665	113674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009632	AAAG	2	8	113713	113720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_009632	ATG	2	6	114219	114224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009632	ATT	2	6	114248	114253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_009632	ATAA	2	8	114254	114261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_009632	AT	3	6	114286	114291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_009632	TATT	2	8	114292	114299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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