MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009632	T	6	6	2186255	2186260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_009632	AATTA	2	10	2186269	2186278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_009632	GCA	2	6	2186316	2186321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_009632	TGA	2	6	2186329	2186334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_009632	GT	3	6	2186396	2186401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_009632	AAC	2	6	2186419	2186424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_009632	ATTTA	2	10	2186490	2186499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_009632	ATT	2	6	2186504	2186509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_009632	TTA	2	6	2186510	2186515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_009632	TTAAA	2	10	2186612	2186621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_009632	GTTT	2	8	2186690	2186697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_009632	ACT	2	6	2186716	2186721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_009632	TA	4	8	2186744	2186751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_009632	CTTT	2	8	2186752	2186759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9015	NC_009632	TCA	2	6	2186761	2186766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_009632	ATT	2	6	2186772	2186777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_009632	A	6	6	2186815	2186820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_009632	TAAA	2	8	2186834	2186841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_009632	TAT	2	6	2186867	2186872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_009632	T	7	7	2186887	2186893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_009632	TAA	2	6	2186963	2186968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_009632	TGT	2	6	2186979	2186984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_009632	AAG	2	6	2187038	2187043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_009632	TAA	2	6	2187087	2187092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_009632	ATTAA	2	10	2187235	2187244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_009632	AAGT	2	8	2187350	2187357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_009632	TAT	2	6	2187399	2187404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_009632	TGA	2	6	2187438	2187443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_009632	TGA	2	6	2187513	2187518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_009632	CTA	2	6	2187557	2187562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_009632	TTA	2	6	2187628	2187633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_009632	ATT	2	6	2187676	2187681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_009632	AAC	2	6	2187682	2187687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_009632	ATA	2	6	2188430	2188435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_009632	TTG	2	6	2188468	2188473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_009632	TAA	2	6	2188527	2188532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_009632	A	6	6	2188558	2188563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_009632	CCTATT	2	12	2188586	2188597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_009632	ATAA	2	8	2188687	2188694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_009632	A	6	6	2188735	2188740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_009632	TCC	2	6	2191248	2191253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_009632	TAT	2	6	2191287	2191292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_009632	A	6	6	2191369	2191374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_009632	ATT	2	6	2192349	2192354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_009632	ATA	2	6	2192398	2192403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_009632	CTT	2	6	2192410	2192415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_009632	AT	3	6	2192509	2192514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_009632	A	6	6	2193893	2193898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_009632	ACT	2	6	2193900	2193905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_009632	ATT	2	6	2194200	2194205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_009632	CAT	2	6	2194237	2194242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_009632	ATA	2	6	2194247	2194252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_009632	GTAT	2	8	2195368	2195375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_009632	TGA	2	6	2195382	2195387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_009632	TATAT	2	10	2195428	2195437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_009632	AAGG	2	8	2195444	2195451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_009632	ATTA	2	8	2195454	2195461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_009632	TCA	2	6	2195466	2195471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_009632	CTATA	2	10	2195500	2195509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9060	NC_009632	CAACA	2	10	2195515	2195524	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9061	NC_009632	TAAT	2	8	2195591	2195598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_009632	TCC	2	6	2196285	2196290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_009632	TGAA	2	8	2196299	2196306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_009632	ATT	2	6	2196348	2196353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_009632	A	6	6	2196354	2196359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_009632	AAT	2	6	2196362	2196367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_009632	ATT	2	6	2196397	2196402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9069	NC_009632	TTA	2	6	2196458	2196463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9071	NC_009632	T	6	6	2196480	2196485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_009632	TAA	2	6	2196493	2196498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_009632	T	7	7	2198502	2198508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_009632	T	8	8	2198520	2198527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_009632	ATT	2	6	2198605	2198610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_009632	TTG	2	6	2198686	2198691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9081	NC_009632	ATCA	2	8	2200444	2200451	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9089	NC_009632	TTG	2	6	2203471	2203476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9096	NC_009632	T	7	7	2203731	2203737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_009632	TTA	2	6	2203764	2203769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9100	NC_009632	GCT	2	6	2207603	2207608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9102	NC_009632	ATT	2	6	2207670	2207675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9110	NC_009632	GCTT	2	8	2214831	2214838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9113	NC_009632	A	7	7	2214981	2214987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_009632	TCG	2	6	2215052	2215057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_009632	GCTT	2	8	2215087	2215094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9116	NC_009632	CTA	2	6	2215132	2215137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_009632	TCTT	2	8	2215197	2215204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9118	NC_009632	A	8	8	2215237	2215244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_009632	CCT	2	6	2215358	2215363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9120	NC_009632	AGTA	2	8	2215414	2215421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_009632	ATTT	2	8	2215445	2215452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_009632	TCGA	2	8	2215464	2215471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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9125	NC_009632	CA	3	6	2215617	2215622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9128	NC_009632	ACG	2	6	2215752	2215757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_009632	ACC	2	6	2215947	2215952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9130	NC_009632	ATGA	2	8	2216029	2216036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_009632	AGG	2	6	2216083	2216088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9133	NC_009632	GTG	2	6	2216139	2216144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9134	NC_009632	GTA	2	6	2216171	2216176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9252	NC_009632	CCT	2	6	2227054	2227059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9263	NC_009632	ATG	2	6	2232306	2232311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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