MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009632	AC	3	6	2004011	2004016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_009632	CTC	2	6	2004053	2004058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_009632	AAT	2	6	2004059	2004064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_009632	TAA	2	6	2004072	2004077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009632	A	7	7	2004076	2004082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_009632	CCG	2	6	2004140	2004145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_009632	AAT	3	9	2004258	2004266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_009632	AAT	2	6	2004271	2004276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_009632	GGC	2	6	2004368	2004373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_009632	CAC	2	6	2004429	2004434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_009632	TAA	3	9	2004534	2004542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_009632	CAGG	2	8	2004585	2004592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_009632	ATTAA	2	10	2004620	2004629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_009632	ACC	2	6	2004659	2004664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_009632	CGA	2	6	2004684	2004689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_009632	ATT	2	6	2004719	2004724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_009632	TAAT	2	8	2004735	2004742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_009632	T	6	6	2004774	2004779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_009632	AATTT	2	10	2004780	2004789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009632	ATT	2	6	2004794	2004799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_009632	AAT	2	6	2004805	2004810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_009632	T	6	6	2004899	2004904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_009632	A	7	7	2004909	2004915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_009632	CTT	3	9	2004918	2004926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_009632	TATAA	2	10	2004933	2004942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_009632	AC	3	6	2005078	2005083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_009632	TC	3	6	2005674	2005679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_009632	TAC	2	6	2005689	2005694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_009632	A	7	7	2005710	2005716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_009632	TAAAA	2	10	2005737	2005746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_009632	TCA	2	6	2005803	2005808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_009632	AAT	2	6	2005863	2005868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_009632	CCA	2	6	2005903	2005908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_009632	TA	3	6	2005910	2005915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_009632	TCA	2	6	2005935	2005940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_009632	ACACCA	2	12	2005966	2005977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_009632	CAA	2	6	2005980	2005985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_009632	CTT	2	6	2007403	2007408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_009632	ATA	2	6	2008341	2008346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_009632	CCTT	2	8	2008347	2008354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_009632	CCT	2	6	2009439	2009444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_009632	TAT	2	6	2009467	2009472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_009632	TTCG	2	8	2009484	2009491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_009632	AATA	2	8	2009499	2009506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_009632	TATT	2	8	2009539	2009546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_009632	TAAATT	2	12	2009548	2009559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_009632	ATT	2	6	2009569	2009574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_009632	ATT	2	6	2009628	2009633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_009632	ATC	2	6	2009655	2009660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_009632	TAA	2	6	2009664	2009669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009632	GAA	2	6	2010204	2010209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_009632	ACA	2	6	2010297	2010302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_009632	AATG	2	8	2012374	2012381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_009632	GAG	2	6	2012964	2012969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_009632	ACGTT	2	10	2013344	2013353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8056	NC_009632	TTA	2	6	2013371	2013376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009632	ATTT	2	8	2013387	2013394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_009632	T	7	7	2013392	2013398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_009632	T	6	6	2013456	2013461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_009632	ATTG	2	8	2013540	2013547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_009632	ACAA	2	8	2013615	2013622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_009632	TA	3	6	2013652	2013657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_009632	ATT	2	6	2013685	2013690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009632	TATT	2	8	2013698	2013705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_009632	T	6	6	2013788	2013793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_009632	ATT	2	6	2013796	2013801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_009632	AAG	2	6	2013859	2013864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_009632	TTCTAC	2	12	2013891	2013902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_009632	TCAAA	2	10	2013945	2013954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8070	NC_009632	TCT	2	6	2013973	2013978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_009632	TA	3	6	2013979	2013984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_009632	TTC	2	6	2013989	2013994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_009632	AGTT	2	8	2014030	2014037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_009632	AAT	2	6	2014638	2014643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_009632	TTA	2	6	2014656	2014661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_009632	TA	3	6	2014699	2014704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_009632	T	7	7	2014712	2014718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_009632	TCA	2	6	2014723	2014728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_009632	ATTG	2	8	2014773	2014780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_009632	ATA	2	6	2014784	2014789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_009632	GAT	2	6	2014810	2014815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_009632	T	6	6	2015850	2015855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_009632	TTAA	2	8	2020997	2021004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_009632	TTA	2	6	2021096	2021101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_009632	A	6	6	2021128	2021133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_009632	TTA	2	6	2021134	2021139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_009632	AAT	2	6	2021147	2021152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_009632	TATT	2	8	2021181	2021188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_009632	TAT	2	6	2021197	2021202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_009632	TTC	2	6	2021203	2021208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_009632	ATA	2	6	2021217	2021222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_009632	TCG	2	6	2021232	2021237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_009632	GCGT	2	8	2021290	2021297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8094	NC_009632	T	7	7	2021301	2021307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_009632	CTA	2	6	2021394	2021399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_009632	TAT	2	6	2021546	2021551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_009632	CGT	2	6	2021722	2021727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_009632	TAG	2	6	2021756	2021761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_009632	AG	3	6	2021800	2021805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_009632	A	7	7	2021830	2021836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_009632	ATT	2	6	2021898	2021903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_009632	TGT	2	6	2022271	2022276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_009632	TTA	2	6	2022282	2022287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_009632	ACA	2	6	2023466	2023471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_009632	TATTTT	2	12	2023491	2023502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_009632	T	6	6	2023499	2023504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_009632	TAT	2	6	2023537	2023542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_009632	TACA	2	8	2023548	2023555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_009632	GT	3	6	2023584	2023589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_009632	TAT	2	6	2023601	2023606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_009632	TTC	2	6	2023609	2023614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_009632	TGG	2	6	2023623	2023628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_009632	T	7	7	2023647	2023653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_009632	CCAAAC	2	12	2023694	2023705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_009632	TA	3	6	2025090	2025095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_009632	CAC	2	6	2025098	2025103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_009632	TGG	2	6	2025107	2025112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_009632	TAT	2	6	2025121	2025126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_009632	TTA	2	6	2025127	2025132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_009632	TA	3	6	2025137	2025142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_009632	AAT	2	6	2025663	2025668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_009632	AT	3	6	2025700	2025705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_009632	TAA	2	6	2025709	2025714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_009632	CAA	2	6	2025760	2025765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_009632	TAA	2	6	2025884	2025889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_009632	A	6	6	2025903	2025908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_009632	TCA	2	6	2025910	2025915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_009632	TAT	2	6	2027758	2027763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_009632	TTA	2	6	2027772	2027777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_009632	TGATA	2	10	2027854	2027863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_009632	AGG	2	6	2027875	2027880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_009632	T	6	6	2028800	2028805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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