MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009621	CGC	2	6	605504	605509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2002	NC_009621	ATC	2	6	605576	605581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_009621	GGT	2	6	605698	605703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_009621	TCC	2	6	605737	605742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_009621	CTA	2	6	605775	605780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_009621	GGGC	2	8	605873	605880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_009621	CCAT	2	8	605935	605942	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_009621	CTT	2	6	605950	605955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_009621	CGG	2	6	606058	606063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_009621	GGT	2	6	606110	606115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_009621	CGG	2	6	606143	606148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_009621	GCG	2	6	606235	606240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_009621	ACG	2	6	606369	606374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_009621	GCA	2	6	606423	606428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_009621	CAA	2	6	606436	606441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_009621	CGT	2	6	607919	607924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_009621	GCA	2	6	607940	607945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_009621	CCG	2	6	609347	609352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_009621	AT	3	6	609353	609358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_009621	CCG	2	6	609449	609454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2021	NC_009621	TCT	2	6	609514	609519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_009621	CCG	2	6	609710	609715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_009621	GT	3	6	609750	609755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_009621	GAC	2	6	609775	609780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_009621	CGG	2	6	609827	609832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_009621	CTT	2	6	609860	609865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_009621	CAC	2	6	609894	609899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2028	NC_009621	GC	4	8	610054	610061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2029	NC_009621	TGAA	2	8	610071	610078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_009621	CGA	2	6	610087	610092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_009621	CG	3	6	610123	610128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2032	NC_009621	TTG	2	6	610225	610230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_009621	ACG	3	9	610235	610243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_009621	TGG	2	6	610257	610262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_009621	GAG	2	6	610281	610286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_009621	GC	4	8	610308	610315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_009621	CAA	2	6	610375	610380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_009621	GGT	2	6	610465	610470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_009621	TCT	2	6	610480	610485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_009621	GGAT	2	8	610515	610522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_009621	AAGCGA	2	12	610558	610569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2042	NC_009621	TCA	2	6	610570	610575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_009621	GCC	3	9	610577	610585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2044	NC_009621	GAT	2	6	610710	610715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_009621	CGAA	2	8	610762	610769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2046	NC_009621	TCC	2	6	610789	610794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2047	NC_009621	CCAT	2	8	610831	610838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_009621	TGA	2	6	611325	611330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_009621	CTT	2	6	611331	611336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_009621	TCC	2	6	611354	611359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_009621	CGA	2	6	611439	611444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_009621	AGG	2	6	611486	611491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_009621	CA	3	6	611504	611509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_009621	CCT	2	6	611528	611533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_009621	TGC	2	6	611554	611559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_009621	CAC	2	6	612664	612669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_009621	CGG	2	6	612713	612718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_009621	TAT	2	6	612821	612826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_009621	CGCA	2	8	612857	612864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2060	NC_009621	ATG	2	6	612871	612876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_009621	AGC	2	6	612920	612925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_009621	TA	3	6	612928	612933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_009621	CG	3	6	612978	612983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_009621	TTG	2	6	619453	619458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_009621	TTCG	2	8	620550	620557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2066	NC_009621	CTT	2	6	620565	620570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_009621	AAAT	2	8	620689	620696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_009621	ATC	2	6	620731	620736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_009621	CGGC	2	8	625799	625806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2070	NC_009621	CGGC	2	8	625809	625816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2071	NC_009621	CAG	2	6	625885	625890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_009621	CGC	2	6	625892	625897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2073	NC_009621	GAG	2	6	625915	625920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_009621	GCC	2	6	625933	625938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2075	NC_009621	GAA	2	6	626059	626064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_009621	AGT	2	6	626112	626117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_009621	GCC	2	6	626123	626128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2078	NC_009621	GCC	2	6	626160	626165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2079	NC_009621	GC	3	6	626166	626171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2080	NC_009621	TCA	2	6	626276	626281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2081	NC_009621	CGAG	2	8	626290	626297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2082	NC_009621	TGGG	2	8	626336	626343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_009621	TGCCG	2	10	626373	626382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2084	NC_009621	CG	3	6	626431	626436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2088	NC_009621	TCG	2	6	626638	626643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2089	NC_009621	CGC	2	6	626665	626670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2090	NC_009621	CGA	2	6	626686	626691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_009621	CAG	2	6	626739	626744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_009621	GCC	2	6	626758	626763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2093	NC_009621	GGCG	2	8	626773	626780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2094	NC_009621	CGA	2	6	626802	626807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_009621	GCG	2	6	626814	626819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_009621	CGG	2	6	626828	626833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_009621	TCC	2	6	626908	626913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_009621	AGT	2	6	626960	626965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_009621	GTC	2	6	627007	627012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2101	NC_009621	GCTT	2	8	627030	627037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2102	NC_009621	GCG	2	6	627202	627207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_009621	ACG	2	6	627223	627228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_009621	CGG	2	6	627260	627265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_009621	CGC	2	6	627378	627383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2106	NC_009621	CCG	2	6	627394	627399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2107	NC_009621	CTT	2	6	627506	627511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_009621	CCG	2	6	627597	627602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2109	NC_009621	TGA	2	6	627604	627609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2111	NC_009621	CAGG	2	8	627683	627690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2112	NC_009621	AGC	2	6	627701	627706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_009621	CG	3	6	627717	627722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_009621	GTT	2	6	627752	627757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_009621	CGC	2	6	627803	627808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2116	NC_009621	CCG	2	6	627811	627816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2117	NC_009621	AAGC	2	8	627937	627944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2118	NC_009621	CGG	2	6	627979	627984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_009621	GGAT	2	8	627991	627998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_009621	TCC	2	6	628028	628033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2121	NC_009621	GTC	2	6	628048	628053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_009621	T	6	6	628112	628117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_009621	TCTA	2	8	628147	628154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2124	NC_009621	TAG	2	6	628161	628166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_009621	TA	3	6	628171	628176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_009621	TCG	2	6	629899	629904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_009621	GCGG	2	8	629921	629928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2128	NC_009621	TTC	2	6	629947	629952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_009621	TCT	2	6	629957	629962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_009621	CAC	2	6	631220	631225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2131	NC_009621	TGG	2	6	631229	631234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_009621	ACA	2	6	631251	631256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_009621	AC	3	6	631279	631284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_009621	AGG	2	6	631298	631303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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