MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT01

Total Repeats: 993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009507	GC	3	6	393	398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009507	GGA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009507	TCG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009507	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009507	CAGC	2	8	495	502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009507	AGC	3	9	500	508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009507	CATCCC	2	12	509	520	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009507	TCA	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009507	GGC	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009507	CG	3	6	591	596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009507	TATG	2	8	614	621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009507	CA	3	6	636	641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009507	CCG	2	6	683	688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009507	GCC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009507	CGGCG	2	10	730	739	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009507	TGC	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009507	GCC	2	6	766	771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009507	CG	4	8	774	781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009507	TGG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009507	CGA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009507	ACC	2	6	938	943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009507	CCT	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009507	GCA	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009507	GCGCCG	2	12	3786	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009507	GCC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009507	C	6	6	3906	3911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_009507	CCG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009507	ATGGC	2	10	3950	3959	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009507	TCC	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009507	TTCA	2	8	4645	4652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009507	TGA	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009507	AGGAA	2	10	5790	5799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009507	CCTT	2	8	5891	5898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009507	TG	3	6	5905	5910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009507	AGG	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009507	GGC	2	6	6009	6014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009507	GTC	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009507	GCC	2	6	6124	6129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009507	TTA	2	6	6163	6168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009507	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009507	TTGA	2	8	6226	6233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009507	ACCC	2	8	7160	7167	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_009507	GCC	2	6	7239	7244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009507	TTG	2	6	7550	7555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009507	GAT	2	6	7614	7619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009507	TCGC	2	8	9010	9017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009507	GCC	2	6	12101	12106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009507	GCC	2	6	15064	15069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009507	TGG	2	6	17456	17461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009507	ACC	2	6	17499	17504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009507	A	6	6	17515	17520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009507	AGC	2	6	17611	17616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009507	GGC	2	6	17631	17636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009507	TGCGC	2	10	19909	19918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009507	GC	4	8	19915	19922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009507	CG	3	6	22042	22047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009507	CGCA	2	8	22049	22056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009507	CGC	2	6	22065	22070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009507	ATGAG	2	10	22119	22128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009507	GCAGAT	2	12	22161	22172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009507	CAAC	2	8	22246	22253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009507	AAC	2	6	24030	24035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009507	GAA	2	6	24131	24136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009507	CCT	2	6	24149	24154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009507	CT	3	6	24253	24258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009507	GACG	2	8	24299	24306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009507	AAC	2	6	24309	24314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009507	TC	3	6	24317	24322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009507	CAG	2	6	26023	26028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009507	CGC	2	6	27570	27575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009507	CGG	3	9	27599	27607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009507	CCG	2	6	27617	27622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009507	CT	3	6	27629	27634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009507	CCCG	2	8	29787	29794	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009507	GAT	2	6	29800	29805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009507	TTCT	2	8	29819	29826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009507	GCC	2	6	30699	30704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009507	CGG	2	6	30759	30764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009507	GTCG	2	8	30792	30799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009507	GCC	2	6	30805	30810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009507	CAACG	2	10	30831	30840	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009507	GCC	2	6	30853	30858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009507	CTCC	2	8	30897	30904	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_009507	CGG	2	6	30939	30944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009507	CGG	2	6	30962	30967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009507	G	6	6	30997	31002	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009507	C	6	6	31034	31039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_009507	CGC	2	6	34736	34741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009507	GCT	2	6	34757	34762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009507	ACGA	2	8	34846	34853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009507	ATGG	2	8	34875	34882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009507	CAG	2	6	34896	34901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009507	CAGG	2	8	34905	34912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009507	TTC	2	6	34946	34951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009507	CGT	2	6	34965	34970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009507	GAG	2	6	35387	35392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009507	GCG	2	6	35396	35401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009507	ATG	2	6	35542	35547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009507	GCC	2	6	35595	35600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009507	T	6	6	35615	35620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009507	GCA	2	6	36837	36842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009507	CTG	2	6	38298	38303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009507	GCT	2	6	38340	38345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009507	GTC	3	9	38346	38354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009507	GGC	2	6	38400	38405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009507	CGG	2	6	38417	38422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009507	CACGCG	2	12	38525	38536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009507	AGC	2	6	38539	38544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009507	CG	3	6	38560	38565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009507	ACCA	2	8	38688	38695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009507	CGA	2	6	39547	39552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009507	CTG	2	6	39560	39565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009507	TC	3	6	39567	39572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009507	GCT	2	6	41027	41032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009507	GAT	2	6	41061	41066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009507	CGC	3	9	41132	41140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009507	CTT	2	6	41905	41910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009507	CGAT	2	8	41936	41943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009507	GCC	2	6	41969	41974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009507	CTT	2	6	41983	41988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009507	CAT	2	6	42052	42057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009507	TCC	2	6	42059	42064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009507	CGC	2	6	43296	43301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009507	GCA	2	6	43312	43317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009507	AGG	2	6	43320	43325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009507	TC	3	6	43331	43336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009507	CCCTT	2	10	48511	48520	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_009507	CTGC	2	8	48524	48531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009507	ATGT	2	8	48593	48600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009507	CGC	2	6	50964	50969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009507	CAC	2	6	50973	50978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009507	CCT	2	6	56633	56638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009507	TGG	2	6	56650	56655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009507	GCGCG	2	10	56716	56725	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_009507	GT	3	6	56766	56771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009507	CGG	2	6	56949	56954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009507	GGAA	2	8	56977	56984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009507	GGCG	2	8	57016	57023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009507	GCAC	2	8	57111	57118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009507	AGC	2	6	57134	57139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009507	AGA	2	6	57143	57148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009507	GAG	2	6	57165	57170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009507	CTG	2	6	57234	57239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009507	TGGG	2	8	57259	57266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009507	CGA	2	6	57296	57301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009507	CGC	2	6	57335	57340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009507	G	6	6	57364	57369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_009507	CTT	3	9	61993	62001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_009507	CTG	2	6	123695	123700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_009507	GCG	2	6	128576	128581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_009507	AGGC	2	8	139127	139134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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