MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009481	CAACG	2	10	1982612	1982621	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2502	NC_009481	CTTC	2	8	1982628	1982635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_009481	CAA	2	6	1982647	1982652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_009481	G	6	6	1984421	1984426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_009481	CCA	2	6	1989183	1989188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_009481	CAGG	2	8	1989224	1989231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_009481	A	9	9	1991560	1991568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_009481	GAA	2	6	1992289	1992294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_009481	CAA	2	6	1992305	1992310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_009481	A	6	6	1992340	1992345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_009481	TC	3	6	1992401	1992406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_009481	GCCT	2	8	1995559	1995566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_009481	C	6	6	1995590	1995595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2514	NC_009481	GCAGAG	2	12	2003910	2003921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2515	NC_009481	CGCC	2	8	2003995	2004002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2516	NC_009481	CAACG	2	10	2004017	2004026	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2517	NC_009481	ACA	2	6	2004387	2004392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_009481	CGC	2	6	2004393	2004398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_009481	CGC	2	6	2004409	2004414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_009481	CAC	2	6	2004893	2004898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_009481	CAA	2	6	2006661	2006666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_009481	AGGA	2	8	2006701	2006708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_009481	AAG	2	6	2008145	2008150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_009481	ATG	2	6	2008248	2008253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_009481	GAT	2	6	2008275	2008280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_009481	GGA	2	6	2008287	2008292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_009481	GGA	2	6	2008587	2008592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_009481	TGG	2	6	2008638	2008643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_009481	TGC	2	6	2008663	2008668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_009481	TTC	2	6	2009113	2009118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_009481	GCT	2	6	2009157	2009162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_009481	CAG	2	6	2009181	2009186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_009481	TCT	3	9	2009187	2009195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_009481	CTC	2	6	2009212	2009217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_009481	CTG	2	6	2009263	2009268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_009481	GA	3	6	2012068	2012073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_009481	CATC	3	12	2013415	2013426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_009481	CAA	2	6	2013433	2013438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_009481	GC	3	6	2015490	2015495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_009481	AAG	2	6	2015500	2015505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_009481	A	7	7	2015510	2015516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_009481	CTTT	2	8	2015536	2015543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_009481	C	6	6	2015603	2015608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2544	NC_009481	TCG	2	6	2015614	2015619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_009481	GCT	2	6	2015622	2015627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_009481	TCA	2	6	2015730	2015735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_009481	CAA	2	6	2015740	2015745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_009481	TGA	3	9	2015750	2015758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_009481	AAAT	2	8	2015797	2015804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_009481	CTC	2	6	2015829	2015834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_009481	TTC	2	6	2015881	2015886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_009481	TCC	2	6	2016028	2016033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_009481	ACG	2	6	2016106	2016111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_009481	CTTC	2	8	2016361	2016368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_009481	TCG	2	6	2016380	2016385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_009481	GC	3	6	2016417	2016422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_009481	AGG	2	6	2016437	2016442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_009481	CT	3	6	2016698	2016703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_009481	GCC	2	6	2016794	2016799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_009481	ACC	2	6	2016951	2016956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_009481	AG	4	8	2017010	2017017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_009481	ACC	2	6	2017044	2017049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2563	NC_009481	AGC	2	6	2017140	2017145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_009481	CTC	2	6	2017181	2017186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_009481	TGGCT	2	10	2017221	2017230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2566	NC_009481	GGA	2	6	2017351	2017356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_009481	ACA	2	6	2017502	2017507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_009481	GCT	2	6	2017576	2017581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_009481	CCT	2	6	2017592	2017597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_009481	CCT	2	6	2017617	2017622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_009481	AC	3	6	2017719	2017724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_009481	TGG	2	6	2017779	2017784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_009481	C	6	6	2017790	2017795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2574	NC_009481	AGCT	2	8	2017842	2017849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_009481	CCA	2	6	2018028	2018033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_009481	TTC	2	6	2018075	2018080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_009481	CTCCC	2	10	2018152	2018161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2578	NC_009481	CA	3	6	2018207	2018212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_009481	GGT	2	6	2018232	2018237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_009481	TCAGT	2	10	2018294	2018303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2581	NC_009481	TCGC	2	8	2018427	2018434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2582	NC_009481	CTTTC	2	10	2018458	2018467	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2583	NC_009481	CTA	2	6	2018474	2018479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_009481	TG	3	6	2018627	2018632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_009481	CCG	2	6	2018642	2018647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_009481	CAT	2	6	2018819	2018824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_009481	ATC	2	6	2018846	2018851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_009481	CAT	2	6	2018853	2018858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_009481	CAA	2	6	2018982	2018987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_009481	ACC	2	6	2019245	2019250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_009481	CCA	2	6	2019321	2019326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_009481	GTT	2	6	2019434	2019439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_009481	AGG	2	6	2019452	2019457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_009481	TCA	2	6	2019509	2019514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_009481	TCC	3	9	2019530	2019538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_009481	GT	3	6	2019593	2019598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_009481	TCC	2	6	2019653	2019658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_009481	TGC	2	6	2019732	2019737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_009481	GTA	2	6	2019755	2019760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_009481	GT	3	6	2019762	2019767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_009481	ATG	2	6	2019787	2019792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_009481	TCC	2	6	2019813	2019818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2603	NC_009481	CGG	2	6	2019829	2019834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_009481	TC	3	6	2019835	2019840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_009481	CACGA	2	10	2019912	2019921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2606	NC_009481	GAC	2	6	2019925	2019930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2608	NC_009481	TTC	2	6	2020013	2020018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_009481	TGCG	2	8	2020091	2020098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2612	NC_009481	ATG	2	6	2020361	2020366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_009481	CAG	2	6	2020388	2020393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_009481	GCC	2	6	2020403	2020408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2623	NC_009481	CCT	2	6	2021016	2021021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_009481	GTT	2	6	2021099	2021104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_009481	AAT	2	6	2021182	2021187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_009481	TCAT	2	8	2021220	2021227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2627	NC_009481	AAC	2	6	2021232	2021237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_009481	CAA	2	6	2021262	2021267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_009481	ACA	2	6	2021375	2021380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_009481	GCTCTC	2	12	2021429	2021440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2631	NC_009481	C	6	6	2021471	2021476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2632	NC_009481	CCATAA	2	12	2021484	2021495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_009481	CAC	2	6	2021496	2021501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2635	NC_009481	GCA	2	6	2024048	2024053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2637	NC_009481	CTG	2	6	2026414	2026419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2750	NC_009481	CCTG	2	8	2117280	2117287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2751	NC_009481	AACC	2	8	2117288	2117295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2752	NC_009481	GCT	2	6	2117360	2117365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2754	NC_009481	AGAA	2	8	2118515	2118522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2755	NC_009481	CCT	2	6	2119592	2119597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2756	NC_009481	CG	3	6	2122153	2122158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2757	NC_009481	TGG	2	6	2123151	2123156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2758	NC_009481	G	6	6	2123155	2123160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2759	NC_009481	GACTG	2	10	2125769	2125778	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2760	NC_009481	AG	3	6	2125814	2125819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2761	NC_009481	CCGC	2	8	2125848	2125855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2763	NC_009481	CAC	2	6	2127024	2127029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2892	NC_009481	GGATC	2	10	2247452	2247461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2894	NC_009481	C	6	6	2249185	2249190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2895	NC_009481	ATCG	2	8	2250092	2250099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2978	NC_009481	AATCT	2	10	2330022	2330031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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