MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 5890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009443	GTA	2	6	1371429	1371434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_009443	TCC	2	6	1371531	1371536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_009443	AGAAA	2	10	1372061	1372070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_009443	AGCG	2	8	1372164	1372171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_009443	CTC	2	6	1375113	1375118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_009443	T	7	7	1375232	1375238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_009443	TAA	2	6	1375246	1375251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009443	AAT	2	6	1375657	1375662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009443	AT	3	6	1375661	1375666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009443	TAT	2	6	1376798	1376803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009443	TGT	2	6	1376812	1376817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009443	A	6	6	1376829	1376834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009443	TATCC	2	10	1377138	1377147	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4014	NC_009443	T	6	6	1377153	1377158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009443	AGA	2	6	1377184	1377189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009443	A	6	6	1377203	1377208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009443	AT	4	8	1377246	1377253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009443	A	6	6	1377323	1377328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_009443	CAA	2	6	1377340	1377345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_009443	TAA	2	6	1377353	1377358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009443	T	6	6	1377435	1377440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_009443	GGCAG	2	10	1377455	1377464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_009443	TCC	2	6	1378537	1378542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_009443	AGTA	2	8	1379997	1380004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_009443	TCG	2	6	1380088	1380093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_009443	TAA	2	6	1380097	1380102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4028	NC_009443	TAT	2	6	1381252	1381257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_009443	T	6	6	1381279	1381284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_009443	ATATA	2	10	1381314	1381323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4033	NC_009443	CTTT	2	8	1381432	1381439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_009443	T	6	6	1381437	1381442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009443	TCT	2	6	1381609	1381614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4040	NC_009443	A	7	7	1384426	1384432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_009443	TAC	2	6	1384489	1384494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4049	NC_009443	A	6	6	1388753	1388758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_009443	T	7	7	1388759	1388765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009443	AT	3	6	1388777	1388782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009443	CTA	2	6	1388786	1388791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_009443	AT	3	6	1389808	1389813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009443	ATG	2	6	1393147	1393152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4064	NC_009443	AAT	2	6	1395520	1395525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009443	ATA	2	6	1395535	1395540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009443	TAT	2	6	1395566	1395571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_009443	AAT	2	6	1395582	1395587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_009443	TAA	2	6	1395603	1395608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009443	AT	3	6	1395632	1395637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_009443	CAT	2	6	1395669	1395674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4080	NC_009443	ATA	2	6	1398648	1398653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_009443	ACTT	2	8	1398678	1398685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4099	NC_009443	AATA	2	8	1405671	1405678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009443	AAAAT	2	10	1405692	1405701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_009443	TACT	2	8	1405719	1405726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_009443	ACT	2	6	1405780	1405785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4106	NC_009443	GTC	2	6	1406605	1406610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4111	NC_009443	T	6	6	1406764	1406769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_009443	CAA	2	6	1406773	1406778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_009443	TTTC	2	8	1407653	1407660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_009443	GTTCT	2	10	1407690	1407699	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_009443	CCT	2	6	1407712	1407717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_009443	TAT	2	6	1407733	1407738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_009443	AAAG	2	8	1407744	1407751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009443	CTT	2	6	1409403	1409408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4120	NC_009443	CATA	2	8	1412423	1412430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_009443	T	6	6	1412453	1412458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_009443	AT	3	6	1412519	1412524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_009443	ATCAGA	2	12	1414716	1414727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4127	NC_009443	GTT	2	6	1416232	1416237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_009443	ACC	2	6	1416416	1416421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_009443	TCT	2	6	1420476	1420481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_009443	CTT	2	6	1420515	1420520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_009443	TA	3	6	1420524	1420529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_009443	TTA	2	6	1422311	1422316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_009443	TAT	2	6	1422520	1422525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_009443	T	6	6	1422529	1422534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_009443	A	6	6	1422548	1422553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_009443	T	7	7	1422984	1422990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_009443	AT	3	6	1423498	1423503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_009443	TAT	2	6	1423510	1423515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_009443	ATA	2	6	1423543	1423548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_009443	AT	3	6	1426359	1426364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_009443	CCATCG	2	12	1426372	1426383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4144	NC_009443	TCA	2	6	1426386	1426391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4157	NC_009443	A	6	6	1431340	1431345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_009443	TAA	2	6	1431348	1431353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_009443	ATCA	2	8	1436400	1436407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4169	NC_009443	GAT	2	6	1439084	1439089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_009443	T	7	7	1457092	1457098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_009443	GCCC	2	8	1457121	1457128	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4253	NC_009443	GT	3	6	1457145	1457150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_009443	ATA	2	6	1457157	1457162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_009443	TG	3	6	1457173	1457178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_009443	AAAT	2	8	1457209	1457216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_009443	T	6	6	1457347	1457352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_009443	T	6	6	1457624	1457629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_009443	GCC	2	6	1457646	1457651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4261	NC_009443	TAC	2	6	1457696	1457701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_009443	T	7	7	1457729	1457735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_009443	TCT	2	6	1458202	1458207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_009443	TAT	2	6	1459474	1459479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4404	NC_009443	A	8	8	1503592	1503599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_009443	TAATA	2	10	1503602	1503611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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