MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 5890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009443	GATTT	2	10	436664	436673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009443	A	6	6	438159	438164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009443	GGT	2	6	438616	438621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_009443	TGA	2	6	438658	438663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009443	GGT	2	6	438707	438712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009443	GACT	2	8	439752	439759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_009443	T	7	7	439823	439829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009443	A	6	6	439847	439852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_009443	TAA	2	6	442555	442560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_009443	ATC	2	6	444488	444493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_009443	T	6	6	444507	444512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009443	A	6	6	444531	444536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009443	TAAAAA	2	12	445431	445442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009443	ATG	2	6	445465	445470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009443	A	6	6	445497	445502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_009443	GTAG	2	8	445511	445518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009443	ACA	2	6	445522	445527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_009443	TAA	2	6	445562	445567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009443	AGG	2	6	445584	445589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009443	CTGTT	2	10	449217	449226	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1521	NC_009443	A	7	7	449240	449246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009443	TGTATT	2	12	449251	449262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009443	A	6	6	449282	449287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009443	AAT	2	6	449296	449301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009443	TAA	2	6	452296	452301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_009443	A	7	7	452318	452324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009443	TAA	2	6	452331	452336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009443	AGG	2	6	452352	452357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009443	TCT	2	6	453379	453384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_009443	ACA	2	6	453413	453418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_009443	T	6	6	453456	453461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009443	TTAAA	2	10	453464	453473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_009443	AT	3	6	453474	453479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_009443	GAA	2	6	455348	455353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_009443	AGT	2	6	455671	455676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_009443	GAA	2	6	455720	455725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009443	TTAT	2	8	455733	455740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009443	CGC	2	6	455855	455860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_009443	TTA	2	6	456253	456258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009443	AG	3	6	456297	456302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009443	A	6	6	457165	457170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009443	AGG	2	6	457176	457181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009443	CTG	2	6	457338	457343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_009443	ACCA	2	8	459814	459821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_009443	TAA	2	6	459904	459909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009443	TGCC	2	8	459912	459919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_009443	GGT	2	6	459986	459991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009443	AAATAC	2	12	460024	460035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1549	NC_009443	CTG	2	6	460046	460051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_009443	ACATT	2	10	460065	460074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_009443	TAG	2	6	462197	462202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009443	AAAT	2	8	462252	462259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_009443	AAG	2	6	462262	462267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009443	ATCT	2	8	463744	463751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_009443	AAC	2	6	464623	464628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_009443	GAT	2	6	464668	464673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009443	T	6	6	464673	464678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009443	TAT	2	6	464742	464747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009443	CCT	2	6	464794	464799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_009443	CGA	2	6	464825	464830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_009443	CTT	2	6	464840	464845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009443	GATT	2	8	464941	464948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009443	GTT	2	6	465007	465012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009443	TGA	2	6	465020	465025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009443	ATG	2	6	465061	465066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_009443	TCG	2	6	465119	465124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1568	NC_009443	A	7	7	468803	468809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_009443	ATA	2	6	468835	468840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009443	AATG	2	8	468847	468854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009443	GAT	2	6	468886	468891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009443	AG	3	6	468910	468915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009443	AGAAA	2	10	470307	470316	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009443	TGG	2	6	474633	474638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_009443	GA	3	6	474700	474705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009443	TCTA	2	8	478076	478083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_009443	T	7	7	478093	478099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_009443	TGA	2	6	478143	478148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_009443	A	6	6	478265	478270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009443	T	6	6	478342	478347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009443	A	6	6	478363	478368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1603	NC_009443	T	6	6	482150	482155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_009443	ATGA	2	8	482244	482251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009443	T	6	6	482259	482264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009443	ATT	2	6	482311	482316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009443	GTA	2	6	482338	482343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_009443	AGTC	2	8	483741	483748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_009443	A	6	6	483771	483776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_009443	AG	3	6	484645	484650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_009443	AT	3	6	484665	484670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009443	T	7	7	484762	484768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_009443	ATTG	2	8	484776	484783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_009443	A	7	7	484791	484797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009443	ATG	2	6	484801	484806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009443	TAGAA	2	10	484827	484836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_009443	TTATT	2	10	484943	484952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009443	TATAC	2	10	485007	485016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_009443	T	7	7	485070	485076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_009443	A	7	7	485099	485105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_009443	TTGAT	2	10	485250	485259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_009443	TTCT	2	8	485324	485331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_009443	CT	3	6	485330	485335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_009443	TAA	2	6	485426	485431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_009443	TTAG	2	8	485485	485492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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