MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 5890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009443	CCT	2	6	1934330	1934335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_009443	TGA	2	6	1934340	1934345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009443	TTC	2	6	1936824	1936829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_009443	ATA	2	6	1936834	1936839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009443	CT	3	6	1936846	1936851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_009443	AAT	2	6	1940865	1940870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_009443	TAT	2	6	1940883	1940888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_009443	ATT	2	6	1940912	1940917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_009443	CAT	2	6	1940955	1940960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_009443	ATA	2	6	1940977	1940982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009443	TA	4	8	1940981	1940988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_009443	TA	3	6	1940999	1941004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_009443	AT	3	6	1941031	1941036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_009443	T	6	6	1941061	1941066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_009443	TTA	2	6	1942087	1942092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_009443	A	6	6	1942098	1942103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_009443	T	6	6	1943038	1943043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_009443	CCA	2	6	1943590	1943595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_009443	CAA	2	6	1943676	1943681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_009443	AATA	2	8	1943936	1943943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_009443	ATC	2	6	1943979	1943984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_009443	CTTT	2	8	1944261	1944268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_009443	A	6	6	1946240	1946245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_009443	CCT	2	6	1946380	1946385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_009443	ACA	2	6	1947416	1947421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_009443	TA	5	10	1947426	1947435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_009443	A	7	7	1947457	1947463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_009443	CCT	2	6	1947476	1947481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_009443	TAT	2	6	1947492	1947497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_009443	TCC	2	6	1950286	1950291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_009443	CA	3	6	1950432	1950437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_009443	GCT	2	6	1950454	1950459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_009443	TCC	2	6	1950464	1950469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_009443	CACG	2	8	1950482	1950489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_009443	TAT	2	6	1951076	1951081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_009443	CTT	2	6	1951111	1951116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_009443	GCT	2	6	1951122	1951127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_009443	AATC	2	8	1951133	1951140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_009443	ACT	2	6	1951145	1951150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_009443	CA	3	6	1951161	1951166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_009443	TTTC	2	8	1951167	1951174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_009443	CCT	2	6	1951214	1951219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_009443	AT	3	6	1951265	1951270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009443	A	7	7	1951303	1951309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_009443	CTC	2	6	1953496	1953501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5547	NC_009443	TCC	2	6	1954630	1954635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_009443	CAA	2	6	1954677	1954682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_009443	A	8	8	1954681	1954688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_009443	GAT	2	6	1955758	1955763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_009443	TCC	2	6	1956425	1956430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_009443	CCCGT	2	10	1956438	1956447	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5553	NC_009443	TAA	2	6	1956479	1956484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009443	TTA	2	6	1956485	1956490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009443	ATT	2	6	1956502	1956507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009443	TACAT	2	10	1956516	1956525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5557	NC_009443	T	7	7	1957228	1957234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009443	CA	3	6	1957235	1957240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_009443	T	6	6	1959495	1959500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_009443	GGGA	2	8	1960021	1960028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009443	TATTT	2	10	1960342	1960351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_009443	T	6	6	1961850	1961855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_009443	TAT	2	6	1961875	1961880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_009443	TCC	2	6	1961977	1961982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_009443	TAA	2	6	1962008	1962013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_009443	AATA	2	8	1962016	1962023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5568	NC_009443	GGTT	2	8	1962056	1962063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_009443	AACC	2	8	1962067	1962074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_009443	TCT	2	6	1962075	1962080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5572	NC_009443	CTA	2	6	1968580	1968585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5574	NC_009443	CTT	2	6	1968615	1968620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_009443	A	7	7	1968645	1968651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_009443	CTC	2	6	1969602	1969607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5579	NC_009443	TA	3	6	1969682	1969687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_009443	TATT	2	8	1969689	1969696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009443	TA	3	6	1969819	1969824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_009443	A	6	6	1969847	1969852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_009443	CAAT	2	8	1969870	1969877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_009443	AC	3	6	1972202	1972207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_009443	AT	3	6	1972257	1972262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_009443	T	6	6	1972262	1972267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_009443	A	7	7	1972309	1972315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_009443	CTAT	2	8	1972983	1972990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_009443	AG	3	6	1973010	1973015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_009443	A	7	7	1973088	1973094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_009443	TAGTGT	2	12	1973125	1973136	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_009443	ATT	2	6	1973138	1973143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_009443	AAACC	2	10	1973177	1973186	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5594	NC_009443	T	6	6	1974681	1974686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_009443	A	6	6	1975793	1975798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_009443	CTC	2	6	1975799	1975804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5598	NC_009443	TCC	2	6	1977810	1977815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_009443	TCCC	2	8	1981768	1981775	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5601	NC_009443	TTA	2	6	1981794	1981799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_009443	ACA	2	6	1981869	1981874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_009443	TTA	2	6	1981925	1981930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_009443	TAT	2	6	1984472	1984477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_009443	TCTT	2	8	1986450	1986457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_009443	TAA	2	6	1986466	1986471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_009443	A	6	6	1986473	1986478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5610	NC_009443	TAAGAT	2	12	1989033	1989044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_009443	CTTC	2	8	1989132	1989139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_009443	TAC	2	6	1989211	1989216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5615	NC_009443	AT	3	6	1989251	1989256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_009443	ATC	2	6	1989278	1989283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_009443	CTA	2	6	1989337	1989342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5619	NC_009443	ACC	2	6	1989366	1989371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5621	NC_009443	TA	3	6	1990461	1990466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009443	A	7	7	1990480	1990486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_009443	T	6	6	1990511	1990516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5626	NC_009443	T	12	12	1991222	1991233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_009443	AAAT	2	8	1991235	1991242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_009443	CATA	2	8	1991300	1991307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5630	NC_009443	T	9	9	1991427	1991435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_009443	T	7	7	1991456	1991462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_009443	A	6	6	1991506	1991511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5635	NC_009443	ATT	2	6	1993210	1993215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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