MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009442	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009442	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009442	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009442	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009442	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009442	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009442	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009442	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009442	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009442	A	6	6	3932	3937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009442	GAG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009442	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009442	ATT	2	6	4302	4307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009442	A	8	8	4389	4396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009442	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009442	TTC	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009442	GTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009442	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009442	TTGG	2	8	5627	5634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009442	AAT	2	6	9765	9770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009442	AGG	2	6	10526	10531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009442	AAC	2	6	13086	13091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009442	CTA	2	6	13647	13652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009442	T	6	6	15721	15726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009442	TTAT	2	8	15777	15784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009442	A	6	6	15869	15874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009442	CAA	2	6	15948	15953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009442	A	6	6	16470	16475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009442	A	8	8	16550	16557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009442	A	6	6	16586	16591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009442	A	6	6	16596	16601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009442	ATA	2	6	16625	16630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009442	AAAT	2	8	16631	16638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009442	A	6	6	16675	16680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009442	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009442	TAA	2	6	16723	16728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009442	A	7	7	16764	16770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009442	A	6	6	16776	16781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009442	A	6	6	16799	16804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009442	A	8	8	16861	16868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009442	CAAAC	2	10	16869	16878	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009442	ACAAA	2	10	16915	16924	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009442	GGC	2	6	17008	17013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009442	GCA	2	6	17327	17332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009442	CGC	2	6	17374	17379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009442	GTGA	2	8	17380	17387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009442	TGT	2	6	17413	17418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009442	AGA	2	6	17422	17427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009442	AGA	2	6	17434	17439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009442	CAG	2	6	17496	17501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009442	AGCG	2	8	17551	17558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009442	AT	3	6	17680	17685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009442	GGA	2	6	17686	17691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009442	CT	3	6	17711	17716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009442	GAA	2	6	17950	17955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009442	GGT	2	6	18024	18029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009442	GTC	2	6	18038	18043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009442	TCGTG	2	10	18047	18056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009442	CAT	2	6	18106	18111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009442	TAA	2	6	18141	18146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009442	GGA	2	6	18150	18155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009442	ATC	2	6	18174	18179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009442	AC	3	6	18201	18206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009442	CGC	2	6	18340	18345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009442	AC	3	6	18370	18375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009442	CAC	2	6	18385	18390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009442	AGCC	2	8	18433	18440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009442	GAT	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009442	CCT	2	6	18512	18517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009442	TCT	2	6	18547	18552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009442	AGG	2	6	18613	18618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009442	AAC	2	6	18648	18653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009442	GTT	2	6	18658	18663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009442	A	6	6	18793	18798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009442	ATC	2	6	18851	18856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009442	AGT	2	6	18859	18864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009442	GTTAA	2	10	18926	18935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009442	ACG	2	6	18989	18994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009442	GTAA	2	8	19012	19019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009442	TCAC	2	8	19069	19076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009442	TAG	2	6	19160	19165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009442	GCGA	2	8	19168	19175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009442	AGG	2	6	19182	19187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009442	GAG	2	6	19195	19200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009442	CTC	2	6	19205	19210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009442	AGA	2	6	19247	19252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009442	AG	3	6	19275	19280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009442	T	6	6	19303	19308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009442	TCG	2	6	19350	19355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009442	GGA	2	6	19363	19368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009442	CT	3	6	19389	19394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009442	ACA	2	6	19481	19486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009442	ATG	2	6	19548	19553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009442	TAT	2	6	19613	19618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009442	GGA	2	6	19681	19686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009442	TC	3	6	19767	19772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009442	ACC	2	6	19947	19952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009442	AAT	2	6	19967	19972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009442	AGC	2	6	20027	20032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009442	ATTC	2	8	20034	20041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009442	TG	3	6	20158	20163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009442	AAG	2	6	20164	20169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009442	GAG	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009442	GA	3	6	20309	20314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009442	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009442	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009442	GA	3	6	20604	20609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009442	CT	3	6	20720	20725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009442	GAT	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009442	AGG	2	6	20783	20788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009442	CGG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009442	GA	3	6	20927	20932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009442	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009442	TAC	2	6	21099	21104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009442	CCT	2	6	21187	21192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009442	GGT	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009442	TCG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009442	CGT	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009442	GA	3	6	21742	21747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009442	TGGAAG	2	12	21765	21776	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009442	AGT	2	6	21909	21914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009442	CAG	2	6	21961	21966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009442	AGT	2	6	21987	21992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009442	AATC	2	8	22192	22199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009442	ACC	2	6	22510	22515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009442	CGT	2	6	22547	22552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009442	ATTAT	2	10	22861	22870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009442	CGC	2	6	22940	22945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009442	TA	3	6	22946	22951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009442	AT	3	6	23037	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009442	GGA	2	6	23044	23049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009442	GCGT	2	8	23103	23110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009442	TCC	2	6	23127	23132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009442	CTA	2	6	23137	23142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009442	AGC	2	6	23154	23159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009442	TCG	2	6	23168	23173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009442	CGG	2	6	23280	23285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009442	TAT	2	6	23328	23333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009442	GGT	2	6	23386	23391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009442	ATATT	2	10	23410	23419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009442	AT	3	6	23563	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009442	TTTAT	2	10	24441	24450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009442	GGTC	2	8	24487	24494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009442	ATT	2	6	24497	24502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009442	T	6	6	24538	24543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009442	ATT	2	6	24572	24577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_009442	CCT	2	6	96998	97003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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434	NC_009442	ATAA	2	8	98498	98505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_009442	A	6	6	98536	98541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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