MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009442	A	6	6	1350423	1350428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_009442	CT	3	6	1350439	1350444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4005	NC_009442	CAA	2	6	1350459	1350464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_009442	AAC	2	6	1350484	1350489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_009442	T	6	6	1350504	1350509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009442	T	6	6	1350525	1350530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4010	NC_009442	CCT	2	6	1350796	1350801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_009442	A	6	6	1351603	1351608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009442	CTAAG	2	10	1355184	1355193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_009442	A	6	6	1355199	1355204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009442	CAG	2	6	1355647	1355652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_009442	A	7	7	1355678	1355684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009442	T	6	6	1355694	1355699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009442	TCA	2	6	1358440	1358445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4019	NC_009442	TCT	2	6	1358547	1358552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_009442	ATT	2	6	1358587	1358592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009442	A	7	7	1360311	1360317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_009442	TGA	2	6	1360324	1360329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_009442	CACTT	2	10	1360356	1360365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4024	NC_009442	TCT	2	6	1361380	1361385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_009442	TAT	2	6	1361503	1361508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4030	NC_009442	T	7	7	1363839	1363845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4050	NC_009442	TCCA	2	8	1368720	1368727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4059	NC_009442	TGG	2	6	1369114	1369119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_009442	ACT	2	6	1370316	1370321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_009442	GTA	2	6	1372000	1372005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_009442	AGTA	2	8	1380564	1380571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_009442	TCG	2	6	1380655	1380660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_009442	TAA	2	6	1380664	1380669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_009442	AAAC	2	8	1380670	1380677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_009442	TAT	2	6	1381819	1381824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_009442	ATATA	2	10	1381881	1381890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4110	NC_009442	CTTT	2	8	1381999	1382006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_009442	T	6	6	1382004	1382009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_009442	TCT	2	6	1382176	1382181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4114	NC_009442	TTTA	2	8	1382524	1382531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_009442	CGA	2	6	1382570	1382575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_009442	AT	3	6	1384915	1384920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_009442	A	7	7	1384988	1384994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009442	TAC	2	6	1385051	1385056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_009442	ATT	2	6	1385064	1385069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4123	NC_009442	CTGC	2	8	1388388	1388395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_009442	ATC	2	6	1388423	1388428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4126	NC_009442	A	6	6	1389313	1389318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_009442	T	7	7	1389319	1389325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_009442	AT	3	6	1389337	1389342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_009442	CTA	2	6	1389346	1389351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_009442	ATA	2	6	1396098	1396103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_009442	TAT	2	6	1396129	1396134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_009442	AAT	2	6	1396145	1396150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_009442	TAA	2	6	1396166	1396171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_009442	AT	3	6	1396195	1396200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_009442	CATCCC	2	12	1396204	1396215	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4137	NC_009442	T	6	6	1396226	1396231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_009442	CAT	2	6	1396232	1396237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_009442	AGAA	2	8	1396269	1396276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_009442	GCACA	2	10	1398927	1398936	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4143	NC_009442	TAC	2	6	1399133	1399138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_009442	ATTT	2	8	1399221	1399228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_009442	T	6	6	1399226	1399231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_009442	ACTT	2	8	1399241	1399248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4152	NC_009442	TTC	2	6	1401210	1401215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4153	NC_009442	A	6	6	1401453	1401458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_009442	AAC	2	6	1401462	1401467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4156	NC_009442	TCC	2	6	1403366	1403371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4162	NC_009442	A	6	6	1405015	1405020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_009442	CAAA	2	8	1406124	1406131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4164	NC_009442	ATG	2	6	1406200	1406205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_009442	TG	3	6	1406213	1406218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_009442	T	7	7	1406226	1406232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_009442	AATA	2	8	1406236	1406243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_009442	AAAAT	2	10	1406257	1406266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4169	NC_009442	TACT	2	8	1406284	1406291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4211	NC_009442	CCATCG	2	12	1426939	1426950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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4247	NC_009442	CTTT	2	8	1441939	1441946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4248	NC_009442	ATAA	2	8	1441995	1442002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_009442	ATA	2	6	1442004	1442009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_009442	CCT	2	6	1443159	1443164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4251	NC_009442	TAT	2	6	1443168	1443173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_009442	GAAA	2	8	1443240	1443247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_009442	CAA	2	6	1444130	1444135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_009442	TTG	2	6	1444150	1444155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_009442	A	7	7	1444202	1444208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_009442	GCT	2	6	1444235	1444240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_009442	T	6	6	1444303	1444308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_009442	AGT	2	6	1445736	1445741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_009442	ACT	2	6	1445771	1445776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_009442	T	7	7	1448309	1448315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_009442	TTG	2	6	1450294	1450299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_009442	TAT	2	6	1450383	1450388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_009442	TCT	2	6	1450441	1450446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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