MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella putrefaciens CN-32 chromosome

Total Repeats: 12487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009438	T	6	6	72	77	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009438	TGA	2	6	123	128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009438	CGC	2	6	2702	2707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009438	CCAT	2	8	2748	2755	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009438	CTA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009438	GA	3	6	3938	3943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009438	TGT	2	6	6369	6374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009438	TGAT	2	8	6377	6384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009438	ATT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009438	AGC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009438	TAT	2	6	6453	6458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009438	GTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009438	A	6	6	7656	7661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009438	T	6	6	7678	7683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009438	T	6	6	10766	10771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009438	CTT	2	6	10774	10779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009438	TA	3	6	10797	10802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009438	GA	3	6	11410	11415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009438	A	7	7	11471	11477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009438	TAGG	2	8	14805	14812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009438	TA	3	6	14874	14879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009438	CAT	2	6	15390	15395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009438	TGAT	2	8	15796	15803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009438	AT	3	6	15824	15829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009438	AATT	2	8	15859	15866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009438	TAA	2	6	15890	15895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009438	CCA	2	6	19276	19281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009438	CT	3	6	19304	19309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009438	CAG	2	6	19316	19321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009438	CAT	2	6	19329	19334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009438	TG	3	6	19344	19349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009438	ACA	2	6	19377	19382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009438	ATT	2	6	19559	19564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009438	ATG	2	6	19575	19580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009438	AGC	2	6	19605	19610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009438	TGT	2	6	19655	19660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009438	AGATTA	2	12	19669	19680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009438	ATA	2	6	19699	19704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009438	AAT	2	6	21759	21764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009438	AG	3	6	23789	23794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009438	TCAC	2	8	24124	24131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009438	TTATT	2	10	24140	24149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009438	ATT	2	6	24263	24268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009438	TTA	2	6	24890	24895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009438	AGT	2	6	26361	26366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009438	AGTT	2	8	30610	30617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009438	CTAATG	2	12	30625	30636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009438	AAT	2	6	30664	30669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009438	CAA	2	6	31891	31896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009438	TTA	2	6	31897	31902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009438	TTG	2	6	33402	33407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009438	GA	3	6	33423	33428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009438	AGG	2	6	33430	33435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009438	CCT	2	6	33442	33447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009438	T	6	6	33447	33452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009438	GGT	2	6	33507	33512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009438	TG	3	6	34090	34095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009438	AAT	2	6	34185	34190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009438	TTG	2	6	34195	34200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009438	AAT	2	6	34806	34811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009438	ACA	2	6	35755	35760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009438	TAG	2	6	36210	36215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009438	AG	3	6	36227	36232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009438	TA	3	6	37567	37572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009438	ACTA	2	8	37592	37599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009438	GGTCA	2	10	38223	38232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009438	GCA	2	6	38392	38397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009438	A	6	6	38406	38411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009438	TG	3	6	38542	38547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009438	ATG	2	6	38615	38620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009438	GTTT	2	8	38646	38653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009438	CTT	2	6	38659	38664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009438	A	6	6	38685	38690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009438	GGC	2	6	38778	38783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009438	GCA	2	6	38809	38814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009438	GCG	2	6	38842	38847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009438	AGG	2	6	38937	38942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009438	CGA	2	6	39017	39022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009438	GAT	2	6	39042	39047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009438	GCA	2	6	39091	39096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009438	GT	3	6	39144	39149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009438	GAA	2	6	39150	39155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009438	GGA	2	6	39186	39191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009438	AGA	2	6	39233	39238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009438	CAG	2	6	39259	39264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009438	G	6	6	39406	39411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009438	GGA	2	6	39450	39455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009438	GGC	2	6	39470	39475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009438	GAA	2	6	39713	39718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009438	TGC	2	6	39789	39794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009438	GTC	2	6	39801	39806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009438	TGG	2	6	39879	39884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009438	GGA	2	6	39915	39920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009438	GAC	2	6	39928	39933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009438	TCA	2	6	39940	39945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009438	AC	3	6	39966	39971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009438	TCG	2	6	40033	40038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009438	AC	3	6	40135	40140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009438	AAG	2	6	40171	40176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009438	G	7	7	40194	40200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009438	CAC	2	6	40205	40210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009438	CCT	2	6	40276	40281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009438	CA	3	6	40366	40371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009438	ATG	2	6	40474	40479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009438	A	6	6	40500	40505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009438	TTA	2	6	40546	40551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009438	CTT	2	6	40586	40591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009438	CAA	2	6	40627	40632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009438	GTA	2	6	40717	40722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009438	TCA	2	6	40804	40809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009438	TAG	2	6	40897	40902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009438	GCGA	2	8	40905	40912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009438	G	6	6	41054	41059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009438	TCC	2	6	41064	41069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009438	CTGA	2	8	41084	41091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009438	GGA	2	6	41374	41379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009438	TAC	2	6	41578	41583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009438	CGG	2	6	41596	41601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009438	CGTC	2	8	41609	41616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009438	AAC	2	6	41628	41633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009438	AGC	2	6	41718	41723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009438	CAT	2	6	41724	41729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009438	AAAG	2	8	41732	41739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009438	AGTCG	2	10	41754	41763	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009438	ACC	2	6	41796	41801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009438	TGAAGG	2	12	41859	41870	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009438	GA	3	6	42071	42076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009438	AGGCT	2	10	42083	42092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009438	GCG	2	6	42096	42101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009438	GGT	2	6	42120	42125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009438	GGTG	2	8	42127	42134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009438	TGA	2	6	42170	42175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009438	AGT	2	6	42195	42200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009438	TCT	2	6	42223	42228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009438	GGT	2	6	42269	42274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009438	GA	3	6	42299	42304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009438	TGA	2	6	42368	42373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009438	CT	3	6	42380	42385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009438	ATTG	2	8	42502	42509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009438	CGG	2	6	42550	42555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009438	ATG	2	6	42626	42631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009438	GTC	2	6	42807	42812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009438	ACC	2	6	42821	42826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_009438	TGG	2	6	42881	42886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009438	TCC	2	6	42907	42912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009438	GGA	2	6	42924	42929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009438	GGT	2	6	43044	43049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009438	CGG	2	6	43131	43136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009438	TCA	2	6	43159	43164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009438	CGT	2	6	43239	43244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009438	GAT	2	6	43279	43284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009438	GAAC	2	8	43321	43328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009438	GT	3	6	43492	43497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009438	AAG	2	6	43574	43579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009438	AC	3	6	43639	43644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_009438	A	6	6	43668	43673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009438	ATT	2	6	43689	43694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009438	ATAAG	2	10	43697	43706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009438	AGC	2	6	43738	43743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_009438	ACC	2	6	43806	43811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_009438	ATCCC	2	10	43814	43823	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
162	NC_009438	TCCGC	2	10	44000	44009	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
163	NC_009438	T	6	6	44046	44051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009438	ATT	2	6	44115	44120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009438	TTTC	2	8	44128	44135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_009438	GCC	2	6	46922	46927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_009438	TAC	2	6	49693	49698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_009438	CTG	2	6	49830	49835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_009438	CGG	2	6	50345	50350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_009438	TCA	2	6	50401	50406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_009438	GATAG	2	10	50578	50587	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
174	NC_009438	TATT	2	8	52108	52115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_009438	T	6	6	52160	52165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_009438	CTTG	2	8	52445	52452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
180	NC_009438	TCA	2	6	52468	52473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_009438	TG	3	6	52509	52514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009438	CCTA	2	8	54260	54267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_009438	TGATT	2	10	54314	54323	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009438	TTG	2	6	54445	54450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_009438	AAG	2	6	58400	58405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_009438	A	6	6	58456	58461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_009438	CTG	2	6	58571	58576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_009438	ATG	2	6	59603	59608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009438	TAT	2	6	59709	59714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_009438	TTAG	2	8	96655	96662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
275	NC_009438	T	6	6	96670	96675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_009438	CAT	2	6	96689	96694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_009438	TA	3	6	96702	96707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_009438	CCAG	2	8	97512	97519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
279	NC_009438	GAT	2	6	97535	97540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009438	GTC	2	6	97602	97607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_009438	T	7	7	97658	97664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009438	TCG	2	6	97688	97693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_009438	AGG	2	6	97695	97700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_009438	TTG	2	6	97802	97807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009438	GAT	2	6	99896	99901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_009438	CTAT	2	8	158040	158047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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440	NC_009438	CATT	2	8	159249	159256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
441	NC_009438	GGC	2	6	159323	159328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_009438	GTT	2	6	160339	160344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_009438	TTTAT	2	10	170462	170471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_009438	TTA	2	6	172205	172210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_009438	TGAA	2	8	195699	195706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_009438	TCA	2	6	195731	195736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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