MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella putrefaciens CN-32 chromosome

Total Repeats: 12487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009438	A	7	7	2964234	2964240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_009438	GGC	2	6	2964860	2964865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_009438	TA	3	6	2965046	2965051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_009438	TAT	2	6	2965102	2965107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009438	CAA	2	6	2965147	2965152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_009438	CAT	2	6	2965236	2965241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_009438	CTAG	2	8	2966812	2966819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_009438	GCTTC	2	10	2966826	2966835	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8009	NC_009438	CTA	2	6	2966881	2966886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_009438	ACC	2	6	2966905	2966910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_009438	GTC	2	6	2966941	2966946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_009438	CAT	2	6	2966960	2966965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_009438	TGG	2	6	2967043	2967048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_009438	AGG	2	6	2967057	2967062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_009438	TTA	2	6	2967072	2967077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_009438	CA	3	6	2967139	2967144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_009438	AAT	2	6	2967301	2967306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_009438	GGA	2	6	2967336	2967341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_009438	GAA	2	6	2968581	2968586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009438	ATT	2	6	2969593	2969598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_009438	CATGC	2	10	2969622	2969631	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8022	NC_009438	ACC	2	6	2971969	2971974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_009438	AGC	2	6	2972048	2972053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_009438	TAC	2	6	2972061	2972066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_009438	AGT	2	6	2972080	2972085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_009438	AGCTTT	2	12	2972175	2972186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8027	NC_009438	CTA	2	6	2972879	2972884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_009438	TCC	2	6	2980207	2980212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_009438	TAA	2	6	2980238	2980243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_009438	CAT	2	6	2990879	2990884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_009438	ACC	2	6	2992415	2992420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_009438	TGT	2	6	2992475	2992480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_009438	CTG	2	6	2998016	2998021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_009438	GTC	2	6	2998388	2998393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_009438	AAT	2	6	2998436	2998441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_009438	A	6	6	3001023	3001028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_009438	AAT	2	6	3001094	3001099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_009438	ATTA	2	8	3002591	3002598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_009438	CCA	2	6	3002651	3002656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_009438	ACT	2	6	3002659	3002664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_009438	TGA	2	6	3002666	3002671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_009438	TAT	2	6	3002678	3002683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_009438	CAG	2	6	3002684	3002689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_009438	AAGC	2	8	3002695	3002702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8045	NC_009438	A	7	7	3002793	3002799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_009438	T	7	7	3002815	3002821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_009438	TCA	2	6	3004984	3004989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_009438	TTAAC	2	10	3006396	3006405	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8049	NC_009438	GCA	2	6	3006458	3006463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_009438	T	6	6	3006466	3006471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009438	ATT	2	6	3006481	3006486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_009438	A	7	7	3006490	3006496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_009438	TA	3	6	3006505	3006510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_009438	ATT	2	6	3006516	3006521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_009438	CTA	2	6	3006556	3006561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_009438	AGA	2	6	3006576	3006581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009438	CTC	2	6	3010711	3010716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_009438	ATCT	2	8	3014496	3014503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_009438	AGCAA	2	10	3015281	3015290	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8060	NC_009438	CAT	2	6	3015292	3015297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_009438	CAA	2	6	3015300	3015305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_009438	AGCA	2	8	3015306	3015313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8063	NC_009438	GGA	2	6	3015354	3015359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009438	GGC	2	6	3015389	3015394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_009438	TCAAT	2	10	3016800	3016809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8066	NC_009438	CCT	2	6	3017615	3017620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_009438	AGA	2	6	3018510	3018515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_009438	GTG	2	6	3018531	3018536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_009438	A	6	6	3018555	3018560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_009438	C	6	6	3019535	3019540	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8071	NC_009438	TTG	2	6	3020482	3020487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8073	NC_009438	AAT	2	6	3021385	3021390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_009438	ACG	2	6	3021440	3021445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8076	NC_009438	AAT	2	6	3022240	3022245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_009438	A	6	6	3022267	3022272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_009438	CTC	2	6	3022449	3022454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_009438	ACA	2	6	3023703	3023708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_009438	TGTC	2	8	3023858	3023865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8082	NC_009438	CCT	2	6	3025181	3025186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_009438	GA	3	6	3025217	3025222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_009438	TA	3	6	3025238	3025243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_009438	AAT	2	6	3025252	3025257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_009438	A	6	6	3025269	3025274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_009438	GCC	2	6	3025281	3025286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_009438	GCC	2	6	3025292	3025297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_009438	T	6	6	3025310	3025315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_009438	T	8	8	3025320	3025327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_009438	A	7	7	3026328	3026334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_009438	TACA	2	8	3026377	3026384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8093	NC_009438	CCGA	2	8	3026464	3026471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8094	NC_009438	AAAAG	2	10	3029149	3029158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_009438	TTG	2	6	3031464	3031469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_009438	AGAT	2	8	3032712	3032719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_009438	AACA	2	8	3032833	3032840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_009438	AATT	2	8	3032859	3032866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_009438	ACT	2	6	3032897	3032902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8103	NC_009438	GGT	2	6	3033045	3033050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_009438	ATA	2	6	3033079	3033084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_009438	ACAT	2	8	3033130	3033137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8106	NC_009438	AGA	2	6	3033167	3033172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_009438	GCC	2	6	3034556	3034561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_009438	CCA	2	6	3034568	3034573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_009438	CGAA	2	8	3034623	3034630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_009438	AC	3	6	3034631	3034636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_009438	TTA	2	6	3034660	3034665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_009438	GA	3	6	3034708	3034713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_009438	TTA	2	6	3037617	3037622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_009438	CCATA	2	10	3049470	3049479	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8115	NC_009438	ACAA	2	8	3049532	3049539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8116	NC_009438	TAT	2	6	3049547	3049552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_009438	A	6	6	3049553	3049558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_009438	AAATA	2	10	3049563	3049572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_009438	T	6	6	3049573	3049578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_009438	A	6	6	3049617	3049622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_009438	T	6	6	3049623	3049628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_009438	GTT	2	6	3049753	3049758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8124	NC_009438	AAT	2	6	3054438	3054443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_009438	ACATT	2	10	3054498	3054507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8126	NC_009438	TAGAC	2	10	3055198	3055207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8127	NC_009438	ATGG	2	8	3055270	3055277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_009438	TTTA	2	8	3059494	3059501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_009438	TGA	2	6	3059535	3059540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_009438	TTA	2	6	3059574	3059579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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