MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 14171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009380	GCC	2	6	3582067	3582072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_009380	GA	3	6	3582099	3582104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_009380	CGG	2	6	3582316	3582321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_009380	CGG	2	6	3582325	3582330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_009380	GGT	2	6	3582333	3582338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_009380	CCG	2	6	3582352	3582357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_009380	GT	3	6	3582434	3582439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_009380	CGC	2	6	3582448	3582453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_009380	CTGC	2	8	3582462	3582469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_009380	CCG	2	6	3582470	3582475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_009380	TGGG	2	8	3582502	3582509	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_009380	CGG	2	6	3582515	3582520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_009380	CCCA	2	8	3582525	3582532	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10014	NC_009380	TCC	2	6	3585153	3585158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_009380	GATCG	2	10	3585186	3585195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10016	NC_009380	ACC	2	6	3585287	3585292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_009380	CGC	2	6	3585330	3585335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_009380	CAC	2	6	3585418	3585423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_009380	GTG	2	6	3585451	3585456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_009380	GC	3	6	3585534	3585539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_009380	CAC	2	6	3585646	3585651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_009380	CGT	2	6	3585660	3585665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_009380	AGCGC	2	10	3585669	3585678	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10024	NC_009380	GCG	2	6	3585712	3585717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_009380	GAC	2	6	3585756	3585761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_009380	GCG	2	6	3585810	3585815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_009380	GTG	2	6	3585836	3585841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009380	GC	3	6	3585870	3585875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_009380	CGT	2	6	3585910	3585915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_009380	GGTC	2	8	3585916	3585923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_009380	ATC	2	6	3585971	3585976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_009380	GCC	2	6	3586067	3586072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_009380	CGC	2	6	3586135	3586140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_009380	CGA	2	6	3586203	3586208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_009380	GCG	3	9	3586247	3586255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_009380	CCGA	2	8	3592016	3592023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_009380	CCG	2	6	3592051	3592056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_009380	GCC	3	9	3596415	3596423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_009380	CCG	2	6	3597277	3597282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_009380	CAC	2	6	3597288	3597293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_009380	GCCC	2	8	3597296	3597303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10042	NC_009380	CGCC	2	8	3597346	3597353	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10043	NC_009380	CGG	2	6	3597384	3597389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_009380	CGGC	2	8	3597402	3597409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_009380	CAA	2	6	3598487	3598492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_009380	CGA	2	6	3598586	3598591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_009380	GAC	2	6	3598638	3598643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_009380	CCG	2	6	3598668	3598673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_009380	CCA	2	6	3598698	3598703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_009380	GGC	2	6	3598711	3598716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_009380	C	6	6	3598723	3598728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10052	NC_009380	CCA	2	6	3599213	3599218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_009380	CGG	2	6	3599253	3599258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_009380	ACG	2	6	3599280	3599285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_009380	CGC	2	6	3599300	3599305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_009380	CTG	2	6	3599394	3599399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_009380	CGG	2	6	3599414	3599419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_009380	CGC	2	6	3599426	3599431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_009380	CGC	2	6	3603341	3603346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_009380	CGG	2	6	3604414	3604419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_009380	CGT	2	6	3604460	3604465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_009380	CGC	2	6	3604484	3604489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_009380	GGC	2	6	3604492	3604497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_009380	TCA	2	6	3606022	3606027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_009380	CGC	2	6	3606067	3606072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_009380	AC	3	6	3606076	3606081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_009380	ATG	2	6	3606104	3606109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_009380	TCG	2	6	3606247	3606252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_009380	ACCAG	2	10	3606299	3606308	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10070	NC_009380	CCG	3	9	3606358	3606366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_009380	CGT	2	6	3607224	3607229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_009380	GGC	2	6	3607268	3607273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_009380	CCA	2	6	3607279	3607284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_009380	TCGA	2	8	3607313	3607320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_009380	TCG	2	6	3607332	3607337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_009380	ACCC	2	8	3608660	3608667	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10077	NC_009380	CCG	2	6	3608694	3608699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_009380	GGCCC	2	10	3608717	3608726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10079	NC_009380	GAG	2	6	3608739	3608744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_009380	CTGG	2	8	3608745	3608752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10081	NC_009380	CCG	2	6	3611930	3611935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_009380	GCG	2	6	3611946	3611951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_009380	CGA	2	6	3611991	3611996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_009380	CGG	2	6	3612000	3612005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_009380	GTC	2	6	3612009	3612014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_009380	GAC	2	6	3612024	3612029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_009380	CCT	2	6	3617036	3617041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10088	NC_009380	AGGC	2	8	3617070	3617077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10089	NC_009380	CCT	2	6	3617097	3617102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_009380	CTG	2	6	3617251	3617256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_009380	GCC	3	9	3617298	3617306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_009380	ATCA	2	8	3617319	3617326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_009380	GCG	2	6	3617329	3617334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_009380	AAC	2	6	3617345	3617350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_009380	GC	3	6	3617375	3617380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_009380	GAG	2	6	3617490	3617495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_009380	GCA	2	6	3617500	3617505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_009380	GT	3	6	3617511	3617516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_009380	CTG	2	6	3617522	3617527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_009380	CTT	2	6	3617545	3617550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_009380	TGG	2	6	3617563	3617568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_009380	CCACC	2	10	3617621	3617630	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10103	NC_009380	AAG	2	6	3617643	3617648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_009380	CCA	2	6	3618300	3618305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_009380	GCC	2	6	3618375	3618380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_009380	GGC	2	6	3618381	3618386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_009380	TGACG	2	10	3618532	3618541	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10108	NC_009380	CG	3	6	3619670	3619675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_009380	GAT	2	6	3620618	3620623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_009380	ATG	2	6	3620706	3620711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009380	GGT	3	9	3621286	3621294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_009380	CCGGT	2	10	3621371	3621380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10113	NC_009380	CT	3	6	3621386	3621391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_009380	CAA	2	6	3624939	3624944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_009380	GTG	2	6	3625040	3625045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_009380	TGT	2	6	3625047	3625052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_009380	CTA	2	6	3625080	3625085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_009380	GCTC	2	8	3626045	3626052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_009380	TC	3	6	3627517	3627522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_009380	CGGC	2	8	3627591	3627598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_009380	CCG	2	6	3627608	3627613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_009380	CGT	2	6	3627618	3627623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_009380	G	7	7	3627624	3627630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_009380	CG	3	6	3627645	3627650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_009380	CCGC	2	8	3627664	3627671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10126	NC_009380	GC	3	6	3627703	3627708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_009380	GAA	2	6	3627764	3627769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_009380	AGC	2	6	3627791	3627796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_009380	GTG	2	6	3628748	3628753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_009380	GGTGC	2	10	3628754	3628763	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10131	NC_009380	GAT	2	6	3628787	3628792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_009380	TCGT	2	8	3628807	3628814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10247	NC_009380	GCAC	2	8	3687101	3687108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10248	NC_009380	GAT	2	6	3687110	3687115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10250	NC_009380	CCGTC	2	10	3691001	3691010	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10251	NC_009380	TGC	2	6	3691021	3691026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10253	NC_009380	CCCG	2	8	3691071	3691078	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10254	NC_009380	C	6	6	3691093	3691098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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