MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 14171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009380	GTC	2	6	3148300	3148305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_009380	CGG	2	6	3148312	3148317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_009380	GGAA	2	8	3148346	3148353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_009380	GC	3	6	3148618	3148623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9005	NC_009380	CGA	2	6	3148695	3148700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_009380	GC	3	6	3148757	3148762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_009380	GGC	2	6	3160879	3160884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_009380	GCA	2	6	3185289	3185294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_009380	AG	3	6	3185306	3185311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_009380	CTT	2	6	3185312	3185317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_009380	TTG	2	6	3185324	3185329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_009380	GTT	2	6	3185330	3185335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_009380	GCG	2	6	3185353	3185358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_009380	CACC	2	8	3185465	3185472	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9015	NC_009380	GTAC	2	8	3185529	3185536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9016	NC_009380	GGT	2	6	3185593	3185598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_009380	CCA	2	6	3185606	3185611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_009380	GCC	2	6	3186702	3186707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_009380	TGGC	2	8	3186719	3186726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9020	NC_009380	TCG	2	6	3186750	3186755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_009380	AGG	2	6	3186783	3186788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_009380	GCG	2	6	3186803	3186808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_009380	CG	3	6	3186807	3186812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9024	NC_009380	CAG	2	6	3186878	3186883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_009380	CGC	3	9	3186887	3186895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9026	NC_009380	CGG	2	6	3186902	3186907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_009380	GCT	2	6	3186919	3186924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_009380	ATC	2	6	3186957	3186962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_009380	CG	3	6	3187029	3187034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_009380	GCA	2	6	3187679	3187684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_009380	TGTT	2	8	3187772	3187779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_009380	GGCA	2	8	3187783	3187790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9033	NC_009380	A	7	7	3187793	3187799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_009380	CA	3	6	3187801	3187806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_009380	AC	3	6	3187811	3187816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_009380	CTC	2	6	3193042	3193047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9037	NC_009380	ACG	2	6	3200296	3200301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_009380	GT	3	6	3200315	3200320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_009380	CAA	2	6	3203043	3203048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_009380	CGG	2	6	3203098	3203103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_009380	C	6	6	3203109	3203114	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9042	NC_009380	AGG	2	6	3206148	3206153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_009380	CG	3	6	3206393	3206398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_009380	CCCG	2	8	3206404	3206411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9045	NC_009380	CGTC	2	8	3206425	3206432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_009380	GAG	2	6	3206434	3206439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_009380	CGT	2	6	3210422	3210427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_009380	GCG	2	6	3210428	3210433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_009380	CGC	2	6	3210443	3210448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9050	NC_009380	CGC	2	6	3210459	3210464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9051	NC_009380	CCGT	2	8	3211495	3211502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9052	NC_009380	TGAC	2	8	3211529	3211536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9053	NC_009380	GTGTT	2	10	3211585	3211594	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_009380	TGT	2	6	3211595	3211600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_009380	AGAC	2	8	3211621	3211628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_009380	GAG	2	6	3211638	3211643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_009380	TCG	2	6	3212493	3212498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_009380	GAG	2	6	3212530	3212535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_009380	TGG	2	6	3213565	3213570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_009380	GCC	2	6	3215690	3215695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9061	NC_009380	CCGG	2	8	3215700	3215707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_009380	GCG	2	6	3218257	3218262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_009380	TTGCT	2	10	3236707	3236716	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9064	NC_009380	GTAGA	2	10	3236773	3236782	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_009380	TACT	2	8	3236793	3236800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9066	NC_009380	CA	3	6	3236809	3236814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9067	NC_009380	AGC	2	6	3236828	3236833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_009380	GGC	2	6	3236840	3236845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_009380	CAC	2	6	3236870	3236875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_009380	CCTG	2	8	3237636	3237643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9071	NC_009380	GT	3	6	3237649	3237654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_009380	CGG	2	6	3237676	3237681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9074	NC_009380	CGC	2	6	3239437	3239442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9075	NC_009380	CTC	2	6	3239926	3239931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9076	NC_009380	TAC	2	6	3239940	3239945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9078	NC_009380	CGTC	2	8	3239977	3239984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9079	NC_009380	ACG	2	6	3239999	3240004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_009380	GCG	2	6	3240059	3240064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_009380	CAA	2	6	3240098	3240103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_009380	ACACC	2	10	3240107	3240116	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9083	NC_009380	CCT	2	6	3241506	3241511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_009380	GAG	2	6	3242810	3242815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9087	NC_009380	GTACC	2	10	3243310	3243319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9088	NC_009380	CGT	3	9	3243354	3243362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9090	NC_009380	CCT	2	6	3243467	3243472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9092	NC_009380	CGGC	2	8	3244022	3244029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9093	NC_009380	ACG	2	6	3244069	3244074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9095	NC_009380	GTC	3	9	3244125	3244133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9097	NC_009380	CGA	2	6	3244234	3244239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_009380	CCT	2	6	3244284	3244289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9099	NC_009380	CCG	3	9	3244342	3244350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9100	NC_009380	GC	3	6	3244499	3244504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9101	NC_009380	TGTCGG	2	12	3244506	3244517	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9102	NC_009380	GTGTC	2	10	3244551	3244560	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9103	NC_009380	CCG	2	6	3244566	3244571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_009380	GACAC	2	10	3244590	3244599	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9105	NC_009380	AC	4	8	3244596	3244603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_009380	TCG	2	6	3245823	3245828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9108	NC_009380	GCCAAT	2	12	3247871	3247882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_009380	TCG	2	6	3247895	3247900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_009380	AC	3	6	3247910	3247915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9111	NC_009380	TCT	2	6	3247944	3247949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_009380	CACC	2	8	3249227	3249234	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9113	NC_009380	CA	3	6	3249269	3249274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_009380	CA	3	6	3249285	3249290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9115	NC_009380	AGG	2	6	3249350	3249355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_009380	GAC	2	6	3249358	3249363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9118	NC_009380	TGAG	2	8	3251229	3251236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_009380	CGT	2	6	3251537	3251542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_009380	GCCG	2	8	3251546	3251553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9121	NC_009380	GTG	2	6	3251562	3251567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_009380	CGT	2	6	3251576	3251581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9124	NC_009380	CCG	2	6	3251631	3251636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9125	NC_009380	CGG	2	6	3251663	3251668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_009380	TCC	2	6	3252776	3252781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9127	NC_009380	TCGT	2	8	3254065	3254072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9128	NC_009380	CCG	2	6	3254128	3254133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9129	NC_009380	GC	3	6	3254180	3254185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9131	NC_009380	GCA	2	6	3254220	3254225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_009380	TGA	2	6	3254246	3254251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9258	NC_009380	ATGT	2	8	3286682	3286689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9259	NC_009380	ATC	2	6	3286804	3286809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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