MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009092	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009092	GAT	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009092	TCT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009092	CGA	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009092	GA	3	6	3772	3777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009092	T	6	6	6238	6243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009092	A	6	6	9461	9466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009092	T	6	6	9485	9490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009092	CTA	2	6	12497	12502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009092	TTG	2	6	12540	12545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009092	T	6	6	12566	12571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009092	CGG	2	6	12579	12584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009092	A	6	6	12594	12599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009092	TTG	2	6	13922	13927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009092	A	7	7	13949	13955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009092	TTGG	2	8	17284	17291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009092	AG	3	6	17310	17315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009092	TGA	2	6	17450	17455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009092	AT	3	6	17456	17461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009092	GCT	2	6	17490	17495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009092	GGA	2	6	17560	17565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009092	AGA	2	6	18140	18145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009092	CAG	2	6	19539	19544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009092	TGG	2	6	19545	19550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009092	GTA	2	6	19585	19590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009092	ACT	2	6	19657	19662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009092	TACT	2	8	19719	19726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009092	CTG	2	6	19761	19766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009092	A	6	6	19800	19805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009092	TTCC	2	8	21025	21032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009092	CCAC	2	8	23218	23225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009092	CAG	2	6	23265	23270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009092	CAT	2	6	23273	23278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009092	TGC	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009092	AGA	2	6	23472	23477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009092	AAT	2	6	25581	25586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009092	CT	3	6	27918	27923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009092	ATTA	2	8	27932	27939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009092	ATT	2	6	27941	27946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009092	CAGC	2	8	27980	27987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009092	TGG	2	6	28074	28079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009092	TGC	2	6	28138	28143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009092	CT	3	6	28154	28159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009092	CT	3	6	28723	28728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009092	CTTG	2	8	28769	28776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009092	ATC	2	6	31057	31062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009092	TGT	2	6	31082	31087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009092	AT	3	6	31100	31105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009092	TTAT	2	8	31109	31116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009092	GTC	2	6	31152	31157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009092	TGG	2	6	31168	31173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009092	CAA	2	6	31210	31215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009092	GCT	2	6	31227	31232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009092	ATGG	2	8	31971	31978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009092	A	6	6	31989	31994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009092	A	6	6	32021	32026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009092	CTG	2	6	32067	32072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009092	TGT	2	6	32842	32847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009092	TGA	2	6	32853	32858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009092	AAT	2	6	32925	32930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009092	TCA	2	6	32977	32982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009092	A	6	6	33015	33020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009092	T	6	6	33057	33062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009092	TAAAAA	2	12	33079	33090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009092	TCT	2	6	33122	33127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009092	T	7	7	33169	33175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009092	T	6	6	33225	33230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009092	TAA	2	6	37603	37608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009092	A	6	6	37717	37722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009092	TTAT	2	8	37748	37755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009092	TAA	3	9	37771	37779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009092	A	7	7	39642	39648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009092	GGCCT	2	10	39652	39661	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009092	T	7	7	39664	39670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009092	TGA	2	6	40509	40514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009092	ATA	2	6	40528	40533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009092	GGC	2	6	40554	40559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009092	ATA	2	6	40588	40593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009092	AAC	2	6	40604	40609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009092	TTG	2	6	40618	40623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009092	GCC	2	6	40654	40659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009092	AAGG	2	8	40695	40702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009092	GAA	2	6	42437	42442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009092	CGCC	2	8	43319	43326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009092	GTAA	2	8	43348	43355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009092	TTG	2	6	43392	43397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009092	GCT	2	6	43443	43448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009092	GCG	2	6	45935	45940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009092	CGG	2	6	45990	45995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009092	ATC	2	6	45998	46003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009092	CAG	2	6	46064	46069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009092	CAA	2	6	46085	46090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009092	AGCCT	2	10	46181	46190	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009092	TTA	2	6	46301	46306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009092	TG	3	6	47034	47039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009092	AAAC	2	8	47043	47050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009092	ATT	2	6	47056	47061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009092	T	7	7	47108	47114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009092	TCT	2	6	47170	47175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009092	TAA	2	6	47191	47196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009092	A	6	6	47195	47200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009092	TAA	2	6	47213	47218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009092	CGG	2	6	47277	47282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009092	CTCAA	2	10	50581	50590	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009092	TCTA	2	8	51349	51356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009092	C	6	6	51597	51602	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_009092	AAT	2	6	51648	51653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009092	TTA	2	6	51722	51727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009092	CGG	2	6	56053	56058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009092	TCT	2	6	56091	56096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009092	TACT	2	8	58200	58207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009092	AAG	2	6	58237	58242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009092	T	6	6	58260	58265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009092	GT	3	6	58266	58271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009092	CTCG	2	8	58284	58291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009092	TAG	2	6	59057	59062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009092	TTGT	2	8	59170	59177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009092	ATG	2	6	59355	59360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009092	TGG	2	6	59364	59369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009092	GA	3	6	59391	59396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009092	AGG	2	6	60994	60999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009092	CCT	2	6	61007	61012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009092	T	6	6	61012	61017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009092	TAC	2	6	63733	63738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009092	TG	3	6	63755	63760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009092	TGA	2	6	65733	65738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009092	AAC	2	6	66983	66988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009092	CAG	2	6	67070	67075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009092	GAT	2	6	69574	69579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009092	GT	3	6	69865	69870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009092	TGA	2	6	72729	72734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009092	T	7	7	74485	74491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009092	T	6	6	74539	74544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009092	AAC	3	9	74567	74575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009092	T	6	6	74678	74683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009092	CTT	2	6	74724	74729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009092	A	6	6	74765	74770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009092	ATC	2	6	74845	74850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009092	CAA	2	6	78571	78576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009092	CGC	2	6	79617	79622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009092	CGG	2	6	79669	79674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009092	T	7	7	79679	79685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009092	CTG	2	6	79690	79695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009092	CTG	2	6	79704	79709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009092	AG	3	6	79753	79758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009092	GCT	2	6	79761	79766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009092	TAA	2	6	80780	80785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009092	GTT	2	6	80872	80877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009092	T	6	6	80876	80881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009092	GGA	2	6	83597	83602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_009092	TAA	2	6	84865	84870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009092	TGC	2	6	84873	84878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_009092	TTAT	2	8	86769	86776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_009092	GCC	2	6	88412	88417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_009092	T	6	6	147793	147798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_009092	TAC	2	6	148960	148965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_009092	GT	3	6	149095	149100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_009092	ATT	2	6	150514	150519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009092	TGA	2	6	150539	150544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_009092	T	6	6	162318	162323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_009092	ATT	2	6	163356	163361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_009092	AGAT	2	8	164718	164725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
425	NC_009092	GTAA	2	8	164750	164757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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