MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009092	TGTCA	2	10	1417184	1417193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3502	NC_009092	AATA	2	8	1417221	1417228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_009092	TTAC	2	8	1420512	1420519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_009092	TGA	2	6	1420529	1420534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009092	T	8	8	1420559	1420566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_009092	TGT	2	6	1420649	1420654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_009092	TTA	2	6	1420666	1420671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_009092	TCC	2	6	1420686	1420691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_009092	GAG	2	6	1420853	1420858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009092	AT	3	6	1421303	1421308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009092	CTA	2	6	1421318	1421323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009092	A	6	6	1421351	1421356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009092	CTT	2	6	1421371	1421376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_009092	T	6	6	1421375	1421380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009092	CGGA	2	8	1421383	1421390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_009092	TTA	2	6	1422665	1422670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009092	GTTT	2	8	1422828	1422835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009092	TAA	2	6	1422836	1422841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009092	CA	3	6	1422886	1422891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_009092	T	7	7	1422903	1422909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009092	T	6	6	1426330	1426335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009092	GA	3	6	1426435	1426440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_009092	GAA	2	6	1426442	1426447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_009092	GCC	2	6	1428507	1428512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_009092	A	6	6	1429244	1429249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009092	CCT	2	6	1429274	1429279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_009092	CCT	2	6	1429287	1429292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_009092	TGC	2	6	1429403	1429408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_009092	GC	3	6	1429479	1429484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_009092	TGCC	2	8	1430030	1430037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_009092	GCT	2	6	1430043	1430048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_009092	TCA	2	6	1430070	1430075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_009092	CGC	2	6	1430084	1430089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_009092	T	7	7	1430104	1430110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_009092	ATCTC	2	10	1430111	1430120	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3536	NC_009092	CATT	2	8	1430171	1430178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_009092	T	6	6	1430177	1430182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_009092	AT	3	6	1430331	1430336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009092	TTG	2	6	1430366	1430371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009092	CGC	2	6	1430429	1430434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_009092	GAG	2	6	1430437	1430442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009092	CTT	2	6	1432376	1432381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_009092	TTG	2	6	1432422	1432427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009092	TTAAC	2	10	1435796	1435805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3545	NC_009092	GCTGTT	2	12	1435872	1435883	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3546	NC_009092	T	7	7	1435882	1435888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_009092	CTG	2	6	1435889	1435894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_009092	ATA	2	6	1437913	1437918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_009092	TGC	2	6	1437925	1437930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_009092	TGAA	2	8	1437942	1437949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_009092	TTG	2	6	1440378	1440383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_009092	CCCT	2	8	1440452	1440459	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3553	NC_009092	GATT	2	8	1440499	1440506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009092	CGC	2	6	1440571	1440576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_009092	TAG	2	6	1440607	1440612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_009092	TA	3	6	1440650	1440655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_009092	A	8	8	1440667	1440674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_009092	T	6	6	1440691	1440696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_009092	ATT	2	6	1440717	1440722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_009092	T	6	6	1441148	1441153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_009092	GCT	2	6	1441236	1441241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_009092	A	8	8	1441758	1441765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_009092	AAGA	2	8	1441794	1441801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_009092	TTGA	2	8	1442911	1442918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_009092	GTT	2	6	1442952	1442957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_009092	TATT	2	8	1442998	1443005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_009092	A	6	6	1443227	1443232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_009092	CTG	2	6	1443274	1443279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_009092	GC	3	6	1443290	1443295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_009092	CTAG	2	8	1443852	1443859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_009092	TTA	2	6	1443870	1443875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_009092	TA	3	6	1444886	1444891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_009092	TA	4	8	1444914	1444921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_009092	T	6	6	1447871	1447876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_009092	TGC	2	6	1447906	1447911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_009092	GATA	2	8	1447927	1447934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_009092	A	6	6	1447936	1447941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_009092	TGG	2	6	1448002	1448007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_009092	TTTCT	2	10	1448162	1448171	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3581	NC_009092	GTAAC	2	10	1448927	1448936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_009092	TG	3	6	1448978	1448983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_009092	GATT	2	8	1450504	1450511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_009092	TGTT	2	8	1450653	1450660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_009092	TG	4	8	1450689	1450696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_009092	ATA	2	6	1450704	1450709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_009092	TGGT	2	8	1450731	1450738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_009092	ATT	2	6	1450757	1450762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_009092	TAAC	2	8	1450786	1450793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_009092	GGT	2	6	1451477	1451482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_009092	AG	3	6	1452307	1452312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_009092	TGA	2	6	1452947	1452952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_009092	GAA	2	6	1453507	1453512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_009092	AGA	2	6	1453905	1453910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_009092	TGA	2	6	1453927	1453932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_009092	CCT	2	6	1454431	1454436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_009092	AT	4	8	1454469	1454476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_009092	AGG	2	6	1454516	1454521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_009092	TGA	2	6	1454570	1454575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_009092	GAT	2	6	1454861	1454866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_009092	AAT	2	6	1455323	1455328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_009092	ATG	2	6	1455403	1455408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_009092	TCT	2	6	1455434	1455439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_009092	GAT	2	6	1455545	1455550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_009092	GGC	2	6	1460383	1460388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_009092	GCA	2	6	1460406	1460411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_009092	ATT	2	6	1460420	1460425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_009092	GTT	2	6	1460430	1460435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_009092	TAGA	2	8	1460872	1460879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009092	TA	4	8	1460920	1460927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_009092	GTT	2	6	1460953	1460958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_009092	A	6	6	1460975	1460980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_009092	TGA	2	6	1460986	1460991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_009092	TGA	2	6	1464051	1464056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_009092	AAG	2	6	1465045	1465050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_009092	CAA	2	6	1465107	1465112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_009092	AGCTTG	2	12	1465146	1465157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3618	NC_009092	AC	3	6	1465254	1465259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_009092	TTA	2	6	1465273	1465278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_009092	TCG	2	6	1465280	1465285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_009092	TC	3	6	1465335	1465340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_009092	TCT	3	9	1465364	1465372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_009092	ATA	2	6	1465427	1465432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_009092	TTCG	2	8	1465501	1465508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_009092	GAT	2	6	1466813	1466818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_009092	ATC	2	6	1466850	1466855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_009092	A	6	6	1466954	1466959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_009092	TGG	2	6	1466990	1466995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_009092	GGC	2	6	1466997	1467002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_009092	CAA	2	6	1467072	1467077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_009092	GCT	2	6	1467227	1467232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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