MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009092	AT	3	6	680767	680772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009092	GATA	2	8	680850	680857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009092	TGC	2	6	681017	681022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_009092	A	6	6	681038	681043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009092	GCG	2	6	681263	681268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_009092	TTTC	2	8	682165	682172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_009092	CGTT	2	8	682751	682758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_009092	GGCG	2	8	684301	684308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_009092	GC	3	6	684384	684389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_009092	GCC	2	6	684425	684430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_009092	GAC	2	6	684436	684441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_009092	GAC	2	6	684860	684865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_009092	TCGC	2	8	684872	684879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_009092	A	6	6	684888	684893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009092	CAG	2	6	684897	684902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_009092	TCC	2	6	688745	688750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_009092	CA	3	6	688775	688780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_009092	TCCC	2	8	688798	688805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1519	NC_009092	AGG	2	6	688808	688813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009092	G	6	6	688872	688877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_009092	A	6	6	688915	688920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009092	TAA	2	6	688960	688965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009092	CCTAG	2	10	689662	689671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1524	NC_009092	AGT	2	6	689801	689806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009092	TCA	2	6	691811	691816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_009092	ATCC	2	8	691865	691872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_009092	CGA	2	6	691882	691887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_009092	TG	3	6	692070	692075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009092	GGT	2	6	692818	692823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_009092	AGG	2	6	692859	692864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009092	AGAC	2	8	693322	693329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_009092	GCG	2	6	693421	693426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_009092	GATA	2	8	693508	693515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_009092	ATT	2	6	693603	693608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_009092	GGC	2	6	693633	693638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_009092	ATT	2	6	693752	693757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009092	ACCCC	2	10	693813	693822	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1538	NC_009092	T	7	7	693856	693862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009092	TAA	2	6	693887	693892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009092	CCTG	2	8	693961	693968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_009092	TTC	2	6	697531	697536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_009092	TAA	2	6	697595	697600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009092	A	6	6	697599	697604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_009092	T	6	6	697625	697630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009092	TAT	2	6	700932	700937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009092	GC	3	6	700963	700968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_009092	TG	3	6	701004	701009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009092	TTTG	2	8	701023	701030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009092	GGC	2	6	701048	701053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_009092	GGC	2	6	701079	701084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_009092	A	7	7	701130	701136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009092	GCTC	2	8	701164	701171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_009092	ATAG	2	8	701746	701753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009092	A	6	6	701942	701947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_009092	TA	3	6	704054	704059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009092	TA	4	8	704088	704095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009092	CATT	2	8	704173	704180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_009092	A	6	6	704201	704206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009092	AGC	2	6	704210	704215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_009092	GGC	3	9	706580	706588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_009092	GGC	2	6	707012	707017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009092	TGT	2	6	707030	707035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009092	GAA	2	6	707694	707699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009092	GCT	2	6	707728	707733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_009092	CTC	2	6	708582	708587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_009092	ATA	2	6	709109	709114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_009092	TTGAGA	2	12	712777	712788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_009092	CTT	2	6	712815	712820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_009092	ATA	2	6	712824	712829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009092	ATA	2	6	712893	712898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009092	GAT	2	6	712933	712938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009092	TGA	2	6	712975	712980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009092	ATA	2	6	712982	712987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009092	GCC	2	6	721795	721800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_009092	GAA	2	6	722261	722266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_009092	ATT	2	6	722392	722397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_009092	A	7	7	722429	722435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009092	GCC	2	6	723225	723230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_009092	AAG	2	6	723262	723267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_009092	TAAA	2	8	724525	724532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_009092	T	7	7	724608	724614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_009092	A	6	6	724624	724629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_009092	TA	3	6	728881	728886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_009092	GCT	2	6	733881	733886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_009092	AT	3	6	739978	739983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009092	AAT	2	6	740038	740043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009092	GTT	2	6	740065	740070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009092	ATT	2	6	740071	740076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009092	TAC	2	6	740731	740736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_009092	GTTT	2	8	740752	740759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_009092	T	7	7	740761	740767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_009092	TAT	2	6	740782	740787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009092	ATT	2	6	740794	740799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009092	T	6	6	740813	740818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009092	TA	3	6	740826	740831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009092	GGCA	2	8	740881	740888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_009092	GAC	2	6	740942	740947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_009092	GCC	2	6	741016	741021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_009092	CT	3	6	741049	741054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_009092	CT	3	6	741077	741082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_009092	CTT	2	6	745570	745575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_009092	AT	3	6	748014	748019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_009092	AGC	2	6	748044	748049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_009092	ATT	2	6	748076	748081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009092	AT	3	6	748092	748097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009092	TTA	2	6	748105	748110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009092	GT	4	8	748170	748177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009092	TTG	2	6	748200	748205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_009092	A	6	6	748231	748236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009092	TGGC	2	8	748248	748255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_009092	T	7	7	751646	751652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009092	ATG	2	6	751976	751981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_009092	TA	3	6	751984	751989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_009092	CCA	2	6	752078	752083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_009092	A	6	6	752105	752110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_009092	ATTTT	2	10	752143	752152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_009092	A	6	6	752164	752169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009092	T	6	6	752185	752190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009092	CGT	2	6	755064	755069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_009092	TTG	2	6	755075	755080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009092	ATTTC	2	10	755182	755191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_009092	TCAC	2	8	755227	755234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_009092	T	6	6	755307	755312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_009092	GCA	2	6	757222	757227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_009092	GCG	2	6	759675	759680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_009092	T	6	6	759721	759726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_009092	T	7	7	759740	759746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_009092	TTG	2	6	759812	759817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_009092	GCC	2	6	759879	759884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_009092	CTG	2	6	759935	759940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_009092	TAAT	2	8	759949	759956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_009092	TA	3	6	760032	760037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_009092	TTCTT	2	10	760053	760062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1634	NC_009092	TGG	2	6	760084	760089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_009092	CG	3	6	760128	760133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_009092	T	7	7	761949	761955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_009092	T	6	6	762512	762517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_009092	GCG	2	6	764103	764108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1957	NC_009092	TTC	2	6	866271	866276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1958	NC_009092	ATT	2	6	866298	866303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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