MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009092	CGC	2	6	4273796	4273801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_009092	TGA	2	6	4273872	4273877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_009092	AGA	2	6	4274620	4274625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_009092	CAA	2	6	4274803	4274808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_009092	CTC	2	6	4274820	4274825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_009092	ATCA	2	8	4274826	4274833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_009092	CCCCAT	2	12	4274865	4274876	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_009092	CGC	2	6	4274889	4274894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_009092	GGGCT	2	10	4276460	4276469	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11011	NC_009092	GTTA	2	8	4276486	4276493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_009092	GTTA	2	8	4276498	4276505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_009092	GTTA	2	8	4276510	4276517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_009092	A	6	6	4276583	4276588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_009092	CGA	2	6	4276606	4276611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_009092	ATC	2	6	4279503	4279508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_009092	TGT	2	6	4279548	4279553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_009092	CG	3	6	4279563	4279568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11019	NC_009092	GAC	2	6	4279616	4279621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_009092	AGA	2	6	4281610	4281615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_009092	GCT	2	6	4281637	4281642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_009092	ACA	2	6	4284675	4284680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_009092	GAA	3	9	4284790	4284798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_009092	A	7	7	4285764	4285770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11029	NC_009092	TAGA	2	8	4292173	4292180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_009092	CGC	2	6	4292220	4292225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11031	NC_009092	TTG	2	6	4292261	4292266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11035	NC_009092	CCG	2	6	4295713	4295718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11037	NC_009092	T	6	6	4301414	4301419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11040	NC_009092	AAAG	2	8	4302387	4302394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11042	NC_009092	AGCC	2	8	4302543	4302550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11047	NC_009092	AACT	2	8	4306066	4306073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11048	NC_009092	TTA	2	6	4306109	4306114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11050	NC_009092	TAT	2	6	4306190	4306195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11052	NC_009092	A	6	6	4307208	4307213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_009092	T	6	6	4307229	4307234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11055	NC_009092	A	6	6	4308015	4308020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_009092	TAC	2	6	4308025	4308030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_009092	TTA	2	6	4309753	4309758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11060	NC_009092	ATT	2	6	4318892	4318897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11062	NC_009092	T	6	6	4319099	4319104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_009092	T	7	7	4320470	4320476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_009092	CA	3	6	4320498	4320503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11069	NC_009092	GGTAAT	2	12	4322248	4322259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11073	NC_009092	ACA	2	6	4324281	4324286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_009092	T	6	6	4325973	4325978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11084	NC_009092	CCCG	2	8	4326765	4326772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11085	NC_009092	TAAC	2	8	4328049	4328056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11086	NC_009092	TTA	2	6	4328885	4328890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_009092	C	6	6	4331606	4331611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11093	NC_009092	AGA	2	6	4331632	4331637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_009092	CAT	2	6	4331646	4331651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11098	NC_009092	AAC	2	6	4331796	4331801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_009092	AC	3	6	4331822	4331827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_009092	TG	3	6	4332130	4332135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_009092	A	6	6	4332148	4332153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_009092	CGT	2	6	4334561	4334566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_009092	AG	3	6	4334575	4334580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_009092	GCC	2	6	4334587	4334592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_009092	TC	3	6	4334673	4334678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11106	NC_009092	ATC	2	6	4336563	4336568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_009092	GC	3	6	4336577	4336582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_009092	AGGC	2	8	4336720	4336727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11109	NC_009092	TC	3	6	4337214	4337219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11110	NC_009092	CAA	2	6	4337229	4337234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_009092	CCGC	2	8	4337247	4337254	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11112	NC_009092	ATA	2	6	4337276	4337281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11114	NC_009092	AAGCC	2	10	4337337	4337346	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11115	NC_009092	CGC	2	6	4337475	4337480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11116	NC_009092	TGAA	2	8	4337486	4337493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_009092	AG	3	6	4337610	4337615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_009092	CTC	2	6	4339689	4339694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11121	NC_009092	GC	3	6	4339815	4339820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11128	NC_009092	A	6	6	4342820	4342825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11391	NC_009092	TCAA	2	8	4434846	4434853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11392	NC_009092	AC	3	6	4434966	4434971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11393	NC_009092	AGC	2	6	4435165	4435170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11394	NC_009092	ATC	2	6	4435179	4435184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11395	NC_009092	ACG	2	6	4435219	4435224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11396	NC_009092	TGA	2	6	4435299	4435304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11398	NC_009092	ACC	2	6	4435414	4435419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11417	NC_009092	CTAGC	2	10	4436369	4436378	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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11422	NC_009092	CGACT	2	10	4436700	4436709	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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11430	NC_009092	GAG	2	6	4436997	4437002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11431	NC_009092	TCA	2	6	4437050	4437055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11432	NC_009092	GT	3	6	4437074	4437079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11483	NC_009092	GA	3	6	4442169	4442174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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