MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009092	CTAA	2	8	3586866	3586873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_009092	TAT	2	6	3588562	3588567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_009092	AGG	2	6	3588633	3588638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_009092	CAT	2	6	3588679	3588684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_009092	CAG	2	6	3588784	3588789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_009092	AGACAC	2	12	3589574	3589585	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_009092	TCA	2	6	3589590	3589595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_009092	TAGC	2	8	3589601	3589608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9009	NC_009092	AACC	2	8	3589628	3589635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_009092	ACC	2	6	3589641	3589646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_009092	TAA	2	6	3589683	3589688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_009092	GCG	2	6	3590890	3590895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_009092	GCT	2	6	3590901	3590906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_009092	A	6	6	3590929	3590934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_009092	AAT	2	6	3590937	3590942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_009092	CAA	2	6	3592621	3592626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_009092	A	6	6	3592640	3592645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_009092	A	6	6	3595857	3595862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_009092	TCG	2	6	3595943	3595948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_009092	CA	3	6	3596404	3596409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_009092	AAC	2	6	3596589	3596594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_009092	CAA	2	6	3596599	3596604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_009092	A	6	6	3596622	3596627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_009092	ATA	2	6	3596651	3596656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_009092	AC	3	6	3596816	3596821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9026	NC_009092	TAAC	2	8	3596826	3596833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9027	NC_009092	CTA	2	6	3596901	3596906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_009092	ATA	2	6	3596913	3596918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_009092	TAT	2	6	3597022	3597027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_009092	CAT	2	6	3599181	3599186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_009092	TAAA	2	8	3599191	3599198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_009092	A	6	6	3599196	3599201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_009092	TAT	2	6	3599228	3599233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_009092	CCGC	2	8	3599521	3599528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9035	NC_009092	TGAG	2	8	3599563	3599570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_009092	CAA	2	6	3599622	3599627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_009092	AC	3	6	3599651	3599656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_009092	CGC	2	6	3601216	3601221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9039	NC_009092	AGCA	2	8	3601841	3601848	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9040	NC_009092	A	6	6	3601850	3601855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_009092	T	6	6	3601874	3601879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_009092	GGT	2	6	3604115	3604120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_009092	GC	3	6	3604128	3604133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_009092	ACC	2	6	3604251	3604256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9045	NC_009092	CGA	2	6	3604261	3604266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_009092	AGC	2	6	3604270	3604275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_009092	GGT	2	6	3604284	3604289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_009092	AT	3	6	3605913	3605918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_009092	AACCTT	2	12	3605996	3606007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_009092	ACTA	2	8	3606017	3606024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_009092	TA	4	8	3606046	3606053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_009092	CCT	2	6	3606381	3606386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9053	NC_009092	AAG	2	6	3606430	3606435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_009092	CA	3	6	3606509	3606514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9055	NC_009092	TTG	2	6	3608319	3608324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_009092	AGC	2	6	3608357	3608362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_009092	TAG	2	6	3608497	3608502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_009092	GAGCC	2	10	3610932	3610941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9059	NC_009092	A	6	6	3610967	3610972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_009092	AGC	2	6	3611048	3611053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_009092	CT	3	6	3611065	3611070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_009092	CGC	2	6	3611074	3611079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_009092	TCT	2	6	3611159	3611164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_009092	ACCC	2	8	3611166	3611173	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9065	NC_009092	TCA	2	6	3611206	3611211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_009092	TTCG	2	8	3611236	3611243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9067	NC_009092	CCA	2	6	3611254	3611259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_009092	TCT	2	6	3611289	3611294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_009092	CA	3	6	3611304	3611309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9070	NC_009092	CGC	2	6	3611336	3611341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9071	NC_009092	GCG	2	6	3614577	3614582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_009092	CAGG	2	8	3614591	3614598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_009092	CTC	2	6	3614648	3614653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9074	NC_009092	ACC	2	6	3614666	3614671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9075	NC_009092	CCA	2	6	3614687	3614692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9076	NC_009092	T	6	6	3614720	3614725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_009092	GACAC	2	10	3615011	3615020	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9078	NC_009092	TCT	2	6	3615060	3615065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_009092	ACCTC	2	10	3615134	3615143	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9080	NC_009092	CTCTG	2	10	3617380	3617389	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9081	NC_009092	TCAGGC	5	30	3618643	3618672	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_009092	TCA	2	6	3618685	3618690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_009092	CCA	2	6	3618695	3618700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_009092	A	7	7	3618759	3618765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_009092	AGG	2	6	3618810	3618815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_009092	CACCT	2	10	3619163	3619172	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9087	NC_009092	TTGCC	2	10	3619206	3619215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9088	NC_009092	AAAGCC	2	12	3619250	3619261	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_009092	CAAATC	3	18	3619300	3619317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_009092	CGA	2	6	3619367	3619372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9091	NC_009092	CAA	2	6	3619382	3619387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_009092	TAGCCA	2	12	3619390	3619401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9093	NC_009092	TC	3	6	3620557	3620562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9094	NC_009092	CAA	2	6	3621715	3621720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9095	NC_009092	T	6	6	3621754	3621759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_009092	TCA	2	6	3621770	3621775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_009092	TAC	2	6	3623015	3623020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_009092	ATG	2	6	3623047	3623052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_009092	TGC	2	6	3623491	3623496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_009092	CCT	2	6	3624012	3624017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9101	NC_009092	ACCAG	2	10	3624047	3624056	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9102	NC_009092	T	6	6	3624066	3624071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_009092	TCC	2	6	3624121	3624126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_009092	ATC	2	6	3624187	3624192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_009092	GAG	2	6	3624208	3624213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_009092	CTC	2	6	3626447	3626452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9107	NC_009092	CCAT	2	8	3626476	3626483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9108	NC_009092	GCT	2	6	3626538	3626543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_009092	CAAA	2	8	3626591	3626598	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9110	NC_009092	AGCT	2	8	3627252	3627259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9111	NC_009092	AGTT	2	8	3627280	3627287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_009092	AGT	2	6	3627298	3627303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_009092	AT	3	6	3627407	3627412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_009092	ACC	2	6	3627901	3627906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9115	NC_009092	TTTTC	2	10	3627955	3627964	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9116	NC_009092	A	6	6	3627967	3627972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_009092	AC	3	6	3628012	3628017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9118	NC_009092	ACC	2	6	3628973	3628978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9119	NC_009092	AAAC	2	8	3629096	3629103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9120	NC_009092	AAG	2	6	3629136	3629141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_009092	CAA	2	6	3629150	3629155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_009092	GAT	2	6	3630423	3630428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_009092	TAT	2	6	3630505	3630510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_009092	CAC	2	6	3631074	3631079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9125	NC_009092	TTG	2	6	3631083	3631088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_009092	TAA	2	6	3631120	3631125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_009092	GGAT	2	8	3631133	3631140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_009092	AGGTT	2	10	3633909	3633918	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_009092	AGTA	2	8	3633935	3633942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_009092	TAT	2	6	3633988	3633993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9132	NC_009092	T	6	6	3634993	3634998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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