MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009092	GT	3	6	3244124	3244129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_009092	TCA	3	9	3244137	3244145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_009092	TCA	2	6	3244208	3244213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_009092	T	8	8	3244221	3244228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009092	GCA	2	6	3244282	3244287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_009092	AG	3	6	3244623	3244628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_009092	CAA	2	6	3245439	3245444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_009092	GCG	2	6	3245445	3245450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_009092	TTA	2	6	3246237	3246242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_009092	TGTA	2	8	3246298	3246305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_009092	TAT	2	6	3246382	3246387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_009092	CTT	2	6	3246526	3246531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_009092	GTG	2	6	3246532	3246537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_009092	TTG	2	6	3246567	3246572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_009092	TAA	2	6	3246575	3246580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_009092	CAA	2	6	3246602	3246607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_009092	AAACC	2	10	3246622	3246631	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8018	NC_009092	GAA	2	6	3246672	3246677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_009092	CCG	2	6	3246786	3246791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_009092	AGC	2	6	3246847	3246852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_009092	TCC	2	6	3246884	3246889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_009092	AGC	2	6	3246949	3246954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_009092	C	6	6	3246987	3246992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8024	NC_009092	AC	3	6	3247034	3247039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_009092	CAA	2	6	3247041	3247046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_009092	A	6	6	3247097	3247102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_009092	AGG	2	6	3247112	3247117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_009092	GTC	2	6	3247135	3247140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_009092	TGTGA	2	10	3248199	3248208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_009092	ATGACA	2	12	3248216	3248227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8031	NC_009092	GGC	2	6	3248306	3248311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_009092	A	6	6	3248349	3248354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_009092	TGTT	2	8	3249815	3249822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_009092	GCG	2	6	3249826	3249831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_009092	CAG	2	6	3249850	3249855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_009092	ATAA	2	8	3249898	3249905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_009092	T	6	6	3250779	3250784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_009092	TTAT	2	8	3250907	3250914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_009092	ATA	2	6	3251981	3251986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_009092	TGA	2	6	3252059	3252064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_009092	CG	3	6	3252122	3252127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_009092	TTGA	2	8	3252157	3252164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_009092	GA	3	6	3253106	3253111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_009092	A	6	6	3253136	3253141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_009092	T	6	6	3253158	3253163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_009092	CTTC	2	8	3255048	3255055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_009092	ATA	2	6	3255133	3255138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_009092	TTC	2	6	3257475	3257480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_009092	CTTA	2	8	3261298	3261305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8050	NC_009092	TTG	2	6	3261307	3261312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009092	TAC	2	6	3261341	3261346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_009092	GCA	2	6	3261417	3261422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_009092	GC	3	6	3262385	3262390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_009092	A	6	6	3262414	3262419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_009092	TTA	3	9	3265290	3265298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_009092	TTA	2	6	3265335	3265340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009092	T	6	6	3265354	3265359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_009092	ATCA	2	8	3265371	3265378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_009092	A	7	7	3265416	3265422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_009092	AGT	2	6	3265462	3265467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_009092	T	7	7	3266635	3266641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_009092	TTA	2	6	3266694	3266699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_009092	TGT	2	6	3266711	3266716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009092	TGT	2	6	3266730	3266735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8067	NC_009092	GAT	2	6	3269087	3269092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8071	NC_009092	TAA	2	6	3270442	3270447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_009092	CAA	2	6	3270486	3270491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_009092	ATG	2	6	3270502	3270507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_009092	T	6	6	3270512	3270517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_009092	TACGT	2	10	3270591	3270600	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8076	NC_009092	A	6	6	3270667	3270672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_009092	GCC	2	6	3270674	3270679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_009092	AG	3	6	3270779	3270784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_009092	AAT	2	6	3272270	3272275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_009092	TTAAG	2	10	3272485	3272494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_009092	ATC	2	6	3274301	3274306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_009092	TCTAC	2	10	3274319	3274328	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8083	NC_009092	GAC	3	9	3274364	3274372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8086	NC_009092	A	7	7	3274513	3274519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_009092	CCT	2	6	3274520	3274525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_009092	TGTC	2	8	3274591	3274598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8089	NC_009092	A	6	6	3277653	3277658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_009092	T	6	6	3277676	3277681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_009092	CTTT	2	8	3277686	3277693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8094	NC_009092	TA	3	6	3280499	3280504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_009092	CGCGG	2	10	3280571	3280580	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8096	NC_009092	GTT	2	6	3282053	3282058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_009092	GT	3	6	3282063	3282068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_009092	GGC	2	6	3283214	3283219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_009092	CAG	2	6	3283277	3283282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_009092	CAT	2	6	3287821	3287826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_009092	A	9	9	3287849	3287857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_009092	ATA	2	6	3287869	3287874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_009092	CA	3	6	3287978	3287983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8105	NC_009092	A	6	6	3288003	3288008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_009092	GCA	2	6	3288022	3288027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_009092	AC	3	6	3288911	3288916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_009092	CAA	2	6	3288924	3288929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_009092	TATGC	2	10	3288953	3288962	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8110	NC_009092	CT	3	6	3288969	3288974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_009092	ATAA	2	8	3290973	3290980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_009092	A	7	7	3291880	3291886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_009092	AG	3	6	3291909	3291914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_009092	TCCA	2	8	3291953	3291960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_009092	TTA	2	6	3292003	3292008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_009092	GTCA	2	8	3292045	3292052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_009092	ATAAA	2	10	3292066	3292075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_009092	GCCC	2	8	3292117	3292124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8119	NC_009092	GA	3	6	3292150	3292155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_009092	T	7	7	3293575	3293581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_009092	AGCT	2	8	3293609	3293616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_009092	ACTTA	2	10	3293672	3293681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8123	NC_009092	ACTTA	2	10	3293700	3293709	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8124	NC_009092	TAACT	2	10	3293712	3293721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8125	NC_009092	ACTTA	2	10	3293742	3293751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8126	NC_009092	CA	3	6	3293844	3293849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_009092	T	6	6	3293946	3293951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_009092	TGA	2	6	3294008	3294013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_009092	GCCC	2	8	3295499	3295506	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8130	NC_009092	CAA	2	6	3295854	3295859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_009092	AAAT	2	8	3295875	3295882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_009092	TTG	2	6	3295910	3295915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8134	NC_009092	AGTT	2	8	3295929	3295936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8403	NC_009092	TCG	2	6	3397513	3397518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8441	NC_009092	AATG	2	8	3411494	3411501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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