MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 11951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009092	GAC	2	6	2865244	2865249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_009092	TAA	2	6	2866475	2866480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_009092	ATT	2	6	2871566	2871571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_009092	TAG	2	6	2871575	2871580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_009092	AGC	2	6	2871608	2871613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_009092	CTT	2	6	2871646	2871651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_009092	ATGC	2	8	2871675	2871682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7008	NC_009092	TTA	2	6	2871771	2871776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_009092	ATT	2	6	2871793	2871798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_009092	AC	3	6	2871856	2871861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_009092	AATA	2	8	2871889	2871896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_009092	AC	3	6	2871904	2871909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_009092	TCA	2	6	2872021	2872026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_009092	ATG	2	6	2872056	2872061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_009092	TGC	2	6	2872069	2872074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_009092	AAT	3	9	2872085	2872093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_009092	CAT	2	6	2874541	2874546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_009092	T	6	6	2874572	2874577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_009092	TCA	2	6	2875017	2875022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_009092	CTT	2	6	2875050	2875055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_009092	CCTG	2	8	2875057	2875064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_009092	AAGG	2	8	2875116	2875123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_009092	CAC	2	6	2875661	2875666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_009092	CGAA	2	8	2876387	2876394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7025	NC_009092	AGG	2	6	2876406	2876411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_009092	TGA	2	6	2876477	2876482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_009092	GGC	2	6	2876537	2876542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_009092	CGC	2	6	2876562	2876567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_009092	GCA	2	6	2876997	2877002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_009092	GCA	2	6	2877066	2877071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_009092	CAG	2	6	2877081	2877086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_009092	CTG	2	6	2877090	2877095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_009092	CAG	2	6	2877660	2877665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_009092	TGC	2	6	2877678	2877683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_009092	AGCTC	2	10	2877686	2877695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7036	NC_009092	CTC	2	6	2879825	2879830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_009092	AT	3	6	2879853	2879858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_009092	ACT	2	6	2880816	2880821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_009092	TTTA	2	8	2880911	2880918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_009092	AAC	2	6	2880919	2880924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_009092	AAC	2	6	2880956	2880961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_009092	CGC	2	6	2882067	2882072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_009092	GC	3	6	2882136	2882141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_009092	A	6	6	2883567	2883572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_009092	TCTGT	2	10	2883684	2883693	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7046	NC_009092	GCG	2	6	2883780	2883785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_009092	AAC	2	6	2883796	2883801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_009092	GCC	2	6	2883835	2883840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_009092	T	7	7	2883846	2883852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_009092	CCCG	2	8	2884326	2884333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7051	NC_009092	A	6	6	2884894	2884899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_009092	CAT	2	6	2884905	2884910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_009092	ATTA	2	8	2884951	2884958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_009092	A	6	6	2886225	2886230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_009092	GC	3	6	2886243	2886248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_009092	ATT	2	6	2886268	2886273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_009092	ACA	2	6	2886360	2886365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_009092	A	7	7	2886409	2886415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_009092	GAG	2	6	2890680	2890685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_009092	AGC	2	6	2890771	2890776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_009092	TCT	2	6	2890833	2890838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_009092	A	6	6	2890843	2890848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_009092	CG	3	6	2890893	2890898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7064	NC_009092	TTA	2	6	2891777	2891782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_009092	GTC	2	6	2891804	2891809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_009092	GAAA	2	8	2891932	2891939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_009092	CGC	2	6	2891949	2891954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_009092	AAT	2	6	2892443	2892448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_009092	T	6	6	2893519	2893524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_009092	TCT	3	9	2893601	2893609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_009092	A	6	6	2896017	2896022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_009092	TAAAC	2	10	2900245	2900254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7073	NC_009092	ACA	2	6	2900340	2900345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_009092	AAAGA	2	10	2900359	2900368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_009092	AAT	2	6	2901224	2901229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_009092	CTTAT	2	10	2904166	2904175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7077	NC_009092	A	8	8	2904191	2904198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_009092	TTA	2	6	2904217	2904222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_009092	TTTA	2	8	2904927	2904934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_009092	CGG	2	6	2904942	2904947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_009092	AATAA	2	10	2905826	2905835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_009092	AGTG	2	8	2907752	2907759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_009092	GAG	2	6	2907790	2907795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_009092	A	7	7	2908336	2908342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_009092	TTTTA	2	10	2908358	2908367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_009092	CCAA	2	8	2913329	2913336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7089	NC_009092	CCA	2	6	2913408	2913413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7093	NC_009092	ACA	2	6	2913635	2913640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_009092	TAA	2	6	2913664	2913669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_009092	T	6	6	2917548	2917553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_009092	T	7	7	2917555	2917561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_009092	CAA	2	6	2917612	2917617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_009092	CAA	2	6	2917644	2917649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_009092	CGA	2	6	2917741	2917746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7103	NC_009092	AG	3	6	2917784	2917789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_009092	ATTA	2	8	2917878	2917885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7109	NC_009092	CTG	2	6	2918017	2918022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7112	NC_009092	AGACT	2	10	2918128	2918137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7113	NC_009092	AATA	2	8	2918234	2918241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_009092	TCA	2	6	2918260	2918265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7116	NC_009092	A	6	6	2918308	2918313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_009092	GTT	2	6	2919643	2919648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7121	NC_009092	TAT	2	6	2922238	2922243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7123	NC_009092	ACA	2	6	2922274	2922279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7125	NC_009092	TTA	2	6	2922331	2922336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_009092	ATT	2	6	2922345	2922350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_009092	GA	3	6	2927564	2927569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_009092	CAT	2	6	2927886	2927891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_009092	TGG	2	6	2927922	2927927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_009092	AGG	2	6	2928041	2928046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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