MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	T	6	6	75	80	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008750	TGA	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008750	CGC	2	6	2705	2710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008750	CCAT	2	8	2751	2758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008750	TAT	2	6	2804	2809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008750	GA	3	6	3941	3946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008750	TGT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008750	TGAT	2	8	6380	6387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008750	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008750	AGC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008750	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008750	GTT	2	6	6462	6467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008750	A	6	6	7659	7664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008750	T	6	6	7681	7686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008750	T	6	6	10769	10774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008750	CTT	2	6	10777	10782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008750	TA	3	6	10800	10805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008750	GA	3	6	11413	11418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008750	A	7	7	11474	11480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008750	TAGG	2	8	14808	14815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008750	TA	3	6	14877	14882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008750	CAT	2	6	15393	15398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008750	ATT	2	6	15793	15798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008750	TGAT	2	8	15799	15806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008750	AT	3	6	15827	15832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008750	AATT	2	8	15862	15869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008750	TAA	2	6	15893	15898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008750	CCA	2	6	19279	19284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008750	CT	3	6	19307	19312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008750	CAG	2	6	19319	19324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008750	CAT	2	6	19332	19337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008750	TG	3	6	19347	19352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008750	ACA	2	6	19380	19385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008750	ATT	2	6	19562	19567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008750	ATG	2	6	19578	19583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008750	AGC	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008750	TGT	2	6	19658	19663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008750	AGATTA	2	12	19672	19683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008750	ATA	2	6	19702	19707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008750	AAT	2	6	21762	21767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008750	AG	3	6	23793	23798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008750	TCAC	2	8	24128	24135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008750	TTATT	2	10	24144	24153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008750	ATT	2	6	24267	24272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008750	TTA	2	6	24894	24899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008750	AGT	2	6	26365	26370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008750	AGTT	2	8	30614	30621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008750	CTAATG	2	12	30629	30640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008750	AAT	2	6	30668	30673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008750	CAA	2	6	31895	31900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008750	TTA	2	6	31901	31906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008750	TTG	2	6	33406	33411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008750	GA	3	6	33427	33432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008750	AGG	2	6	33434	33439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008750	CCT	2	6	33446	33451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008750	T	6	6	33451	33456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008750	GGT	2	6	33511	33516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008750	TG	3	6	34094	34099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008750	AAT	2	6	34189	34194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008750	TTG	2	6	34199	34204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008750	AAT	2	6	34810	34815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008750	ACA	2	6	35759	35764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008750	TAG	2	6	36214	36219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008750	AG	3	6	36231	36236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008750	TA	3	6	37559	37564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008750	ACTA	2	8	37584	37591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008750	GGTCA	2	10	38215	38224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008750	GCA	2	6	38384	38389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008750	A	6	6	38398	38403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008750	TG	3	6	38534	38539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008750	T	6	6	38656	38661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008750	CAA	2	6	38717	38722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008750	GGC	2	6	38765	38770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008750	GCA	2	6	38796	38801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008750	GCG	2	6	38829	38834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008750	AGG	2	6	38924	38929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008750	CGA	2	6	39004	39009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008750	GAT	2	6	39029	39034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008750	GCA	2	6	39078	39083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008750	GT	3	6	39131	39136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008750	GAA	2	6	39137	39142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008750	GGA	2	6	39173	39178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008750	AGA	2	6	39220	39225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008750	CAG	2	6	39246	39251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008750	G	6	6	39393	39398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008750	GGA	2	6	39437	39442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008750	GGC	2	6	39457	39462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008750	GAA	2	6	39700	39705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008750	TGC	2	6	39776	39781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008750	GTC	2	6	39788	39793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008750	TGG	2	6	39866	39871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008750	GGA	2	6	39902	39907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008750	GAC	2	6	39915	39920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008750	TCA	2	6	39927	39932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008750	AC	3	6	39953	39958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008750	TCG	2	6	40020	40025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008750	AC	3	6	40122	40127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008750	AAG	2	6	40158	40163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008750	G	7	7	40181	40187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008750	CAC	2	6	40192	40197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008750	CCT	2	6	40263	40268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008750	CA	3	6	40353	40358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008750	TAAT	2	8	40450	40457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008750	ATTA	2	8	40477	40484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008750	TTA	2	6	40531	40536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008750	CTT	2	6	40571	40576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008750	CAA	2	6	40612	40617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008750	GTA	2	6	40702	40707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008750	TCA	2	6	40789	40794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008750	TAG	2	6	40882	40887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008750	GCGA	2	8	40890	40897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008750	G	6	6	41039	41044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008750	TCC	2	6	41049	41054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008750	CTGA	2	8	41069	41076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008750	GGA	2	6	41359	41364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008750	TAC	2	6	41563	41568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008750	CGG	2	6	41581	41586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008750	CGTC	2	8	41594	41601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008750	AAC	2	6	41613	41618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008750	AGC	2	6	41703	41708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008750	CAT	2	6	41709	41714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008750	AAAG	2	8	41717	41724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008750	AGTCG	2	10	41739	41748	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008750	ACC	2	6	41781	41786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008750	TGAAGG	2	12	41844	41855	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008750	GA	3	6	42056	42061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008750	AGGCT	2	10	42068	42077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008750	GCG	2	6	42081	42086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008750	GGT	2	6	42105	42110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008750	GGTG	2	8	42112	42119	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008750	TGA	2	6	42155	42160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008750	AGT	2	6	42180	42185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008750	TCT	2	6	42208	42213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008750	GGT	2	6	42254	42259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008750	GA	3	6	42284	42289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008750	TGA	2	6	42353	42358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008750	CT	3	6	42365	42370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008750	ATTG	2	8	42487	42494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008750	CGG	2	6	42535	42540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008750	ATG	2	6	42611	42616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008750	GTC	2	6	42792	42797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008750	ACC	2	6	42806	42811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008750	TGG	2	6	42866	42871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008750	TCC	2	6	42892	42897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008750	GGA	2	6	42909	42914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008750	GGT	2	6	43029	43034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008750	CGG	2	6	43116	43121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008750	TCA	2	6	43144	43149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008750	CGT	2	6	43224	43229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008750	GAT	2	6	43264	43269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008750	GAAC	2	8	43306	43313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008750	GT	3	6	43477	43482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008750	AAG	2	6	43559	43564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008750	A	6	6	43604	43609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008750	ATT	2	6	43625	43630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008750	ATAAG	2	10	43633	43642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008750	AGC	2	6	43667	43672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_008750	ACC	2	6	43735	43740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_008750	ATCCC	2	10	43743	43752	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
160	NC_008750	T	6	6	43876	43881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008750	TGA	2	6	43908	43913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008750	ATA	2	6	43917	43922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008750	ATT	2	6	43934	43939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008750	ATTA	2	8	43958	43965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008750	AGA	2	6	43968	43973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008750	AAT	2	6	44030	44035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008750	GTT	2	6	49385	49390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008750	TGA	2	6	49408	49413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008750	CCGC	2	8	49519	49526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
170	NC_008750	TAA	2	6	50587	50592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008750	A	6	6	50607	50612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008750	T	6	6	50630	50635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008750	GCA	2	6	50638	50643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_008750	GCT	2	6	52034	52039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_008750	TCC	2	6	52050	52055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_008750	T	6	6	52185	52190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008750	AAT	2	6	52238	52243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_008750	ATT	2	6	52818	52823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008750	ATT	2	6	53391	53396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008750	CTAT	2	8	53430	53437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_008750	CTG	2	6	54115	54120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_008750	TTA	2	6	54127	54132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_008750	GT	3	6	54186	54191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008750	A	6	6	54200	54205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008750	GGC	2	6	54206	54211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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190	NC_008750	CTT	2	6	54303	54308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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196	NC_008750	TTA	3	9	54674	54682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_008750	A	6	6	76455	76460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_008750	TGA	2	6	77116	77121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_008750	ATC	2	6	81026	81031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_008750	AAT	2	6	81058	81063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_008750	TTCT	2	8	85122	85129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_008750	GTG	2	6	85690	85695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_008750	TTA	2	6	156733	156738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008750	AGA	2	6	161388	161393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_008750	AT	3	6	163143	163148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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