MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008750	TGC	2	6	1314405	1314410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_008750	TTAA	2	8	1318622	1318629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008750	AAT	2	6	1318645	1318650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_008750	TAA	2	6	1319929	1319934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008750	A	7	7	1319933	1319939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008750	GTT	2	6	1321756	1321761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008750	AATA	2	8	1321768	1321775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008750	AAAG	2	8	1323051	1323058	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008750	CAG	2	6	1323163	1323168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_008750	T	6	6	1323184	1323189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008750	TGT	2	6	1323341	1323346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_008750	AC	4	8	1323372	1323379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_008750	ATCT	2	8	1323389	1323396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_008750	TGG	2	6	1329388	1329393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008750	AATCA	2	10	1329866	1329875	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3516	NC_008750	TTG	2	6	1333152	1333157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_008750	GTT	2	6	1333865	1333870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008750	GAA	2	6	1333879	1333884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008750	ATTG	2	8	1333956	1333963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008750	ACG	2	6	1334010	1334015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_008750	GAA	2	6	1334028	1334033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008750	AG	3	6	1334040	1334045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008750	GT	3	6	1334057	1334062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008750	GTT	2	6	1335702	1335707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008750	TTAA	2	8	1336732	1336739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008750	TTC	2	6	1336762	1336767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_008750	ACG	2	6	1336807	1336812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_008750	AAC	2	6	1336861	1336866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_008750	CTGGA	2	10	1338219	1338228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3530	NC_008750	GTT	2	6	1338316	1338321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008750	GGTT	2	8	1338354	1338361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008750	ATT	2	6	1338428	1338433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_008750	T	8	8	1338438	1338445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_008750	GTA	2	6	1338493	1338498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008750	TTG	2	6	1339392	1339397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008750	GT	3	6	1339468	1339473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008750	TA	3	6	1339475	1339480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008750	CT	3	6	1339551	1339556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_008750	TAA	2	6	1339647	1339652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008750	AAT	2	6	1339708	1339713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008750	AAT	2	6	1339717	1339722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008750	TATT	2	8	1339758	1339765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_008750	GTT	2	6	1340710	1340715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008750	GGC	2	6	1343319	1343324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_008750	TAA	2	6	1343361	1343366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008750	TAA	2	6	1344120	1344125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008750	T	6	6	1344148	1344153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008750	TAT	2	6	1344186	1344191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008750	TTA	2	6	1344203	1344208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008750	AATT	2	8	1346392	1346399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_008750	T	6	6	1346434	1346439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008750	TAGTT	2	10	1346453	1346462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008750	TAA	2	6	1346468	1346473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008750	TTA	2	6	1349889	1349894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_008750	GTT	2	6	1349936	1349941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_008750	ATTT	2	8	1349997	1350004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_008750	TAA	2	6	1351437	1351442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_008750	T	6	6	1351918	1351923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008750	GTT	2	6	1352088	1352093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008750	AAC	2	6	1352099	1352104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_008750	T	6	6	1352127	1352132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008750	ATC	2	6	1352178	1352183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_008750	CAA	2	6	1352190	1352195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_008750	ATG	2	6	1352280	1352285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_008750	TC	3	6	1352290	1352295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_008750	CAGC	2	8	1352332	1352339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_008750	T	6	6	1352353	1352358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008750	TGC	2	6	1353863	1353868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_008750	ATT	2	6	1354375	1354380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008750	ATTAAG	2	12	1354404	1354415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008750	AG	3	6	1357415	1357420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008750	ATG	2	6	1357441	1357446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008750	TAA	2	6	1357605	1357610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_008750	TTC	2	6	1357637	1357642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_008750	GTC	2	6	1360370	1360375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_008750	AAC	2	6	1360377	1360382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_008750	CAA	2	6	1360394	1360399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_008750	ATT	2	6	1360408	1360413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008750	ATA	2	6	1360415	1360420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008750	TAT	2	6	1360423	1360428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008750	CTT	2	6	1360497	1360502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_008750	TGAT	2	8	1360505	1360512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008750	AGG	2	6	1360523	1360528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008750	CAA	2	6	1360540	1360545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_008750	TTC	2	6	1360553	1360558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_008750	TGA	2	6	1360576	1360581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_008750	AAAC	2	8	1360697	1360704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_008750	ATG	2	6	1360734	1360739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008750	GAC	2	6	1360748	1360753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008750	TCA	2	6	1360828	1360833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_008750	CAG	2	6	1360875	1360880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_008750	TG	3	6	1360924	1360929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008750	CA	3	6	1360958	1360963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_008750	TGAG	2	8	1360991	1360998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_008750	A	7	7	1361002	1361008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_008750	AAAT	2	8	1362449	1362456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_008750	TTCA	2	8	1362506	1362513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_008750	AGC	2	6	1362589	1362594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008750	T	6	6	1362610	1362615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008750	ATTAA	2	10	1362668	1362677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_008750	TAT	2	6	1362721	1362726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008750	A	6	6	1362763	1362768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008750	T	6	6	1362805	1362810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008750	A	6	6	1362996	1363001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008750	A	6	6	1363022	1363027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008750	TG	3	6	1363043	1363048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_008750	AAG	2	6	1363123	1363128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_008750	GTTG	2	8	1364738	1364745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008750	ATAG	2	8	1365776	1365783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008750	GTG	2	6	1365810	1365815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008750	GGC	2	6	1368197	1368202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_008750	GGC	2	6	1368235	1368240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_008750	GTT	2	6	1368252	1368257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008750	ATT	2	6	1368348	1368353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_008750	CTG	2	6	1368359	1368364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_008750	TCA	2	6	1368380	1368385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008750	GC	3	6	1369315	1369320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_008750	AAAAC	2	10	1371393	1371402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3619	NC_008750	AGTA	2	8	1371466	1371473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_008750	CATTT	2	10	1372561	1372570	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3621	NC_008750	T	6	6	1372685	1372690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_008750	AAC	2	6	1373965	1373970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_008750	ATTA	2	8	1374023	1374030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_008750	AT	3	6	1374056	1374061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_008750	TGG	2	6	1374095	1374100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_008750	TAGG	2	8	1375869	1375876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_008750	TATT	2	8	1375897	1375904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_008750	TAA	2	6	1375921	1375926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008750	A	6	6	1375925	1375930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_008750	GAT	2	6	1375957	1375962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_008750	ATCA	2	8	1375972	1375979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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