MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008750	GCA	2	6	4147805	4147810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_008750	ATA	2	6	4147840	4147845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_008750	A	6	6	4147893	4147898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_008750	CTT	2	6	4147924	4147929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_008750	GTT	2	6	4147932	4147937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_008750	CAAT	2	8	4147951	4147958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_008750	ACA	3	9	4148068	4148076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_008750	AT	3	6	4148112	4148117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_008750	GCA	2	6	4148149	4148154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_008750	ACA	2	6	4148212	4148217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_008750	CCTCTA	2	12	4148226	4148237	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
11012	NC_008750	A	6	6	4149033	4149038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_008750	TCAC	2	8	4149067	4149074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_008750	AAG	2	6	4149967	4149972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_008750	GTAAT	2	10	4149986	4149995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_008750	TA	3	6	4150173	4150178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_008750	GGTCA	2	10	4151872	4151881	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11018	NC_008750	TAAC	2	8	4151961	4151968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11019	NC_008750	A	6	6	4152006	4152011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_008750	ATGC	2	8	4152033	4152040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_008750	T	6	6	4152086	4152091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_008750	GGAT	2	8	4152110	4152117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_008750	ATCC	2	8	4152128	4152135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_008750	TTA	2	6	4152826	4152831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_008750	ACT	2	6	4153792	4153797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_008750	CAT	2	6	4155372	4155377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_008750	A	7	7	4155463	4155469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_008750	TCA	2	6	4156352	4156357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_008750	ACTG	2	8	4156415	4156422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11030	NC_008750	ATC	2	6	4156459	4156464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_008750	ATTT	2	8	4156478	4156485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_008750	CCA	2	6	4159578	4159583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_008750	TTG	2	6	4159690	4159695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_008750	CAA	2	6	4159741	4159746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_008750	TAA	2	6	4159751	4159756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_008750	TAA	2	6	4159763	4159768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_008750	CTG	2	6	4160537	4160542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_008750	T	7	7	4160605	4160611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_008750	AAT	2	6	4160666	4160671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_008750	TA	3	6	4160701	4160706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_008750	GAA	2	6	4161029	4161034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_008750	CAG	2	6	4161645	4161650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_008750	AAT	2	6	4161662	4161667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_008750	AAC	2	6	4161672	4161677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_008750	AAC	2	6	4164383	4164388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_008750	CAAAAG	2	12	4164408	4164419	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11047	NC_008750	CCT	2	6	4164439	4164444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_008750	GGC	2	6	4164484	4164489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_008750	CTTAT	2	10	4164527	4164536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11050	NC_008750	AACC	2	8	4164554	4164561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_008750	AGT	2	6	4165697	4165702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_008750	T	6	6	4165704	4165709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_008750	T	6	6	4165739	4165744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_008750	AGG	2	6	4165760	4165765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_008750	TCC	2	6	4165779	4165784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_008750	ACC	2	6	4165848	4165853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_008750	ATC	2	6	4165857	4165862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_008750	TCCT	2	8	4168801	4168808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_008750	TTTAA	2	10	4170712	4170721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_008750	TTA	2	6	4170745	4170750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_008750	A	7	7	4171713	4171719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_008750	TCCT	2	8	4172425	4172432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_008750	A	6	6	4172441	4172446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_008750	ATG	2	6	4172501	4172506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_008750	ACA	2	6	4172514	4172519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_008750	AAC	2	6	4175061	4175066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_008750	TGT	2	6	4175083	4175088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_008750	AGC	2	6	4175682	4175687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_008750	AGCA	2	8	4176795	4176802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11070	NC_008750	ATG	2	6	4176848	4176853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_008750	AGT	2	6	4177640	4177645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_008750	TTA	2	6	4177703	4177708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_008750	ACC	2	6	4179351	4179356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_008750	TGG	2	6	4179385	4179390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_008750	AAC	2	6	4180868	4180873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_008750	AATA	2	8	4182062	4182069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_008750	TAA	2	6	4182083	4182088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_008750	CTTTG	2	10	4182731	4182740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11079	NC_008750	TGT	2	6	4182796	4182801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_008750	A	6	6	4182814	4182819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_008750	AAT	2	6	4182863	4182868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_008750	GTT	2	6	4182940	4182945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_008750	AAC	2	6	4182971	4182976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_008750	G	6	6	4183281	4183286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_008750	TTAAG	2	10	4183306	4183315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_008750	ATA	2	6	4183338	4183343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11088	NC_008750	A	6	6	4183369	4183374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_008750	GAA	2	6	4183425	4183430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11091	NC_008750	TGAT	2	8	4183474	4183481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_008750	CTTTT	2	10	4183486	4183495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11093	NC_008750	AAT	2	6	4183497	4183502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_008750	TGA	2	6	4184064	4184069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_008750	T	6	6	4184087	4184092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_008750	AAT	2	6	4184169	4184174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_008750	CAA	2	6	4185280	4185285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_008750	TTG	2	6	4185341	4185346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_008750	TAAT	2	8	4188516	4188523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_008750	ATA	2	6	4188533	4188538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_008750	ATA	3	9	4190070	4190078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_008750	AGC	2	6	4194331	4194336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_008750	TTG	2	6	4194719	4194724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11107	NC_008750	TGA	2	6	4195136	4195141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_008750	GGGAT	2	10	4195268	4195277	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_008750	GGT	2	6	4195280	4195285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_008750	TGC	2	6	4195347	4195352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_008750	CTTAT	2	10	4195378	4195387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11112	NC_008750	TAA	2	6	4195389	4195394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_008750	T	6	6	4195411	4195416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_008750	TG	3	6	4195439	4195444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_008750	CTT	2	6	4195505	4195510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_008750	AC	3	6	4195587	4195592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11117	NC_008750	GTTC	2	8	4195756	4195763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11118	NC_008750	ATC	2	6	4195800	4195805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_008750	ACG	2	6	4195840	4195845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_008750	TGA	2	6	4195920	4195925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_008750	CCG	2	6	4195948	4195953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11122	NC_008750	ACC	2	6	4196035	4196040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_008750	CTC	2	6	4196154	4196159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_008750	GAG	2	6	4196173	4196178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_008750	CCA	2	6	4196198	4196203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_008750	GGT	2	6	4196258	4196263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_008750	GAC	2	6	4196272	4196277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11129	NC_008750	GCC	2	6	4196528	4196533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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