MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 12701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008750	GAT	2	6	3056424	3056429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_008750	TAT	2	6	3056493	3056498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_008750	CGT	2	6	3056521	3056526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_008750	ATA	2	6	3056573	3056578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_008750	ATA	2	6	3056592	3056597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_008750	CAA	2	6	3059903	3059908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_008750	AT	3	6	3060386	3060391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_008750	AT	3	6	3060508	3060513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_008750	CCT	2	6	3060558	3060563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_008750	TGT	2	6	3060648	3060653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_008750	A	6	6	3060699	3060704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_008750	CAG	2	6	3061821	3061826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_008750	GAT	2	6	3061898	3061903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_008750	AGA	2	6	3061914	3061919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_008750	CCA	2	6	3062065	3062070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_008750	GCCAT	2	10	3062218	3062227	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8017	NC_008750	AGA	2	6	3062342	3062347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_008750	GTT	2	6	3062353	3062358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_008750	AGCA	2	8	3062452	3062459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_008750	ATG	2	6	3062472	3062477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_008750	AAC	2	6	3062561	3062566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_008750	AAGC	2	8	3062631	3062638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8023	NC_008750	ATC	2	6	3062705	3062710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_008750	TTC	2	6	3062744	3062749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_008750	GAT	2	6	3062789	3062794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_008750	ATA	2	6	3062813	3062818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_008750	ATC	2	6	3063913	3063918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_008750	ATA	2	6	3063926	3063931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_008750	TGA	2	6	3066646	3066651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_008750	GGAT	2	8	3066673	3066680	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_008750	A	6	6	3066794	3066799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_008750	ATAA	2	8	3067360	3067367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_008750	CGC	2	6	3067371	3067376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_008750	GCG	2	6	3067386	3067391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_008750	TTTA	2	8	3067394	3067401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_008750	TGT	2	6	3069012	3069017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_008750	TGA	2	6	3069268	3069273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_008750	ATGA	2	8	3069277	3069284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_008750	GCCTT	2	10	3069322	3069331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8040	NC_008750	GGC	2	6	3069332	3069337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_008750	CACTTG	2	12	3071617	3071628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_008750	GAA	2	6	3071675	3071680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_008750	TTGA	2	8	3071681	3071688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_008750	A	7	7	3074529	3074535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_008750	TTG	2	6	3074547	3074552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_008750	AAC	2	6	3074559	3074564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_008750	TG	3	6	3074716	3074721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_008750	CAC	2	6	3074779	3074784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_008750	TGAA	2	8	3074831	3074838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_008750	TAT	2	6	3074859	3074864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_008750	A	6	6	3074899	3074904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_008750	TG	3	6	3076647	3076652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_008750	ATG	2	6	3076691	3076696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_008750	T	6	6	3079937	3079942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_008750	TCCTT	2	10	3081505	3081514	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8056	NC_008750	TTG	2	6	3081587	3081592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_008750	TTG	2	6	3081632	3081637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_008750	TAA	2	6	3082907	3082912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_008750	CAA	2	6	3083055	3083060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_008750	TGG	2	6	3083068	3083073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_008750	AAC	2	6	3083142	3083147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_008750	TCCTA	2	10	3083202	3083211	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8063	NC_008750	AGGA	2	8	3083273	3083280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_008750	CG	3	6	3084974	3084979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_008750	CTAT	2	8	3086000	3086007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_008750	CATA	2	8	3086470	3086477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8067	NC_008750	TCTTG	2	10	3086513	3086522	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8068	NC_008750	CCA	2	6	3086547	3086552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_008750	ATT	2	6	3087337	3087342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_008750	CAAA	2	8	3087348	3087355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_008750	A	6	6	3087353	3087358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_008750	TAA	2	6	3087388	3087393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_008750	ACA	2	6	3088069	3088074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_008750	TTTTG	2	10	3088080	3088089	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_008750	AATC	2	8	3088152	3088159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_008750	GCA	2	6	3088255	3088260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_008750	TTA	2	6	3088262	3088267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_008750	TAA	2	6	3088285	3088290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_008750	G	6	6	3088389	3088394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_008750	A	6	6	3089840	3089845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_008750	AC	3	6	3090938	3090943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_008750	TTTGA	2	10	3092770	3092779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_008750	TAT	2	6	3092804	3092809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_008750	CATA	2	8	3092811	3092818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_008750	TTAG	2	8	3092839	3092846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_008750	CAAGT	2	10	3092924	3092933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8087	NC_008750	A	6	6	3092970	3092975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_008750	A	6	6	3092997	3093002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_008750	ATC	2	6	3093424	3093429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_008750	T	6	6	3094295	3094300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_008750	TCAA	2	8	3094325	3094332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_008750	ACGTAA	2	12	3094340	3094351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8093	NC_008750	CAA	2	6	3094402	3094407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_008750	TA	3	6	3094408	3094413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_008750	AAAT	2	8	3096479	3096486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_008750	TAT	2	6	3096515	3096520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_008750	ATT	2	6	3096531	3096536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_008750	TGT	2	6	3096539	3096544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_008750	A	6	6	3097060	3097065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_008750	GTA	2	6	3097647	3097652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_008750	TTG	2	6	3097672	3097677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_008750	T	6	6	3097764	3097769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_008750	ATTA	2	8	3097791	3097798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_008750	AAT	2	6	3097820	3097825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_008750	AG	3	6	3098852	3098857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_008750	TTA	2	6	3098926	3098931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_008750	CTAT	2	8	3098954	3098961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_008750	ATT	2	6	3098989	3098994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_008750	TAAT	2	8	3099023	3099030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_008750	TTA	2	6	3099031	3099036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_008750	TCA	2	6	3099063	3099068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_008750	ATTT	2	8	3099070	3099077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_008750	GTT	2	6	3099134	3099139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_008750	ATC	2	6	3099142	3099147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_008750	AGAA	2	8	3099235	3099242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_008750	ACT	2	6	3101579	3101584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_008750	T	6	6	3101629	3101634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_008750	TAA	2	6	3101652	3101657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_008750	ATGA	2	8	3101714	3101721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_008750	TGT	2	6	3101757	3101762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_008750	GTC	2	6	3101849	3101854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_008750	ATG	2	6	3102047	3102052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_008750	GTC	2	6	3102128	3102133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_008750	TAAT	2	8	3102236	3102243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_008750	ATT	2	6	3102271	3102276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_008750	CTT	2	6	3102314	3102319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_008750	GCA	2	6	3102349	3102354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_008750	CAG	2	6	3102395	3102400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_008750	CAC	2	6	3102420	3102425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_008750	GGC	2	6	3102431	3102436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_008750	CTA	2	6	3102480	3102485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_008750	TAC	2	6	3102488	3102493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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