MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 9189

< Previous12...78910111213141516171819Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_008700	ATCA	2	8	4245003	4245010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_008700	CCA	2	6	4245046	4245051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_008700	A	6	6	4245083	4245088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_008700	GCC	2	6	4246133	4246138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_008700	ACCC	2	8	4249837	4249844	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9006	NC_008700	ATT	2	6	4249862	4249867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_008700	TTA	2	6	4249884	4249889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_008700	CGC	2	6	4249907	4249912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_008700	CG	4	8	4249922	4249929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_008700	TCA	2	6	4250011	4250016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_008700	GAG	2	6	4250024	4250029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_008700	ACA	2	6	4250043	4250048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_008700	TGG	2	6	4250183	4250188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_008700	CGG	2	6	4250192	4250197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_008700	TGT	2	6	4250544	4250549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_008700	TCA	2	6	4252315	4252320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_008700	TTG	2	6	4255413	4255418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_008700	GGC	2	6	4255453	4255458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_008700	CGC	2	6	4255462	4255467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9020	NC_008700	CCTG	2	8	4255479	4255486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_008700	TGGGT	2	10	4259083	4259092	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_008700	ATC	2	6	4259174	4259179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_008700	AAC	2	6	4259235	4259240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_008700	GCC	2	6	4262069	4262074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9025	NC_008700	T	6	6	4263179	4263184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_008700	CCTT	2	8	4266011	4266018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9027	NC_008700	CCGG	2	8	4266020	4266027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9028	NC_008700	GAC	2	6	4266033	4266038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_008700	C	6	6	4266089	4266094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9030	NC_008700	CAAC	2	8	4266128	4266135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9031	NC_008700	GAACA	2	10	4266151	4266160	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9032	NC_008700	GGA	2	6	4266219	4266224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_008700	TTTA	2	8	4268398	4268405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_008700	AAT	2	6	4268423	4268428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_008700	AAGG	2	8	4268451	4268458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_008700	TAT	2	6	4269106	4269111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_008700	CGA	2	6	4271332	4271337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_008700	A	6	6	4271357	4271362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_008700	CAC	2	6	4271461	4271466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9040	NC_008700	CTGC	2	8	4271530	4271537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_008700	AGA	2	6	4271539	4271544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_008700	CGGCG	2	10	4271551	4271560	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9043	NC_008700	CTGA	2	8	4273224	4273231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9044	NC_008700	ATC	2	6	4273233	4273238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_008700	CAT	2	6	4273246	4273251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_008700	CAA	3	9	4274042	4274050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_008700	G	6	6	4276664	4276669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_008700	GAGC	2	8	4276791	4276798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9049	NC_008700	AT	3	6	4276873	4276878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_008700	CAG	2	6	4276931	4276936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_008700	GCGGA	2	10	4277028	4277037	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9052	NC_008700	GCT	2	6	4277176	4277181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_008700	ACT	2	6	4277189	4277194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_008700	TCAA	2	8	4277374	4277381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9055	NC_008700	CTA	2	6	4277403	4277408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_008700	AC	3	6	4277488	4277493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9057	NC_008700	GTTC	2	8	4277657	4277664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9058	NC_008700	C	6	6	4277692	4277697	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9059	NC_008700	ACG	2	6	4277741	4277746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_008700	TGA	2	6	4277821	4277826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_008700	CCG	2	6	4277849	4277854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9062	NC_008700	ACC	2	6	4277936	4277941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_008700	GTCT	2	8	4277978	4277985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9064	NC_008700	CTC	2	6	4278055	4278060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9065	NC_008700	GAG	2	6	4278074	4278079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_008700	CCA	2	6	4278099	4278104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_008700	GGT	2	6	4278160	4278165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_008700	CAT	2	6	4278355	4278360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_008700	GCC	2	6	4278430	4278435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_008700	CAAT	2	8	4278477	4278484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9071	NC_008700	CAG	2	6	4278623	4278628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_008700	TC	3	6	4278682	4278687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9073	NC_008700	ACC	2	6	4278712	4278717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9074	NC_008700	AGA	2	6	4278758	4278763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_008700	TCA	2	6	4278811	4278816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_008700	TG	3	6	4278829	4278834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_008700	CTAC	2	8	4278855	4278862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9078	NC_008700	CAAC	2	8	4278878	4278885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9079	NC_008700	TC	3	6	4278910	4278915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9080	NC_008700	CCTTCA	2	12	4279116	4279127	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9081	NC_008700	CTC	2	6	4279143	4279148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9082	NC_008700	CGACT	2	10	4279223	4279232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9083	NC_008700	CTTT	2	8	4279247	4279254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9084	NC_008700	ATG	2	6	4279257	4279262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_008700	GCT	2	6	4279263	4279268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_008700	GTT	2	6	4279353	4279358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_008700	GAC	2	6	4279367	4279372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_008700	GTCT	2	8	4279390	4279397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9089	NC_008700	GAG	2	6	4279520	4279525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_008700	TCGGT	2	10	4279598	4279607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9091	NC_008700	GTCA	2	8	4279894	4279901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9092	NC_008700	GGA	2	6	4279917	4279922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_008700	C	6	6	4279927	4279932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9094	NC_008700	ACA	2	6	4279941	4279946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9095	NC_008700	GCC	2	6	4279957	4279962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9096	NC_008700	TCGC	2	8	4280074	4280081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9097	NC_008700	TGA	2	6	4280177	4280182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_008700	GTT	2	6	4280231	4280236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_008700	TAC	2	6	4280264	4280269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_008700	GAA	2	6	4280407	4280412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_008700	TTGA	2	8	4280425	4280432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_008700	T	6	6	4280449	4280454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_008700	CTA	2	6	4280483	4280488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_008700	TG	3	6	4280556	4280561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_008700	CAG	2	6	4280568	4280573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_008700	AGG	2	6	4280594	4280599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_008700	GT	3	6	4280735	4280740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_008700	ACG	2	6	4280836	4280841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_008700	GT	3	6	4280904	4280909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_008700	ATG	2	6	4280929	4280934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_008700	CGT	2	6	4280941	4280946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_008700	TCC	2	6	4280955	4280960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_008700	ATAAGG	2	12	4281011	4281022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_008700	GAC	2	6	4281069	4281074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_008700	GCA	2	6	4281081	4281086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_008700	TTC	2	6	4281157	4281162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_008700	GCC	2	6	4281400	4281405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9118	NC_008700	TCC	2	6	4281420	4281425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9119	NC_008700	C	6	6	4281464	4281469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9120	NC_008700	GCT	2	6	4281610	4281615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_008700	CTT	2	6	4281635	4281640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_008700	TCC	2	6	4281684	4281689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_008700	CTT	2	6	4281719	4281724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_008700	CA	3	6	4281725	4281730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_008700	CTG	2	6	4281778	4281783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_008700	TCG	2	6	4281853	4281858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_008700	CTA	2	6	4281881	4281886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_008700	CCT	2	6	4281933	4281938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9129	NC_008700	CCG	2	6	4282027	4282032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9130	NC_008700	GCC	2	6	4282094	4282099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9131	NC_008700	CTG	2	6	4282159	4282164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9132	NC_008700	TCA	2	6	4282215	4282220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9133	NC_008700	CA	3	6	4282234	4282239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9134	NC_008700	TGT	2	6	4282323	4282328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9135	NC_008700	ACC	2	6	4282392	4282397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9136	NC_008700	CGC	2	6	4282407	4282412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9137	NC_008700	CCGTG	2	10	4282423	4282432	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9138	NC_008700	GAA	2	6	4282484	4282489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9139	NC_008700	CGTT	2	8	4282507	4282514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9140	NC_008700	A	6	6	4282536	4282541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9141	NC_008700	T	6	6	4282557	4282562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9142	NC_008700	ATT	2	6	4282568	4282573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9143	NC_008700	CTG	2	6	4282579	4282584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9144	NC_008700	TTA	2	6	4284068	4284073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9145	NC_008700	TTA	2	6	4284079	4284084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9146	NC_008700	AGCCT	2	10	4284525	4284534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9147	NC_008700	AGGC	2	8	4284555	4284562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9148	NC_008700	CCA	2	6	4285481	4285486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9149	NC_008700	GCA	2	6	4285496	4285501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9150	NC_008700	TAT	2	6	4285579	4285584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9151	NC_008700	TAG	2	6	4285827	4285832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9152	NC_008700	CTCAG	2	10	4285835	4285844	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9153	NC_008700	AC	3	6	4287549	4287554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9154	NC_008700	CAGT	2	8	4287555	4287562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9155	NC_008700	CAG	2	6	4287589	4287594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9156	NC_008700	A	6	6	4287650	4287655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9157	NC_008700	G	7	7	4287664	4287670	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9158	NC_008700	AACTT	2	10	4290334	4290343	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9159	NC_008700	TCGAA	2	10	4290344	4290353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9160	NC_008700	AGAT	2	8	4290354	4290361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9161	NC_008700	TGG	2	6	4290424	4290429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9162	NC_008700	GCA	2	6	4292602	4292607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9163	NC_008700	A	6	6	4292697	4292702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9164	NC_008700	GCG	2	6	4292703	4292708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9165	NC_008700	AAG	2	6	4292729	4292734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9166	NC_008700	AGG	2	6	4294104	4294109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9167	NC_008700	GCC	2	6	4294146	4294151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9168	NC_008700	AGA	2	6	4294170	4294175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9169	NC_008700	A	6	6	4294198	4294203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9170	NC_008700	T	6	6	4294220	4294225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9171	NC_008700	CAGG	2	8	4294686	4294693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9172	NC_008700	CGA	2	6	4297029	4297034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9173	NC_008700	CCT	2	6	4299619	4299624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9174	NC_008700	ATCTAA	2	12	4299918	4299929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9175	NC_008700	TGA	2	6	4299936	4299941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9176	NC_008700	A	7	7	4299950	4299956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9177	NC_008700	TTC	2	6	4299958	4299963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9178	NC_008700	ACA	2	6	4301205	4301210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9179	NC_008700	TGT	2	6	4303075	4303080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9180	NC_008700	TGC	2	6	4303131	4303136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9181	NC_008700	TGG	2	6	4303803	4303808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9182	NC_008700	TAT	2	6	4303811	4303816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9183	NC_008700	TA	3	6	4305899	4305904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9184	NC_008700	TTA	2	6	4305925	4305930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9185	NC_008700	GGGTAA	2	12	4305948	4305959	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9186	NC_008700	ATA	2	6	4305977	4305982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9187	NC_008700	AGATC	2	10	4306101	4306110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9188	NC_008700	AT	3	6	4306117	4306122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9189	NC_008700	ATT	2	6	4306132	4306137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...78910111213141516171819Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.