MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 12467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008577	GAG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008577	AAC	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008577	TAT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008577	AGCT	2	8	768	775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008577	TA	3	6	2795	2800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008577	TCT	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008577	TTAT	2	8	2859	2866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008577	ATA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008577	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008577	T	6	6	3045	3050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008577	GGT	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008577	CT	3	6	3556	3561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008577	TAAA	2	8	5299	5306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008577	A	6	6	5304	5309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008577	T	6	6	5339	5344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008577	ATC	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008577	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008577	GCC	2	6	6791	6796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008577	ACTTA	2	10	9058	9067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008577	ACG	3	9	9098	9106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008577	GCC	2	6	9122	9127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008577	ATG	2	6	9204	9209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008577	A	6	6	9268	9273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008577	CAA	2	6	9308	9313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008577	CA	3	6	9368	9373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008577	AGA	2	6	9376	9381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008577	GTA	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008577	TAA	2	6	9476	9481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008577	TTG	2	6	9499	9504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008577	TGA	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008577	TTG	2	6	9560	9565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008577	ATT	2	6	9572	9577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008577	T	6	6	9576	9581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008577	TGA	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008577	CGC	2	6	12181	12186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008577	GCG	2	6	12193	12198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008577	TTG	2	6	12223	12228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008577	GGAT	2	8	12241	12248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008577	ATG	2	6	12261	12266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008577	TGA	2	6	12304	12309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008577	GA	3	6	13405	13410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008577	TGAT	2	8	15865	15872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008577	A	6	6	15873	15878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008577	AGCTT	2	10	15884	15893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008577	TTTG	2	8	15900	15907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008577	ATAG	2	8	16668	16675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008577	A	6	6	18765	18770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008577	T	6	6	18786	18791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008577	T	6	6	21873	21878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008577	CTT	2	6	21881	21886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008577	TTG	2	6	22565	22570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008577	CTT	2	6	28069	28074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008577	A	6	6	28204	28209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008577	GAAG	2	8	28231	28238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008577	CCA	2	6	31619	31624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008577	CT	3	6	31647	31652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008577	CAG	2	6	31659	31664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008577	CAT	2	6	31672	31677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008577	TG	3	6	31687	31692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008577	ACA	2	6	31720	31725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008577	GTG	2	6	31829	31834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008577	ATTTT	2	10	31878	31887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008577	T	7	7	31993	31999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008577	AAT	2	6	34040	34045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008577	TTTA	2	8	36545	36552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008577	GAT	2	6	38649	38654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008577	ACTG	2	8	42896	42903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008577	ACA	2	6	44165	44170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008577	ATT	2	6	44171	44176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008577	TGA	2	6	45691	45696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008577	AGG	2	6	45707	45712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008577	T	6	6	45723	45728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008577	TG	3	6	45752	45757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008577	TGG	2	6	45788	45793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008577	ATTCA	2	10	46470	46479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008577	ACTGC	2	10	48475	48484	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008577	GC	3	6	48500	48505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008577	ACA	2	6	48551	48556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008577	CACAA	2	10	49833	49842	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008577	A	6	6	50437	50442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008577	ACTG	2	8	50483	50490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008577	A	6	6	50519	50524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008577	CAG	2	6	50591	50596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008577	AGCGAA	2	12	50599	50610	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008577	AAG	2	6	50663	50668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008577	AGTG	2	8	50743	50750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008577	TG	3	6	50786	50791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008577	AATG	2	8	50858	50865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008577	TTA	2	6	50893	50898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008577	GGC	2	6	50989	50994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008577	GCA	2	6	51020	51025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008577	GCG	2	6	51053	51058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008577	AGG	2	6	51148	51153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008577	CGA	2	6	51228	51233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008577	GAT	2	6	51253	51258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008577	GCA	2	6	51302	51307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008577	GT	3	6	51355	51360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008577	GAA	2	6	51361	51366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008577	GGA	2	6	51397	51402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008577	AGA	2	6	51444	51449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008577	CAG	2	6	51470	51475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008577	G	6	6	51617	51622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008577	GGA	2	6	51661	51666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008577	GGC	2	6	51681	51686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008577	GAA	2	6	51924	51929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008577	TGC	2	6	52000	52005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008577	GTC	2	6	52012	52017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008577	TGG	2	6	52090	52095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008577	GGA	2	6	52126	52131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008577	GAC	2	6	52139	52144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008577	TCA	2	6	52151	52156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008577	AC	3	6	52177	52182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008577	TCG	2	6	52244	52249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008577	AC	3	6	52346	52351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008577	AAG	2	6	52382	52387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008577	CAC	2	6	52416	52421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008577	CCT	2	6	52487	52492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008577	TGTT	2	8	52513	52520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008577	CA	3	6	52528	52533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008577	TTG	2	6	52540	52545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008577	TAAT	2	8	52626	52633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008577	ATG	2	6	52637	52642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008577	A	6	6	52663	52668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008577	TCT	2	6	52726	52731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008577	ACG	2	6	52769	52774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008577	GTA	2	6	52862	52867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008577	TCA	2	6	52949	52954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008577	TAG	2	6	53042	53047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008577	GCGA	2	8	53050	53057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008577	TGA	2	6	53153	53158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008577	G	6	6	53199	53204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008577	TCC	2	6	53209	53214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008577	CTGA	2	8	53229	53236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008577	GGA	2	6	53519	53524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008577	CGG	2	6	53741	53746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008577	CGTC	2	8	53754	53761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008577	AAC	2	6	53773	53778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008577	AGC	2	6	53863	53868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008577	CAT	2	6	53869	53874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008577	AAAG	2	8	53877	53884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008577	AGTCG	2	10	53899	53908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008577	ACC	2	6	53941	53946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008577	TGAAGG	2	12	54004	54015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008577	GA	3	6	54216	54221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008577	AGGCT	2	10	54228	54237	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008577	GCG	2	6	54241	54246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008577	GGT	2	6	54265	54270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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