MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 9467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008532	ATT	2	6	1606248	1606253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_008532	TCC	2	6	1606801	1606806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_008532	T	8	8	1607952	1607959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_008532	TAA	2	6	1607968	1607973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_008532	TGGC	2	8	1608031	1608038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_008532	CAAA	2	8	1608067	1608074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_008532	ATTAG	2	10	1608153	1608162	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_008532	AAG	2	6	1608198	1608203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_008532	ATAA	2	8	1608287	1608294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_008532	TGC	2	6	1608360	1608365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_008532	A	6	6	1608379	1608384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_008532	TAG	2	6	1608403	1608408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_008532	TCAC	2	8	1608474	1608481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_008532	TAAG	2	8	1608536	1608543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_008532	CCA	2	6	1608556	1608561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_008532	TAGC	2	8	1608575	1608582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8017	NC_008532	AAGAT	2	10	1608601	1608610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_008532	CA	3	6	1608688	1608693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_008532	A	6	6	1608733	1608738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_008532	CTA	2	6	1608743	1608748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_008532	TTTAGT	2	12	1608860	1608871	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_008532	TCA	2	6	1608876	1608881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_008532	CAT	3	9	1608930	1608938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_008532	CAAA	2	8	1608940	1608947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_008532	TTC	2	6	1608959	1608964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_008532	T	6	6	1608974	1608979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_008532	ATA	2	6	1609019	1609024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_008532	TCAA	2	8	1609055	1609062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_008532	TCA	2	6	1609107	1609112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_008532	AGA	2	6	1609113	1609118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_008532	TCT	2	6	1609224	1609229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_008532	CAAT	2	8	1609236	1609243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8033	NC_008532	TGA	2	6	1609244	1609249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_008532	TCAA	2	8	1609326	1609333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_008532	TC	3	6	1609376	1609381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_008532	AATT	2	8	1609394	1609401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_008532	GTC	2	6	1609410	1609415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_008532	ATT	2	6	1609427	1609432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_008532	AG	3	6	1609470	1609475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_008532	CCTCTA	2	12	1609518	1609529	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_008532	AT	3	6	1609538	1609543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_008532	CTTT	2	8	1609547	1609554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_008532	TTC	3	9	1609630	1609638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_008532	CATAAA	2	12	1609648	1609659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8045	NC_008532	A	7	7	1609930	1609936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_008532	CT	3	6	1609945	1609950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_008532	AGC	2	6	1609958	1609963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_008532	TAT	2	6	1609985	1609990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_008532	A	7	7	1610006	1610012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_008532	T	6	6	1610315	1610320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_008532	A	7	7	1610364	1610370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_008532	AG	3	6	1610376	1610381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_008532	GCCACT	2	12	1613243	1613254	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_008532	TC	3	6	1613291	1613296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_008532	A	7	7	1613367	1613373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_008532	GCT	2	6	1613425	1613430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_008532	ATA	2	6	1613478	1613483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_008532	ACTTA	2	10	1613492	1613501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8059	NC_008532	AGG	2	6	1613513	1613518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_008532	CTT	2	6	1614484	1614489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_008532	ATA	2	6	1614513	1614518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_008532	T	6	6	1615245	1615250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_008532	GCTG	2	8	1615271	1615278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_008532	AGAAA	2	10	1615307	1615316	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_008532	TC	3	6	1616255	1616260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8066	NC_008532	A	6	6	1616291	1616296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_008532	A	7	7	1616306	1616312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_008532	ATT	2	6	1616330	1616335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_008532	TA	3	6	1616591	1616596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_008532	TCC	2	6	1617447	1617452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_008532	ATA	2	6	1617526	1617531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_008532	ATA	2	6	1617649	1617654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_008532	AC	3	6	1618652	1618657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8074	NC_008532	A	6	6	1618715	1618720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_008532	TG	3	6	1618743	1618748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_008532	CTA	2	6	1618764	1618769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_008532	T	6	6	1618795	1618800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_008532	TTGAT	2	10	1618811	1618820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_008532	TTAA	2	8	1618873	1618880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_008532	GAT	2	6	1618928	1618933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_008532	CTA	2	6	1618955	1618960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_008532	CCT	2	6	1619026	1619031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_008532	TGA	2	6	1619032	1619037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_008532	T	6	6	1619114	1619119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_008532	A	6	6	1619121	1619126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_008532	ATA	2	6	1620376	1620381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_008532	TTTA	2	8	1620573	1620580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_008532	ATA	2	6	1620881	1620886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_008532	TG	3	6	1620899	1620904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_008532	CTC	2	6	1620933	1620938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8098	NC_008532	CTA	2	6	1621734	1621739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_008532	AATC	2	8	1621819	1621826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8103	NC_008532	TTAA	2	8	1621909	1621916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_008532	AAT	2	6	1621935	1621940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_008532	AGT	2	6	1621955	1621960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8110	NC_008532	ATAA	2	8	1624851	1624858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_008532	AG	3	6	1627334	1627339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_008532	AT	3	6	1627367	1627372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_008532	A	6	6	1627388	1627393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_008532	TTA	2	6	1628286	1628291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_008532	TGG	2	6	1628305	1628310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_008532	CTC	2	6	1628418	1628423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_008532	ATC	2	6	1628426	1628431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_008532	A	7	7	1628433	1628439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_008532	TTC	2	6	1628510	1628515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_008532	T	6	6	1628572	1628577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_008532	ATAAG	2	10	1630137	1630146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_008532	TTA	2	6	1630164	1630169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8124	NC_008532	A	6	6	1632695	1632700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_008532	TAT	2	6	1635953	1635958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_008532	AGT	2	6	1635965	1635970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8130	NC_008532	AAT	2	6	1636041	1636046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_008532	TAC	2	6	1636072	1636077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_008532	TTGAC	2	10	1636129	1636138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8134	NC_008532	GAAA	2	8	1636170	1636177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8166	NC_008532	ATTCA	2	10	1641476	1641485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8167	NC_008532	A	7	7	1641488	1641494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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