MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 9467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008532	AGA	2	6	1248145	1248150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_008532	TA	3	6	1248164	1248169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_008532	TA	3	6	1248172	1248177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_008532	T	6	6	1248197	1248202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_008532	T	6	6	1248218	1248223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_008532	AGG	2	6	1248243	1248248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_008532	CAA	2	6	1248634	1248639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_008532	T	6	6	1248656	1248661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_008532	TATCC	2	10	1248691	1248700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6510	NC_008532	AATAA	2	10	1248707	1248716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_008532	ATT	2	6	1248736	1248741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_008532	ATA	2	6	1248767	1248772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_008532	ACA	2	6	1248779	1248784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_008532	CTT	2	6	1249044	1249049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_008532	AAT	2	6	1249114	1249119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_008532	TAAA	2	8	1249205	1249212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_008532	AAATA	2	10	1249217	1249226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_008532	TAA	2	6	1249232	1249237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_008532	ATT	2	6	1249912	1249917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_008532	AAAT	2	8	1249973	1249980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_008532	ATT	2	6	1249993	1249998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_008532	A	7	7	1250013	1250019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_008532	CGA	2	6	1250126	1250131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_008532	GAA	2	6	1250144	1250149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_008532	TTA	2	6	1250160	1250165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_008532	ACT	2	6	1250570	1250575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_008532	TAGA	2	8	1250600	1250607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_008532	TCA	2	6	1250663	1250668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_008532	T	6	6	1250735	1250740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_008532	A	6	6	1250832	1250837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_008532	CAT	2	6	1250864	1250869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_008532	AATA	2	8	1250962	1250969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_008532	AC	3	6	1250992	1250997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_008532	T	7	7	1251022	1251028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_008532	AAT	2	6	1251117	1251122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_008532	T	6	6	1253233	1253238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_008532	CTAG	2	8	1253239	1253246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_008532	T	6	6	1253251	1253256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_008532	TTAAT	2	10	1253415	1253424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_008532	T	6	6	1253434	1253439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_008532	T	6	6	1253448	1253453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_008532	A	6	6	1253479	1253484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_008532	TCTT	2	8	1253548	1253555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6544	NC_008532	TCAAA	2	10	1253605	1253614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6545	NC_008532	A	6	6	1253612	1253617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_008532	TCTT	2	8	1253623	1253630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6547	NC_008532	CCTA	2	8	1253690	1253697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_008532	CATT	2	8	1253709	1253716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6549	NC_008532	A	6	6	1253762	1253767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_008532	TAA	3	9	1253833	1253841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_008532	ATT	2	6	1253861	1253866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_008532	AT	3	6	1255640	1255645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_008532	T	6	6	1255691	1255696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_008532	TTA	2	6	1255699	1255704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_008532	A	6	6	1255714	1255719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_008532	TA	3	6	1255795	1255800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_008532	CCTA	2	8	1255840	1255847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6558	NC_008532	A	6	6	1255912	1255917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_008532	GCT	2	6	1255962	1255967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_008532	TAA	3	9	1256033	1256041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_008532	AGA	2	6	1256194	1256199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_008532	GTTG	2	8	1256211	1256218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_008532	TTA	2	6	1256248	1256253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_008532	ACTA	2	8	1256276	1256283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_008532	AAAG	2	8	1256293	1256300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_008532	GCA	2	6	1256746	1256751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6568	NC_008532	ATC	2	6	1257077	1257082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_008532	AG	3	6	1257089	1257094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_008532	CT	3	6	1258080	1258085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_008532	GTAA	2	8	1258100	1258107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_008532	ATAA	2	8	1258131	1258138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6580	NC_008532	TTA	2	6	1258556	1258561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_008532	CAG	2	6	1258566	1258571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6599	NC_008532	TCT	2	6	1264293	1264298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6606	NC_008532	ATC	2	6	1264799	1264804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6611	NC_008532	ATG	2	6	1265439	1265444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_008532	A	7	7	1265447	1265453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_008532	TCCG	2	8	1265454	1265461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_008532	T	6	6	1265465	1265470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_008532	GTT	2	6	1265535	1265540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6617	NC_008532	TAT	2	6	1265615	1265620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6619	NC_008532	CATT	2	8	1270032	1270039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6620	NC_008532	T	6	6	1270113	1270118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_008532	A	6	6	1270132	1270137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_008532	TC	3	6	1270138	1270143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6623	NC_008532	TGT	3	9	1270251	1270259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6627	NC_008532	GTA	2	6	1270578	1270583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6629	NC_008532	ATT	2	6	1270625	1270630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6631	NC_008532	AC	3	6	1270772	1270777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6632	NC_008532	AAT	2	6	1270844	1270849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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