MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_008345	CATTA	2	10	4416738	4416747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14502	NC_008345	ATGTT	2	10	4416849	4416858	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_008345	AGA	2	6	4416865	4416870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_008345	TAAC	2	8	4418410	4418417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14505	NC_008345	AT	3	6	4418442	4418447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_008345	GAT	2	6	4418470	4418475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_008345	T	6	6	4418482	4418487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_008345	GTAAA	2	10	4419977	4419986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_008345	A	8	8	4420018	4420025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_008345	ATC	2	6	4421563	4421568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_008345	AAAT	2	8	4421593	4421600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_008345	ATA	2	6	4424720	4424725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_008345	T	6	6	4424761	4424766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_008345	TTG	2	6	4424830	4424835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_008345	ACA	2	6	4424904	4424909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_008345	TAC	2	6	4424956	4424961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_008345	ATTA	2	8	4425418	4425425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_008345	CTAT	2	8	4425448	4425455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14519	NC_008345	CAG	2	6	4425474	4425479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_008345	TCAA	2	8	4425544	4425551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14521	NC_008345	ACT	2	6	4425594	4425599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_008345	AGT	2	6	4425656	4425661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_008345	CA	3	6	4425669	4425674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14524	NC_008345	TCA	2	6	4425684	4425689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_008345	ATC	2	6	4425699	4425704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_008345	TTG	2	6	4425732	4425737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_008345	TC	3	6	4426724	4426729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14528	NC_008345	AAAC	2	8	4426817	4426824	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14529	NC_008345	ACT	2	6	4426866	4426871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_008345	CTG	2	6	4426876	4426881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_008345	AATT	2	8	4426898	4426905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_008345	TCA	2	6	4426909	4426914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_008345	T	7	7	4426926	4426932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_008345	T	6	6	4426947	4426952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_008345	GCG	2	6	4426998	4427003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_008345	A	8	8	4427558	4427565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_008345	TCAG	2	8	4427584	4427591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14538	NC_008345	GAT	2	6	4427634	4427639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_008345	T	6	6	4427649	4427654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_008345	GAT	2	6	4432502	4432507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_008345	TTA	2	6	4432520	4432525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_008345	CA	3	6	4432564	4432569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14543	NC_008345	AG	3	6	4432570	4432575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_008345	CAA	2	6	4432594	4432599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_008345	CT	3	6	4434104	4434109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14546	NC_008345	T	6	6	4434109	4434114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_008345	TAT	2	6	4434177	4434182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_008345	CCA	2	6	4440773	4440778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14549	NC_008345	CAG	2	6	4440811	4440816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_008345	CAC	2	6	4440820	4440825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14551	NC_008345	GT	3	6	4441485	4441490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_008345	CAG	2	6	4442997	4443002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_008345	AGA	3	9	4444086	4444094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_008345	T	9	9	4444167	4444175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_008345	A	7	7	4444188	4444194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_008345	T	6	6	4444239	4444244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_008345	A	6	6	4451161	4451166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_008345	ATA	2	6	4451175	4451180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_008345	AAC	2	6	4451219	4451224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14560	NC_008345	TTTA	2	8	4451237	4451244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_008345	T	7	7	4451290	4451296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_008345	A	6	6	4451303	4451308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_008345	A	9	9	4451312	4451320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_008345	TTA	2	6	4451337	4451342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_008345	ACTC	2	8	4452555	4452562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14566	NC_008345	ACA	2	6	4452578	4452583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_008345	ATA	2	6	4452588	4452593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14573	NC_008345	ATTA	2	8	4462730	4462737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_008345	TGA	2	6	4462749	4462754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14579	NC_008345	TGAA	2	8	4462924	4462931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_008345	AAAC	2	8	4462969	4462976	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14589	NC_008345	TA	3	6	4466467	4466472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14593	NC_008345	CTAA	2	8	4466533	4466540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14594	NC_008345	AT	4	8	4466551	4466558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_008345	T	7	7	4466671	4466677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14599	NC_008345	A	6	6	4466735	4466740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_008345	A	6	6	4466742	4466747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_008345	TGCAA	2	10	4466777	4466786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14602	NC_008345	CAC	2	6	4467052	4467057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14603	NC_008345	TAA	2	6	4467065	4467070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_008345	ATA	2	6	4467091	4467096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14609	NC_008345	TAT	3	9	4468504	4468512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_008345	T	6	6	4468520	4468525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_008345	TA	3	6	4468569	4468574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_008345	ACT	2	6	4468634	4468639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14615	NC_008345	A	7	7	4471853	4471859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14618	NC_008345	GCAA	2	8	4471949	4471956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14619	NC_008345	CTG	2	6	4474313	4474318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14621	NC_008345	TAA	2	6	4475015	4475020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_008345	ATT	2	6	4476359	4476364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14627	NC_008345	ATG	2	6	4477311	4477316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14629	NC_008345	CGT	2	6	4477382	4477387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14893	NC_008345	TGA	2	6	4520853	4520858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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