MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008345	ATG	2	6	3499846	3499851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_008345	ATT	2	6	3499890	3499895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_008345	ACC	2	6	3499973	3499978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_008345	A	6	6	3499982	3499987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_008345	A	6	6	3500535	3500540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_008345	T	6	6	3500557	3500562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_008345	TAA	2	6	3501251	3501256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_008345	TTA	2	6	3501262	3501267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_008345	TCA	2	6	3501294	3501299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_008345	GTA	2	6	3501300	3501305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_008345	AAG	2	6	3501314	3501319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_008345	CTTTA	2	10	3501378	3501387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11513	NC_008345	A	7	7	3501464	3501470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_008345	CAA	2	6	3501474	3501479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_008345	T	6	6	3501552	3501557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_008345	GCA	2	6	3501585	3501590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_008345	CAA	2	6	3501606	3501611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_008345	ACA	2	6	3501669	3501674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_008345	ATT	2	6	3502044	3502049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_008345	TC	4	8	3502050	3502057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_008345	CTTT	2	8	3502079	3502086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11522	NC_008345	TGA	2	6	3502112	3502117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_008345	A	7	7	3502170	3502176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_008345	T	6	6	3502197	3502202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_008345	GAAAAT	2	12	3502243	3502254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_008345	T	6	6	3502279	3502284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_008345	AC	3	6	3504313	3504318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_008345	TTAA	2	8	3504806	3504813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_008345	TAA	2	6	3504855	3504860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_008345	CT	3	6	3507126	3507131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_008345	GAC	2	6	3507135	3507140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_008345	GATTT	2	10	3507160	3507169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_008345	ACAAT	2	10	3507181	3507190	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11534	NC_008345	A	6	6	3507280	3507285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_008345	A	6	6	3507311	3507316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_008345	CTT	2	6	3507325	3507330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11539	NC_008345	GTT	2	6	3507413	3507418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_008345	GTT	2	6	3507431	3507436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_008345	GTT	2	6	3507449	3507454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_008345	GTT	2	6	3507485	3507490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_008345	GTT	2	6	3507503	3507508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_008345	GTT	2	6	3507521	3507526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_008345	TAT	2	6	3507534	3507539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_008345	CA	3	6	3507550	3507555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11547	NC_008345	CGG	2	6	3507573	3507578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_008345	GTT	2	6	3507579	3507584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_008345	TAA	2	6	3507992	3507997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_008345	TGT	2	6	3508757	3508762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_008345	AGAA	2	8	3509646	3509653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_008345	TGA	2	6	3509698	3509703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_008345	TTG	2	6	3509721	3509726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_008345	TAACC	2	10	3509744	3509753	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11555	NC_008345	GAA	2	6	3511254	3511259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_008345	TAAA	2	8	3511283	3511290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_008345	TAA	2	6	3511366	3511371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_008345	AAT	2	6	3511372	3511377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_008345	ATTA	2	8	3511432	3511439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_008345	AAT	2	6	3512323	3512328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_008345	AAT	2	6	3512330	3512335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_008345	CAC	2	6	3512378	3512383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_008345	A	6	6	3513694	3513699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_008345	T	6	6	3513715	3513720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_008345	TC	3	6	3514275	3514280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_008345	AGGA	2	8	3514299	3514306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_008345	TTG	2	6	3514363	3514368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11569	NC_008345	ATC	2	6	3514452	3514457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_008345	GTT	3	9	3514472	3514480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_008345	A	7	7	3514524	3514530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_008345	A	6	6	3515785	3515790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_008345	TAT	2	6	3515791	3515796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_008345	CTG	2	6	3519169	3519174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_008345	GT	3	6	3519176	3519181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_008345	AT	3	6	3519272	3519277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_008345	CGC	2	6	3519295	3519300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11579	NC_008345	TGC	2	6	3519344	3519349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_008345	TTG	2	6	3519353	3519358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_008345	TGTAG	2	10	3519383	3519392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_008345	CAA	2	6	3519432	3519437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_008345	TTG	2	6	3519476	3519481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_008345	GTG	2	6	3519502	3519507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_008345	GCA	2	6	3519521	3519526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_008345	TGC	2	6	3521413	3521418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11589	NC_008345	ATG	2	6	3521435	3521440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_008345	G	7	7	3521470	3521476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_008345	ATT	2	6	3521518	3521523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11593	NC_008345	AC	3	6	3521554	3521559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_008345	CAT	2	6	3521599	3521604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11598	NC_008345	A	8	8	3524604	3524611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_008345	ATTT	2	8	3524615	3524622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_008345	TA	3	6	3527104	3527109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_008345	ATCA	2	8	3528039	3528046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11602	NC_008345	ACT	2	6	3528070	3528075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_008345	ATC	2	6	3528110	3528115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_008345	ATTA	2	8	3528132	3528139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_008345	TTA	2	6	3528146	3528151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11607	NC_008345	TTAA	2	8	3528192	3528199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_008345	A	6	6	3529778	3529783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_008345	AAT	3	9	3529816	3529824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_008345	ATTA	2	8	3529891	3529898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_008345	TGCC	2	8	3529930	3529937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11612	NC_008345	A	6	6	3529963	3529968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_008345	AGGT	2	8	3530838	3530845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_008345	TAAC	2	8	3530846	3530853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11615	NC_008345	A	8	8	3530854	3530861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_008345	ACT	2	6	3530874	3530879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11620	NC_008345	TAA	2	6	3534850	3534855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_008345	AAT	2	6	3534862	3534867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_008345	A	6	6	3534905	3534910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_008345	TTAA	2	8	3534920	3534927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_008345	TTAAA	2	10	3534983	3534992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_008345	TTA	2	6	3535053	3535058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_008345	TG	3	6	3535088	3535093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_008345	TATAA	2	10	3535130	3535139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_008345	AAC	2	6	3535141	3535146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11629	NC_008345	CAA	2	6	3535150	3535155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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