MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008345	AAT	2	6	2414497	2414502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_008345	TGA	2	6	2414512	2414517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_008345	ATC	2	6	2414550	2414555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_008345	CGT	2	6	2414586	2414591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_008345	GAT	2	6	2414592	2414597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_008345	A	6	6	2414639	2414644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_008345	GAT	2	6	2414704	2414709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_008345	TAGT	2	8	2416546	2416553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_008345	ATT	2	6	2416555	2416560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_008345	AAT	2	6	2416581	2416586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_008345	TAC	2	6	2416592	2416597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_008345	TAT	2	6	2416619	2416624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_008345	TAA	2	6	2416637	2416642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_008345	ATT	2	6	2416678	2416683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_008345	ATCA	2	8	2416692	2416699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_008345	CTT	2	6	2416719	2416724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_008345	ATT	2	6	2416785	2416790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_008345	TAG	2	6	2416802	2416807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_008345	AAT	2	6	2416816	2416821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_008345	TA	3	6	2416977	2416982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_008345	TAA	2	6	2417056	2417061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_008345	AAT	2	6	2419558	2419563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_008345	TTAT	2	8	2419588	2419595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_008345	AACT	2	8	2419609	2419616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_008345	ATTT	2	8	2421344	2421351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_008345	ACA	2	6	2421366	2421371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_008345	TTG	2	6	2421398	2421403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_008345	AAAC	2	8	2421406	2421413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_008345	AACA	2	8	2421433	2421440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_008345	AAT	3	9	2421441	2421449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_008345	TAG	2	6	2422682	2422687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_008345	A	6	6	2422694	2422699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_008345	TAA	2	6	2423658	2423663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_008345	CG	3	6	2423682	2423687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_008345	TGA	2	6	2423697	2423702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_008345	AGAC	2	8	2423722	2423729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8037	NC_008345	TAA	2	6	2423796	2423801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_008345	AAG	2	6	2423816	2423821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_008345	TTAAC	2	10	2425419	2425428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8040	NC_008345	AATT	2	8	2425438	2425445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_008345	AACT	2	8	2426287	2426294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_008345	TG	3	6	2427504	2427509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_008345	T	6	6	2427512	2427517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_008345	C	6	6	2427569	2427574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8045	NC_008345	TCG	3	9	2427578	2427586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_008345	T	7	7	2427637	2427643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_008345	CGT	2	6	2427672	2427677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_008345	ACA	2	6	2427782	2427787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_008345	A	6	6	2427794	2427799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_008345	TCT	2	6	2427821	2427826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_008345	TTC	2	6	2427937	2427942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_008345	CGGC	2	8	2429209	2429216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_008345	TTC	2	6	2429237	2429242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_008345	TGA	2	6	2429253	2429258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_008345	CAT	2	6	2429500	2429505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_008345	T	7	7	2429526	2429532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_008345	ATT	2	6	2429628	2429633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_008345	TTC	2	6	2430893	2430898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_008345	AAT	2	6	2430910	2430915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_008345	TGA	2	6	2430944	2430949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_008345	CG	3	6	2430957	2430962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_008345	T	6	6	2431098	2431103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_008345	CAG	2	6	2431156	2431161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_008345	TA	3	6	2431170	2431175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_008345	AGC	2	6	2431202	2431207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_008345	AG	3	6	2431334	2431339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_008345	CAGC	2	8	2431384	2431391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_008345	GAA	2	6	2431437	2431442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_008345	AGCTT	2	10	2431469	2431478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8070	NC_008345	CAC	2	6	2431666	2431671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_008345	ATT	2	6	2432176	2432181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_008345	AGGA	2	8	2432214	2432221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_008345	ATAA	2	8	2432229	2432236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_008345	TACTT	2	10	2432243	2432252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8075	NC_008345	CAT	2	6	2432385	2432390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_008345	AGCTT	2	10	2432437	2432446	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8077	NC_008345	ATATGG	2	12	2432480	2432491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_008345	ATG	2	6	2432503	2432508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_008345	CAT	2	6	2432516	2432521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_008345	TTA	2	6	2432595	2432600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_008345	TGT	2	6	2432671	2432676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_008345	GGC	2	6	2432702	2432707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_008345	ACG	2	6	2432783	2432788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_008345	AT	3	6	2432805	2432810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_008345	ATA	2	6	2432818	2432823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_008345	GCA	2	6	2432825	2432830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_008345	TTCA	2	8	2432851	2432858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8088	NC_008345	CGTT	2	8	2433001	2433008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8089	NC_008345	T	6	6	2433007	2433012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_008345	T	6	6	2433017	2433022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_008345	A	6	6	2435444	2435449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_008345	CAT	2	6	2435481	2435486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_008345	TTA	2	6	2437296	2437301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_008345	TAAA	2	8	2437342	2437349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_008345	GCTTA	2	10	2437357	2437366	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8096	NC_008345	AGTG	2	8	2437380	2437387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_008345	TCA	2	6	2437406	2437411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_008345	GTC	2	6	2439468	2439473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_008345	AACTG	2	10	2441658	2441667	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8100	NC_008345	TAA	2	6	2441684	2441689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_008345	TAA	2	6	2441696	2441701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_008345	TGG	2	6	2441745	2441750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_008345	TAA	2	6	2441772	2441777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_008345	T	6	6	2442820	2442825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_008345	A	6	6	2442873	2442878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_008345	TTA	3	9	2443967	2443975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_008345	ATT	2	6	2445698	2445703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_008345	GCT	2	6	2445729	2445734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_008345	ATT	3	9	2445738	2445746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_008345	AC	3	6	2445757	2445762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_008345	AACA	2	8	2445766	2445773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8112	NC_008345	TGC	2	6	2447050	2447055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_008345	AAT	2	6	2447097	2447102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_008345	ATC	2	6	2448049	2448054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_008345	ATGA	2	8	2448579	2448586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_008345	TAA	2	6	2448749	2448754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_008345	CTCAG	2	10	2448867	2448876	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8118	NC_008345	GAT	2	6	2448889	2448894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_008345	CAT	2	6	2448913	2448918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_008345	TCT	2	6	2450742	2450747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_008345	TTA	2	6	2450801	2450806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_008345	CAA	2	6	2450841	2450846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_008345	AGTG	2	8	2451658	2451665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_008345	T	6	6	2451678	2451683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_008345	TTG	2	6	2452823	2452828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_008345	CAAT	2	8	2452901	2452908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_008345	CAAT	2	8	2452915	2452922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_008345	ATAA	2	8	2452927	2452934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_008345	TTA	2	6	2454249	2454254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_008345	T	6	6	2455468	2455473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_008345	T	6	6	2456314	2456319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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