MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008345	TTA	2	6	2152450	2152455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_008345	GAT	2	6	2154783	2154788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_008345	CAA	2	6	2154794	2154799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_008345	ATC	2	6	2154821	2154826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_008345	GCT	2	6	2154827	2154832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_008345	CAT	2	6	2154837	2154842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_008345	TG	3	6	2154845	2154850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_008345	AAT	2	6	2154851	2154856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_008345	TTCAA	2	10	2155339	2155348	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7010	NC_008345	TTC	2	6	2155416	2155421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_008345	CA	3	6	2155424	2155429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_008345	CAA	2	6	2155520	2155525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_008345	TAT	2	6	2155579	2155584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_008345	TACG	2	8	2155612	2155619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7015	NC_008345	CGT	2	6	2155629	2155634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_008345	AGC	2	6	2155746	2155751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_008345	CTAA	2	8	2155768	2155775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_008345	A	6	6	2155774	2155779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_008345	TTA	2	6	2155842	2155847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_008345	T	6	6	2155909	2155914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_008345	TTAT	2	8	2155966	2155973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_008345	TCA	2	6	2156038	2156043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_008345	TTA	2	6	2160289	2160294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_008345	ATTTT	2	10	2160307	2160316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_008345	ATTA	2	8	2160355	2160362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_008345	TTG	2	6	2160414	2160419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_008345	A	7	7	2160491	2160497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_008345	CTT	2	6	2160507	2160512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_008345	CAA	2	6	2160525	2160530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_008345	AGA	2	6	2160565	2160570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_008345	TGG	2	6	2160586	2160591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_008345	G	8	8	2160771	2160778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_008345	G	9	9	2161009	2161017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_008345	ATA	2	6	2161057	2161062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_008345	GAT	2	6	2161185	2161190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_008345	TGC	2	6	2161238	2161243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_008345	GAA	2	6	2161263	2161268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_008345	TTG	2	6	2161291	2161296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_008345	TGA	2	6	2161457	2161462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_008345	TACA	2	8	2161482	2161489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_008345	TTG	2	6	2161562	2161567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_008345	T	6	6	2161595	2161600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_008345	ATA	2	6	2161604	2161609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_008345	AGG	2	6	2161642	2161647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_008345	AGC	2	6	2165349	2165354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_008345	AATA	2	8	2166514	2166521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_008345	ATT	2	6	2166525	2166530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_008345	ACA	2	6	2166531	2166536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_008345	AGA	2	6	2166562	2166567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_008345	GT	4	8	2167873	2167880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_008345	TAT	2	6	2168750	2168755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_008345	TTAA	2	8	2168776	2168783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_008345	GTT	2	6	2170171	2170176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_008345	GTT	3	9	2170187	2170195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_008345	TGTAG	2	10	2170230	2170239	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_008345	AAC	2	6	2170277	2170282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_008345	TTG	2	6	2170323	2170328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_008345	GCA	2	6	2170353	2170358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_008345	TTG	2	6	2171000	2171005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_008345	GAA	2	6	2171058	2171063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_008345	GTT	2	6	2171070	2171075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_008345	CAT	2	6	2171157	2171162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_008345	T	6	6	2171200	2171205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_008345	AAC	2	6	2171226	2171231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_008345	CAA	2	6	2171264	2171269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_008345	TGT	2	6	2171309	2171314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_008345	AAT	2	6	2171400	2171405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_008345	AAC	2	6	2171416	2171421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_008345	TTA	2	6	2171964	2171969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_008345	GAT	2	6	2172087	2172092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_008345	TTA	2	6	2172108	2172113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_008345	AT	3	6	2172140	2172145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_008345	ATT	2	6	2172163	2172168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_008345	GTG	2	6	2172191	2172196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_008345	ACG	2	6	2172243	2172248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7077	NC_008345	AAT	2	6	2172286	2172291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_008345	TAAT	2	8	2172351	2172358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_008345	ATTT	2	8	2172866	2172873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_008345	ATT	2	6	2172895	2172900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_008345	AAG	2	6	2172929	2172934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_008345	A	6	6	2172992	2172997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_008345	TAA	2	6	2173004	2173009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_008345	T	6	6	2173015	2173020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_008345	T	6	6	2173681	2173686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7087	NC_008345	AAT	2	6	2173746	2173751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_008345	CAA	2	6	2173762	2173767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_008345	TAACG	2	10	2173814	2173823	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7090	NC_008345	T	6	6	2173837	2173842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7092	NC_008345	TGT	2	6	2173865	2173870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7096	NC_008345	A	6	6	2175482	2175487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_008345	GTTG	2	8	2175557	2175564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_008345	AGGCG	2	10	2175612	2175621	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7100	NC_008345	GTT	2	6	2175631	2175636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_008345	TAT	2	6	2175642	2175647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_008345	A	6	6	2175653	2175658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7105	NC_008345	GGATT	2	10	2177763	2177772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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7107	NC_008345	CGT	2	6	2177794	2177799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7110	NC_008345	A	6	6	2177937	2177942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_008345	CCAT	2	8	2178051	2178058	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7113	NC_008345	AGCT	2	8	2178148	2178155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7114	NC_008345	ACCCTG	2	12	2178191	2178202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_008345	GAAT	2	8	2178219	2178226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_008345	AAT	2	6	2178230	2178235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_008345	CAAA	2	8	2178291	2178298	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7118	NC_008345	AGC	2	6	2179595	2179600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_008345	AT	3	6	2179661	2179666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_008345	CTA	2	6	2179804	2179809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_008345	G	6	6	2179836	2179841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_008345	CTAG	2	8	2184166	2184173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7123	NC_008345	TAA	2	6	2184202	2184207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_008345	GGAA	2	8	2184208	2184215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_008345	CAT	2	6	2184220	2184225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_008345	AAT	2	6	2184249	2184254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_008345	AT	3	6	2184260	2184265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_008345	GAA	2	6	2184321	2184326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_008345	G	6	6	2184366	2184371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_008345	CGC	2	6	2184469	2184474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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