MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008322	TAA	2	6	4261406	4261411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_008322	AAC	2	6	4261419	4261424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_008322	A	6	6	4261442	4261447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_008322	TATCA	2	10	4261472	4261481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11005	NC_008322	CAG	2	6	4264180	4264185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_008322	TAC	2	6	4264188	4264193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_008322	A	6	6	4264320	4264325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_008322	ATT	2	6	4264375	4264380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_008322	T	7	7	4264379	4264385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_008322	T	7	7	4264412	4264418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_008322	AGT	2	6	4264512	4264517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_008322	CAG	2	6	4265179	4265184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_008322	A	6	6	4265200	4265205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_008322	GTT	2	6	4267313	4267318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_008322	A	6	6	4269738	4269743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_008322	TGAG	2	8	4269803	4269810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_008322	CAT	2	6	4269832	4269837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_008322	AAT	2	6	4269853	4269858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_008322	CGC	2	6	4269868	4269873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_008322	ATA	2	6	4269888	4269893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_008322	A	6	6	4269896	4269901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_008322	TGA	2	6	4274411	4274416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_008322	A	6	6	4274507	4274512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_008322	A	6	6	4274534	4274539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_008322	GGA	2	6	4276006	4276011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_008322	AGC	2	6	4276111	4276116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_008322	TA	3	6	4280836	4280841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_008322	AATG	2	8	4280848	4280855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_008322	TGAG	2	8	4281696	4281703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_008322	A	6	6	4281893	4281898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_008322	A	6	6	4281959	4281964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_008322	ATG	2	6	4282011	4282016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_008322	A	6	6	4282893	4282898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_008322	CTC	2	6	4282941	4282946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_008322	TAT	2	6	4283504	4283509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_008322	ACT	2	6	4283525	4283530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_008322	AT	3	6	4283552	4283557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_008322	AGA	2	6	4283573	4283578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_008322	ACC	2	6	4283599	4283604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_008322	GGT	2	6	4283665	4283670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_008322	GCAA	3	12	4283687	4283698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11042	NC_008322	AGT	2	6	4284676	4284681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_008322	TGC	2	6	4284683	4284688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_008322	AATA	2	8	4284812	4284819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_008322	AAC	2	6	4284900	4284905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_008322	ACC	2	6	4285002	4285007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11047	NC_008322	AAC	2	6	4285060	4285065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_008322	TAT	2	6	4285086	4285091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_008322	CTAA	2	8	4285109	4285116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11050	NC_008322	T	6	6	4285215	4285220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_008322	T	6	6	4285249	4285254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_008322	AAT	2	6	4285261	4285266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_008322	TTA	2	6	4285271	4285276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_008322	CCA	2	6	4285284	4285289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_008322	T	8	8	4285303	4285310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_008322	AC	3	6	4285356	4285361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11057	NC_008322	AAG	2	6	4285473	4285478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_008322	AC	3	6	4285543	4285548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_008322	ACA	2	6	4285641	4285646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_008322	CAGA	2	8	4285662	4285669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11061	NC_008322	TTG	2	6	4285681	4285686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_008322	AAAGC	2	10	4285751	4285760	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11063	NC_008322	TTAA	2	8	4285839	4285846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_008322	T	7	7	4286379	4286385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_008322	TA	4	8	4288175	4288182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_008322	TAA	2	6	4288192	4288197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_008322	TAGC	2	8	4288206	4288213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11068	NC_008322	A	7	7	4289543	4289549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_008322	CAT	2	6	4290562	4290567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_008322	GCT	2	6	4291952	4291957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_008322	AAT	2	6	4292265	4292270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_008322	AGATTT	2	12	4292716	4292727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_008322	GCA	2	6	4292754	4292759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_008322	ATTC	2	8	4292761	4292768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_008322	ATT	2	6	4292811	4292816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_008322	CTT	2	6	4292817	4292822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_008322	GCC	2	6	4293400	4293405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_008322	TAT	2	6	4293427	4293432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_008322	TGT	2	6	4296179	4296184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_008322	TAAT	2	8	4296213	4296220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_008322	TAA	2	6	4296273	4296278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_008322	TTCT	2	8	4296284	4296291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_008322	TGAT	2	8	4296343	4296350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_008322	T	6	6	4297693	4297698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_008322	TCC	2	6	4297731	4297736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_008322	TCG	2	6	4297769	4297774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_008322	A	6	6	4298774	4298779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_008322	CA	3	6	4298818	4298823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11089	NC_008322	GAA	2	6	4298865	4298870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_008322	CA	3	6	4300180	4300185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11091	NC_008322	A	6	6	4300185	4300190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_008322	CTG	2	6	4302996	4303001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_008322	AAC	2	6	4303014	4303019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_008322	CGC	2	6	4303723	4303728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_008322	TAA	2	6	4303749	4303754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_008322	A	6	6	4303791	4303796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_008322	AGG	2	6	4303814	4303819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_008322	AAT	2	6	4303822	4303827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_008322	AGC	2	6	4303848	4303853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_008322	CTG	2	6	4303865	4303870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_008322	GCA	2	6	4303895	4303900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_008322	TTG	2	6	4304662	4304667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_008322	AGC	2	6	4304692	4304697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_008322	A	6	6	4304701	4304706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_008322	AGA	2	6	4304767	4304772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_008322	A	6	6	4304780	4304785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_008322	CAAA	2	8	4304797	4304804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_008322	CAAC	2	8	4304877	4304884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_008322	TAC	2	6	4304929	4304934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_008322	CCT	2	6	4304975	4304980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_008322	TCAC	2	8	4304986	4304993	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11112	NC_008322	T	6	6	4305052	4305057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_008322	CCA	2	6	4305988	4305993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_008322	GGCTTA	2	12	4305996	4306007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11115	NC_008322	A	8	8	4306043	4306050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_008322	CTA	2	6	4306097	4306102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_008322	TGT	2	6	4307445	4307450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_008322	T	6	6	4307481	4307486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_008322	TTA	2	6	4307490	4307495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_008322	AATTG	2	10	4307522	4307531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_008322	ATT	2	6	4307657	4307662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_008322	CTG	2	6	4308435	4308440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_008322	CAA	2	6	4308446	4308451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_008322	CTG	2	6	4308464	4308469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_008322	GTG	2	6	4308499	4308504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_008322	GCC	3	9	4308518	4308526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11127	NC_008322	AAC	2	6	4309639	4309644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_008322	TCA	2	6	4311393	4311398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11130	NC_008322	ATTA	2	8	4312921	4312928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11261	NC_008322	AAG	2	6	4403860	4403865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_008322	TCC	2	6	4404555	4404560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11263	NC_008322	AC	3	6	4406008	4406013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11264	NC_008322	T	7	7	4407289	4407295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11266	NC_008322	CTAAG	2	10	4408310	4408319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11267	NC_008322	CGCT	2	8	4408519	4408526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11268	NC_008322	T	6	6	4408560	4408565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11269	NC_008322	TTA	2	6	4409241	4409246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11270	NC_008322	T	6	6	4409294	4409299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11271	NC_008322	CGG	2	6	4411753	4411758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11276	NC_008322	CTG	2	6	4413929	4413934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11278	NC_008322	T	8	8	4414026	4414033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11281	NC_008322	AC	3	6	4419591	4419596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11284	NC_008322	CAA	2	6	4419707	4419712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11285	NC_008322	TAA	2	6	4419828	4419833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11286	NC_008322	A	6	6	4419832	4419837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11287	NC_008322	GGC	2	6	4419853	4419858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11292	NC_008322	CAT	2	6	4422354	4422359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11375	NC_008322	GTT	2	6	4450248	4450253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11379	NC_008322	GGAA	2	8	4450408	4450415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11380	NC_008322	CTCACC	2	12	4453035	4453046	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11382	NC_008322	TAGG	2	8	4455471	4455478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11383	NC_008322	ATTA	2	8	4455610	4455617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11384	NC_008322	ACAA	2	8	4455696	4455703	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11385	NC_008322	ACA	2	6	4455707	4455712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11386	NC_008322	GAAG	2	8	4455736	4455743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11387	NC_008322	TTGC	2	8	4457441	4457448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11388	NC_008322	ACA	2	6	4459646	4459651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11390	NC_008322	T	6	6	4459680	4459685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11391	NC_008322	TAT	2	6	4460077	4460082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11392	NC_008322	TTA	2	6	4460796	4460801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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