MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 12333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008322	A	7	7	4054352	4054358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_008322	GCTA	2	8	4054378	4054385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10503	NC_008322	TGAATA	2	12	4054391	4054402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_008322	TCC	2	6	4055332	4055337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_008322	GC	3	6	4056560	4056565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10506	NC_008322	CAA	2	6	4056620	4056625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_008322	ACA	2	6	4056630	4056635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_008322	CA	3	6	4056678	4056683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10509	NC_008322	TCCT	2	8	4059210	4059217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10510	NC_008322	AC	3	6	4059240	4059245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10511	NC_008322	AT	3	6	4059312	4059317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_008322	AAATT	2	10	4059373	4059382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_008322	GCT	2	6	4059452	4059457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_008322	ATGA	2	8	4060087	4060094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_008322	GCG	2	6	4060098	4060103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_008322	A	6	6	4060150	4060155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_008322	C	6	6	4061320	4061325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10518	NC_008322	T	6	6	4064035	4064040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_008322	A	7	7	4064052	4064058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_008322	ATT	2	6	4064064	4064069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_008322	T	6	6	4064095	4064100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_008322	TAGG	2	8	4064116	4064123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_008322	A	8	8	4064190	4064197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_008322	TGC	2	6	4064234	4064239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_008322	AAAT	2	8	4066304	4066311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_008322	CTC	2	6	4067635	4067640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10527	NC_008322	TAT	2	6	4067926	4067931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_008322	TA	3	6	4067945	4067950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_008322	AAAT	2	8	4067952	4067959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_008322	T	6	6	4067974	4067979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_008322	TTTAGT	2	12	4067981	4067992	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_008322	TAA	2	6	4068009	4068014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_008322	A	7	7	4068908	4068914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_008322	CTG	2	6	4072753	4072758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_008322	GGA	2	6	4072767	4072772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_008322	AAT	2	6	4074338	4074343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_008322	AC	3	6	4074363	4074368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_008322	A	6	6	4074444	4074449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_008322	ACA	2	6	4074513	4074518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_008322	GTAA	2	8	4075079	4075086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_008322	T	6	6	4075197	4075202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_008322	ACA	2	6	4075224	4075229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_008322	GCATTA	2	12	4075264	4075275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10544	NC_008322	A	6	6	4075325	4075330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_008322	AT	3	6	4075402	4075407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_008322	AAAG	2	8	4075497	4075504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_008322	GCTAAT	2	12	4075532	4075543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10548	NC_008322	TGG	2	6	4075752	4075757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_008322	AGC	2	6	4076088	4076093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_008322	CTT	2	6	4076157	4076162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_008322	CTG	2	6	4076173	4076178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_008322	T	6	6	4076768	4076773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_008322	T	6	6	4076798	4076803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_008322	A	6	6	4076811	4076816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_008322	AAAGG	2	10	4077977	4077986	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_008322	TTGCTT	2	12	4079827	4079838	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10557	NC_008322	CAG	2	6	4084179	4084184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_008322	GAC	2	6	4084221	4084226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_008322	AAAAG	2	10	4085186	4085195	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_008322	CAA	2	6	4085237	4085242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_008322	TAT	2	6	4086837	4086842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_008322	TAT	2	6	4086848	4086853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_008322	CAT	2	6	4086856	4086861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_008322	ATCC	2	8	4086871	4086878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_008322	CAT	2	6	4086909	4086914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_008322	A	6	6	4086953	4086958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_008322	CAACA	2	10	4086986	4086995	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10568	NC_008322	CTG	2	6	4087345	4087350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_008322	GGAT	2	8	4088165	4088172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_008322	CCT	2	6	4088567	4088572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_008322	CGA	2	6	4088678	4088683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_008322	ATG	2	6	4088685	4088690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_008322	ACCTT	2	10	4088716	4088725	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10574	NC_008322	AAT	2	6	4088742	4088747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_008322	ATG	2	6	4090642	4090647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_008322	TCC	2	6	4093068	4093073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10577	NC_008322	CAT	2	6	4093126	4093131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10578	NC_008322	AT	3	6	4096931	4096936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_008322	GAA	2	6	4096943	4096948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_008322	AAT	2	6	4096965	4096970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_008322	TTGA	2	8	4097004	4097011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_008322	TAA	2	6	4098589	4098594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_008322	CGAA	2	8	4098647	4098654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10584	NC_008322	ATC	2	6	4098718	4098723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10585	NC_008322	TTC	2	6	4098742	4098747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10586	NC_008322	GT	3	6	4098768	4098773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_008322	TTTTA	2	10	4101860	4101869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_008322	GCT	2	6	4101907	4101912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_008322	GC	3	6	4101913	4101918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10590	NC_008322	CGC	2	6	4101958	4101963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10591	NC_008322	GGT	2	6	4102006	4102011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_008322	AAT	2	6	4103955	4103960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_008322	TCT	2	6	4104131	4104136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_008322	GA	3	6	4104334	4104339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_008322	TAAA	2	8	4104340	4104347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_008322	AGT	2	6	4104475	4104480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_008322	GAT	2	6	4106490	4106495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_008322	CAAA	2	8	4107822	4107829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10599	NC_008322	ACG	2	6	4107857	4107862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_008322	TCA	2	6	4110810	4110815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_008322	A	6	6	4111157	4111162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_008322	ATG	2	6	4111330	4111335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_008322	AGT	2	6	4111555	4111560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_008322	CT	3	6	4111565	4111570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_008322	TCC	3	9	4111996	4112004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10606	NC_008322	TGC	3	9	4112100	4112108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_008322	TAT	2	6	4112135	4112140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_008322	TACC	2	8	4112142	4112149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10609	NC_008322	TC	3	6	4115621	4115626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_008322	AT	3	6	4115749	4115754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_008322	AAAT	2	8	4115796	4115803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_008322	ACA	2	6	4116754	4116759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_008322	CAA	2	6	4116761	4116766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_008322	TCA	2	6	4116790	4116795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_008322	TTAA	2	8	4117676	4117683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_008322	A	6	6	4117743	4117748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_008322	TTA	2	6	4118847	4118852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_008322	ATC	2	6	4120213	4120218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_008322	AGCA	2	8	4120259	4120266	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10620	NC_008322	TCA	2	6	4120273	4120278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_008322	AG	3	6	4122088	4122093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_008322	CCT	2	6	4122637	4122642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10623	NC_008322	GTACA	2	10	4122664	4122673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10624	NC_008322	TAAG	2	8	4122728	4122735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_008322	TAAA	2	8	4122759	4122766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_008322	TTA	2	6	4122819	4122824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_008322	TAT	2	6	4122862	4122867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_008322	ACGA	2	8	4122891	4122898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10629	NC_008322	TTTG	2	8	4123276	4123283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10630	NC_008322	ACG	2	6	4123308	4123313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10755	NC_008322	GGC	2	6	4169622	4169627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10756	NC_008322	A	7	7	4170911	4170917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10757	NC_008322	GC	3	6	4171852	4171857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10758	NC_008322	GCC	2	6	4173419	4173424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10999	NC_008322	T	7	7	4260695	4260701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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