MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008321	ATGAA	2	10	1619566	1619575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008321	A	6	6	1619613	1619618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008321	CAA	2	6	1623604	1623609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008321	TCA	2	6	1623612	1623617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008321	ATC	2	6	1624657	1624662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_008321	AAT	2	6	1624668	1624673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008321	GTT	2	6	1624695	1624700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008321	CAAT	2	8	1624710	1624717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_008321	TTA	2	6	1624720	1624725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008321	GAAT	2	8	1624769	1624776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008321	ATC	2	6	1624799	1624804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_008321	ACTC	2	8	1625554	1625561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_008321	TTG	2	6	1625569	1625574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008321	GCA	2	6	1625678	1625683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008321	GGAT	2	8	1626115	1626122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008321	AATA	2	8	1626134	1626141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008321	A	6	6	1626152	1626157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008321	T	6	6	1626174	1626179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008321	ATT	2	6	1627502	1627507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008321	CAA	2	6	1627597	1627602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008321	TTAA	2	8	1627625	1627632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008321	TTAA	2	8	1627636	1627643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008321	GGGA	2	8	1627710	1627717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_008321	GAA	2	6	1627749	1627754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008321	TAA	2	6	1627758	1627763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008321	TTA	2	6	1629302	1629307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008321	TAG	2	6	1629353	1629358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008321	AAAG	2	8	1629415	1629422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008321	TTTTA	2	10	1630717	1630726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008321	CTA	2	6	1636119	1636124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008321	TGCCG	2	10	1636138	1636147	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4032	NC_008321	T	6	6	1638158	1638163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008321	GT	3	6	1638190	1638195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008321	A	7	7	1638249	1638255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_008321	AAG	2	6	1638282	1638287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008321	TTA	2	6	1638322	1638327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008321	T	6	6	1638331	1638336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008321	CAG	2	6	1638346	1638351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_008321	GCC	2	6	1638374	1638379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_008321	TC	3	6	1638385	1638390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_008321	AT	3	6	1641873	1641878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008321	A	6	6	1641886	1641891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008321	T	6	6	1641910	1641915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008321	A	6	6	1641941	1641946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008321	TA	3	6	1641957	1641962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008321	ATG	2	6	1641974	1641979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008321	TGT	2	6	1641997	1642002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008321	A	6	6	1642370	1642375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_008321	T	6	6	1642390	1642395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008321	GGC	2	6	1642440	1642445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008321	TGG	2	6	1642459	1642464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008321	AATT	2	8	1642465	1642472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008321	CCA	2	6	1642473	1642478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_008321	GGT	2	6	1642502	1642507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008321	T	6	6	1642530	1642535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008321	T	6	6	1642563	1642568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008321	TGT	2	6	1643369	1643374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008321	GA	3	6	1643397	1643402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008321	A	6	6	1647767	1647772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008321	AGAT	2	8	1647786	1647793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008321	TGTT	2	8	1647908	1647915	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008321	TA	3	6	1650775	1650780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008321	TTG	2	6	1650850	1650855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008321	AAAACA	2	12	1650884	1650895	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4065	NC_008321	GA	3	6	1650908	1650913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008321	T	6	6	1651430	1651435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008321	AACA	2	8	1652043	1652050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_008321	ATGA	2	8	1654238	1654245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008321	TAA	2	6	1654283	1654288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008321	AAT	2	6	1655514	1655519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008321	AG	3	6	1655525	1655530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008321	AGC	2	6	1657703	1657708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_008321	ATT	2	6	1657711	1657716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008321	AAT	2	6	1657749	1657754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008321	CGT	2	6	1659801	1659806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_008321	AGT	2	6	1659852	1659857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008321	ATT	2	6	1659968	1659973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_008321	ATT	2	6	1661292	1661297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008321	A	6	6	1661304	1661309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_008321	T	6	6	1661326	1661331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008321	TTCAG	2	10	1661374	1661383	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_008321	AAT	2	6	1661456	1661461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008321	TG	3	6	1661470	1661475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008321	CAC	2	6	1661533	1661538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_008321	TGAA	2	8	1661585	1661592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008321	GGGATT	2	12	1661627	1661638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_008321	CTG	2	6	1663886	1663891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_008321	CAG	2	6	1663893	1663898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_008321	T	7	7	1663901	1663907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008321	AATA	2	8	1663962	1663969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008321	GC	3	6	1667450	1667455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_008321	T	8	8	1667465	1667472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008321	GCT	2	6	1667477	1667482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_008321	GAAG	2	8	1668343	1668350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008321	ATTT	2	8	1670501	1670508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008321	ATG	2	6	1671099	1671104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008321	TTG	2	6	1671117	1671122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008321	GT	3	6	1672795	1672800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_008321	TGA	2	6	1672848	1672853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008321	T	6	6	1672863	1672868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008321	ATA	2	6	1672875	1672880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008321	TGT	2	6	1674394	1674399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008321	GTT	2	6	1674530	1674535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008321	AAT	2	6	1674537	1674542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008321	GA	3	6	1674634	1674639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008321	GT	3	6	1674659	1674664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008321	TTTTAG	2	12	1675059	1675070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008321	CGG	2	6	1675153	1675158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_008321	AT	3	6	1677398	1677403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008321	GCC	2	6	1677420	1677425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_008321	T	6	6	1677497	1677502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008321	T	7	7	1677540	1677546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008321	A	10	10	1677551	1677560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008321	TGT	2	6	1677605	1677610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008321	GAG	2	6	1677633	1677638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008321	CA	3	6	1677643	1677648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_008321	TTAA	2	8	1677663	1677670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008321	TTG	2	6	1678999	1679004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008321	TGT	2	6	1679032	1679037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008321	ATT	2	6	1679049	1679054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_008321	A	6	6	1679089	1679094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008321	CAT	2	6	1679101	1679106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_008321	TCT	2	6	1679952	1679957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008321	A	6	6	1679998	1680003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008321	TCGT	2	8	1680024	1680031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_008321	T	6	6	1680069	1680074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008321	CTT	2	6	1681957	1681962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_008321	AAT	2	6	1682014	1682019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008321	AAT	2	6	1682027	1682032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_008321	TGA	2	6	1682042	1682047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_008321	AG	3	6	1682086	1682091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_008321	TGAG	2	8	1686570	1686577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_008321	A	6	6	1686579	1686584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008321	TAA	2	6	1686590	1686595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008321	T	6	6	1686600	1686605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008321	T	7	7	1686608	1686614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_008321	AAAT	2	8	1686620	1686627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_008321	CATT	2	8	1686756	1686763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4144	NC_008321	AT	3	6	1687470	1687475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_008321	AT	3	6	1689323	1689328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_008321	ACG	2	6	1689354	1689359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_008321	A	7	7	1739032	1739038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_008321	ATAA	2	8	1739047	1739054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_008321	CAT	2	6	1742994	1742999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4257	NC_008321	T	6	6	1743120	1743125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_008321	ATT	2	6	1743183	1743188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_008321	TAA	2	6	1744020	1744025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_008321	TGACT	2	10	1744045	1744054	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4263	NC_008321	GCC	2	6	1744062	1744067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4266	NC_008321	TTTC	2	8	1744349	1744356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4267	NC_008321	A	6	6	1744363	1744368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_008321	GAG	2	6	1744374	1744379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_008321	T	6	6	1744388	1744393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_008321	GAT	2	6	1744394	1744399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4281	NC_008321	GTTG	2	8	1751953	1751960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_008321	GACT	2	8	1751988	1751995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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