MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008321	TCG	2	6	1192373	1192378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008321	GTC	2	6	1192395	1192400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_008321	AATG	2	8	1192435	1192442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008321	TAA	2	6	1192479	1192484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008321	T	6	6	1192501	1192506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008321	T	6	6	1192569	1192574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008321	T	6	6	1192576	1192581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008321	GGC	2	6	1197272	1197277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_008321	GCC	2	6	1197282	1197287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_008321	GC	4	8	1198753	1198760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_008321	GC	3	6	1198781	1198786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_008321	GA	3	6	1198834	1198839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008321	A	6	6	1199131	1199136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008321	CCT	2	6	1199147	1199152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_008321	T	6	6	1199152	1199157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008321	AAT	2	6	1201289	1201294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008321	ACA	2	6	1201309	1201314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_008321	TCA	2	6	1201361	1201366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_008321	CG	3	6	1201409	1201414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_008321	ATTA	2	8	1201427	1201434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008321	TGTT	2	8	1203620	1203627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008321	TAA	2	6	1203634	1203639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008321	TTC	2	6	1203699	1203704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_008321	T	6	6	1204712	1204717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008321	TC	3	6	1206332	1206337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_008321	AAG	2	6	1206342	1206347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008321	T	6	6	1206364	1206369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008321	GGCGT	2	10	1206416	1206425	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_008321	GTT	2	6	1206475	1206480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008321	TAA	2	6	1206515	1206520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008321	GAC	2	6	1206536	1206541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008321	ACG	2	6	1207431	1207436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_008321	TC	3	6	1207448	1207453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_008321	AAC	2	6	1207485	1207490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_008321	GCAGG	2	10	1208834	1208843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3036	NC_008321	AGT	2	6	1208869	1208874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008321	GTTAA	2	10	1208964	1208973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008321	ACA	2	6	1208984	1208989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_008321	ATT	2	6	1209042	1209047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008321	T	8	8	1209052	1209059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008321	CAAA	2	8	1209111	1209118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_008321	GGC	2	6	1210003	1210008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_008321	TA	3	6	1210069	1210074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008321	ATT	2	6	1210133	1210138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008321	CT	3	6	1210145	1210150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_008321	TAA	2	6	1210241	1210246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008321	AAT	2	6	1210304	1210309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008321	AAT	2	6	1210313	1210318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008321	TATT	2	8	1210355	1210362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008321	TGTAAT	2	12	1211251	1211262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008321	TGT	2	6	1211308	1211313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008321	GAA	2	6	1212674	1212679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008321	GGC	2	6	1213920	1213925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_008321	GCC	2	6	1213935	1213940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_008321	TAA	2	6	1213962	1213967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008321	T	6	6	1214745	1214750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008321	T	6	6	1217204	1217209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008321	TAA	2	6	1220723	1220728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008321	AAAACA	2	12	1222102	1222113	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3060	NC_008321	T	6	6	1222129	1222134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008321	ATG	2	6	1222135	1222140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008321	CA	3	6	1222163	1222168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_008321	CAAT	2	8	1222592	1222599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_008321	T	6	6	1222646	1222651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008321	AAT	2	6	1222717	1222722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008321	TAA	2	6	1223472	1223477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008321	ATC	2	6	1224557	1224562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_008321	AGC	2	6	1227685	1227690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_008321	GTC	2	6	1227727	1227732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_008321	A	6	6	1227776	1227781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008321	TGG	2	6	1227937	1227942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008321	AT	3	6	1232618	1232623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008321	AG	3	6	1232673	1232678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008321	TGT	2	6	1232712	1232717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008321	T	7	7	1232730	1232736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008321	T	6	6	1232753	1232758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_008321	ATT	2	6	1232764	1232769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008321	GGC	2	6	1232801	1232806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_008321	TAT	2	6	1232815	1232820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008321	CAA	2	6	1232828	1232833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_008321	ATG	2	6	1232918	1232923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008321	TC	3	6	1232928	1232933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_008321	CAGC	2	8	1232969	1232976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_008321	CT	4	8	1234401	1234408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_008321	TCCT	2	8	1234870	1234877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_008321	TTTA	2	8	1234930	1234937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008321	ATG	2	6	1237999	1238004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008321	CAA	2	6	1238057	1238062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_008321	CATA	2	8	1238169	1238176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_008321	AATA	2	8	1238307	1238314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008321	CGCATG	2	12	1238479	1238490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_008321	ATCA	2	8	1238508	1238515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_008321	TGAA	2	8	1238531	1238538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008321	GAA	2	6	1238711	1238716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008321	TG	3	6	1238760	1238765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008321	TAT	2	6	1238867	1238872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008321	CAG	2	6	1238958	1238963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_008321	CTA	2	6	1239066	1239071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_008321	ATT	2	6	1239113	1239118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008321	AATTG	2	10	1239130	1239139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008321	CCA	2	6	1239191	1239196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_008321	T	6	6	1239252	1239257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008321	GCG	2	6	1239329	1239334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_008321	TGC	2	6	1239408	1239413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_008321	GAC	2	6	1239478	1239483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_008321	GTC	2	6	1239536	1239541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_008321	TGA	3	9	1239602	1239610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_008321	TTGT	2	8	1239659	1239666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008321	A	6	6	1239693	1239698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008321	AAT	2	6	1241137	1241142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008321	TTCA	2	8	1241195	1241202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_008321	TTTG	2	8	1241265	1241272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008321	AGC	2	6	1241278	1241283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_008321	GTTT	2	8	1241340	1241347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008321	TG	3	6	1241381	1241386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008321	TTG	2	6	1241387	1241392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008321	GTT	2	6	1241405	1241410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008321	TTCTTG	2	12	1241414	1241425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3119	NC_008321	T	6	6	1241454	1241459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008321	TTC	2	6	1241467	1241472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_008321	TGT	2	6	1241487	1241492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008321	T	7	7	1241492	1241498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008321	GTTA	2	8	1241569	1241576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_008321	TGAAAT	2	12	1241651	1241662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008321	GGCAG	2	10	1241681	1241690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3126	NC_008321	TGA	2	6	1241712	1241717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_008321	CGC	2	6	1241747	1241752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_008321	TAC	2	6	1241783	1241788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_008321	TCT	3	9	1243424	1243432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_008321	T	6	6	1244563	1244568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008321	TTGG	2	8	1246842	1246849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008321	GGC	2	6	1246873	1246878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_008321	AAT	2	6	1247080	1247085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_008321	T	6	6	1247099	1247104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_008321	TGAG	2	8	1250057	1250064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_008321	GGT	2	6	1250117	1250122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_008321	T	6	6	1250185	1250190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_008321	CAT	2	6	1251480	1251485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3140	NC_008321	TCG	2	6	1251550	1251555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3142	NC_008321	ATC	2	6	1253348	1253353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3151	NC_008321	AAT	2	6	1254868	1254873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3154	NC_008321	TATT	2	8	1254961	1254968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_008321	TGCC	2	8	1255016	1255023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3156	NC_008321	T	8	8	1259491	1259498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_008321	TCGT	2	8	1265494	1265501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3176	NC_008321	TGAG	2	8	1273821	1273828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3214	NC_008321	AAATT	2	10	1294305	1294314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3243	NC_008321	TTG	2	6	1306956	1306961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_008321	AGCT	2	8	1307212	1307219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3252	NC_008321	TAC	2	6	1308597	1308602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_008321	ATTGGT	2	12	1310469	1310480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_008321	T	7	7	1311879	1311885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_008321	TCC	2	6	1311908	1311913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3261	NC_008321	TTA	2	6	1312999	1313004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_008321	AAGA	2	8	1313523	1313530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_008321	TTG	2	6	1317046	1317051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3266	NC_008321	A	6	6	1318162	1318167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_008321	T	7	7	1318186	1318192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_008321	A	6	6	1320883	1320888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3273	NC_008321	CAG	2	6	1321102	1321107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3399	NC_008321	AGC	2	6	1361673	1361678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3401	NC_008321	TGT	3	9	1364204	1364212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_008321	TGA	2	6	1364255	1364260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3433	NC_008321	GTTA	2	8	1380843	1380850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3441	NC_008321	TGG	2	6	1381366	1381371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_008321	AACTA	2	10	1381445	1381454	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3488	NC_008321	ATTGG	2	10	1393672	1393681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_008321	TGG	2	6	1402097	1402102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_008321	TTAT	2	8	1402902	1402909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_008321	ATCATT	2	12	1402932	1402943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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