MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008321	TCC	2	6	3993390	3993395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_008321	GGA	2	6	3993402	3993407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_008321	AAGG	2	8	3993419	3993426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_008321	T	6	6	3993451	3993456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_008321	ATG	2	6	3997322	3997327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_008321	ATA	2	6	3997364	3997369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_008321	CAAAC	2	10	3997470	3997479	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10008	NC_008321	GAG	2	6	3997511	3997516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_008321	A	6	6	3998550	3998555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_008321	TGAC	2	8	3998566	3998573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_008321	ATT	2	6	3998593	3998598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_008321	CAA	2	6	3999424	3999429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_008321	CAA	2	6	3999469	3999474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_008321	ATG	2	6	4000214	4000219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_008321	CA	3	6	4002472	4002477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_008321	AAC	2	6	4002486	4002491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_008321	TTAAG	2	10	4002498	4002507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_008321	TTGA	2	8	4002742	4002749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_008321	ATT	2	6	4003038	4003043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_008321	AG	3	6	4003061	4003066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_008321	AGC	2	6	4004955	4004960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_008321	ATCA	2	8	4005006	4005013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10023	NC_008321	GACA	2	8	4005023	4005030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_008321	TC	3	6	4005053	4005058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_008321	AG	3	6	4005101	4005106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_008321	A	6	6	4005130	4005135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_008321	ATT	2	6	4005209	4005214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_008321	AGC	2	6	4005257	4005262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_008321	GT	3	6	4005292	4005297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_008321	TGC	2	6	4005306	4005311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_008321	TAA	2	6	4005343	4005348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_008321	GAAG	2	8	4005358	4005365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_008321	A	6	6	4006817	4006822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_008321	AAGC	2	8	4006883	4006890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10035	NC_008321	A	6	6	4006909	4006914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_008321	CCT	2	6	4006915	4006920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_008321	AGT	2	6	4006926	4006931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_008321	CAAA	2	8	4006938	4006945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10039	NC_008321	TTA	2	6	4008187	4008192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_008321	A	6	6	4008226	4008231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_008321	GCG	2	6	4008254	4008259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_008321	A	7	7	4008659	4008665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_008321	A	6	6	4010343	4010348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_008321	TTA	2	6	4010357	4010362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_008321	A	6	6	4010579	4010584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_008321	AG	3	6	4011205	4011210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_008321	CT	3	6	4011221	4011226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_008321	ACA	2	6	4011970	4011975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_008321	GTG	2	6	4011988	4011993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_008321	AGG	2	6	4012938	4012943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_008321	AC	4	8	4012949	4012956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_008321	GCC	2	6	4014691	4014696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_008321	GCG	2	6	4014725	4014730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_008321	ACAG	2	8	4015592	4015599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10055	NC_008321	CCA	2	6	4015627	4015632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_008321	GAC	2	6	4017319	4017324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_008321	TCA	2	6	4018830	4018835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_008321	TAT	2	6	4018843	4018848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_008321	TA	3	6	4018896	4018901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_008321	CTT	3	9	4019117	4019125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_008321	CATTT	2	10	4020039	4020048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10062	NC_008321	CATA	2	8	4020084	4020091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10063	NC_008321	GCA	2	6	4020097	4020102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_008321	ACC	2	6	4020112	4020117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_008321	GA	3	6	4020132	4020137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_008321	AC	3	6	4020154	4020159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_008321	TAAA	2	8	4022884	4022891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_008321	GCC	2	6	4022956	4022961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_008321	ACA	2	6	4027950	4027955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_008321	TAAA	2	8	4028038	4028045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_008321	ATC	2	6	4028096	4028101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_008321	A	6	6	4028122	4028127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_008321	GCA	2	6	4028130	4028135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_008321	A	7	7	4028138	4028144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_008321	AG	3	6	4028149	4028154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_008321	CAA	2	6	4028565	4028570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_008321	TGA	2	6	4028581	4028586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_008321	AAC	2	6	4028599	4028604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_008321	AGA	2	6	4028645	4028650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_008321	A	6	6	4029259	4029264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_008321	ATATCC	2	12	4029268	4029279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_008321	GCAT	2	8	4029287	4029294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10083	NC_008321	TAA	2	6	4029347	4029352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_008321	CTA	2	6	4029450	4029455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_008321	GAT	2	6	4029459	4029464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_008321	TAAC	2	8	4029524	4029531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_008321	ATC	2	6	4029556	4029561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_008321	TAC	2	6	4031942	4031947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_008321	CAA	2	6	4031980	4031985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_008321	TCT	2	6	4034350	4034355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_008321	CTGC	2	8	4034369	4034376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_008321	GTTT	2	8	4034390	4034397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_008321	GCT	2	6	4034398	4034403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_008321	CAC	2	6	4034451	4034456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_008321	GAT	2	6	4034512	4034517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_008321	ACC	2	6	4034637	4034642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_008321	GCC	2	6	4034668	4034673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_008321	TTC	2	6	4035007	4035012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_008321	C	6	6	4035063	4035068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10100	NC_008321	ATA	2	6	4035075	4035080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_008321	GAT	2	6	4036410	4036415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_008321	TTA	2	6	4037440	4037445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_008321	A	6	6	4045458	4045463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_008321	GGTG	2	8	4047007	4047014	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_008321	ATCTC	2	10	4047018	4047027	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10106	NC_008321	A	6	6	4047030	4047035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_008321	ATC	2	6	4047078	4047083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_008321	TCA	3	9	4048004	4048012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_008321	CGC	2	6	4048059	4048064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_008321	A	6	6	4048113	4048118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_008321	GCTT	2	8	4048131	4048138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10112	NC_008321	GGC	2	6	4048141	4048146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_008321	TACT	2	8	4052408	4052415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_008321	A	6	6	4052452	4052457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_008321	T	6	6	4052468	4052473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_008321	GCT	2	6	4052496	4052501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_008321	TTTA	2	8	4052502	4052509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_008321	ATTA	2	8	4052525	4052532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_008321	ATT	2	6	4052573	4052578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_008321	A	6	6	4052610	4052615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_008321	TCT	2	6	4052640	4052645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_008321	ATTTAA	2	12	4052659	4052670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_008321	GTT	2	6	4052700	4052705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_008321	AGC	2	6	4052761	4052766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_008321	TTA	2	6	4052831	4052836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_008321	AGCT	2	8	4052870	4052877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10127	NC_008321	G	6	6	4052881	4052886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_008321	AG	3	6	4052950	4052955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_008321	GCT	2	6	4052988	4052993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_008321	AGG	2	6	4053010	4053015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_008321	TCC	2	6	4053029	4053034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_008321	A	6	6	4053052	4053057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_008321	TA	3	6	4054807	4054812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_008321	TTG	2	6	4054827	4054832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_008321	ACCA	2	8	4054843	4054850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10136	NC_008321	AAAAC	2	10	4054960	4054969	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10137	NC_008321	TTG	2	6	4055100	4055105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_008321	TGA	2	6	4056833	4056838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_008321	CAA	2	6	4057188	4057193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_008321	TGA	2	6	4057208	4057213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_008321	CCA	2	6	4057269	4057274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10142	NC_008321	A	9	9	4057292	4057300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_008321	T	6	6	4057320	4057325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_008321	GCA	2	6	4058780	4058785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_008321	AC	3	6	4058814	4058819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10146	NC_008321	CAA	2	6	4059887	4059892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_008321	CGAT	2	8	4064165	4064172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10148	NC_008321	CTTTT	2	10	4064197	4064206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10149	NC_008321	GGTA	2	8	4064278	4064285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_008321	AAT	2	6	4064710	4064715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10152	NC_008321	CTGT	2	8	4065585	4065592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10153	NC_008321	T	6	6	4067954	4067959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_008321	T	6	6	4067974	4067979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_008321	ATC	2	6	4069699	4069704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10156	NC_008321	ATCA	2	8	4069786	4069793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10157	NC_008321	ACA	2	6	4069889	4069894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10159	NC_008321	TCT	2	6	4069956	4069961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10162	NC_008321	TGT	2	6	4071175	4071180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_008321	AGGA	2	8	4072295	4072302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_008321	T	6	6	4072813	4072818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_008321	AAGCG	2	10	4072828	4072837	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10166	NC_008321	GCTT	2	8	4072840	4072847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10167	NC_008321	TTA	2	6	4072946	4072951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10175	NC_008321	CTAAAT	2	12	4077527	4077538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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10179	NC_008321	TTCAG	2	10	4080533	4080542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10191	NC_008321	TGT	2	6	4088196	4088201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10192	NC_008321	TTG	2	6	4088208	4088213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10200	NC_008321	GAG	2	6	4092992	4092997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10202	NC_008321	TCAG	2	8	4094531	4094538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10204	NC_008321	TGC	2	6	4094558	4094563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10209	NC_008321	T	6	6	4096706	4096711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10223	NC_008321	TATT	2	8	4101905	4101912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10227	NC_008321	CATT	2	8	4102110	4102117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10228	NC_008321	ATT	2	6	4102157	4102162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10231	NC_008321	CAACC	2	10	4102369	4102378	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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10238	NC_008321	AAAAT	2	10	4102691	4102700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_008321	TAA	2	6	4102752	4102757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_008321	AACC	2	8	4102759	4102766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10241	NC_008321	AAT	2	6	4102799	4102804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_008321	CATCAG	2	12	4102826	4102837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_008321	ATA	2	6	4102907	4102912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_008321	TAA	2	6	4102931	4102936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_008321	GAC	2	6	4103026	4103031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_008321	GAA	2	6	4103112	4103117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_008321	G	6	6	4103155	4103160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_008321	AGG	2	6	4103257	4103262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_008321	TCC	2	6	4103276	4103281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10250	NC_008321	GCT	2	6	4103420	4103425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_008321	GTG	2	6	4105213	4105218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_008321	A	7	7	4105290	4105296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_008321	ATATT	2	10	4105301	4105310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_008321	TTAG	2	8	4107936	4107943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_008321	A	10	10	4107967	4107976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_008321	CGG	2	6	4108018	4108023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10257	NC_008321	TG	3	6	4108038	4108043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_008321	AGA	2	6	4108058	4108063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_008321	CGC	2	6	4108231	4108236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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