MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008321	TAT	2	6	2230286	2230291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008321	ACGA	2	8	2231367	2231374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_008321	CAA	2	6	2231386	2231391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_008321	CCT	2	6	2231894	2231899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_008321	AGT	2	6	2232876	2232881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008321	GTT	2	6	2232919	2232924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008321	AACTAA	2	12	2232934	2232945	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5508	NC_008321	CAAG	2	8	2232952	2232959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_008321	A	7	7	2232990	2232996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008321	AAG	2	6	2233005	2233010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_008321	T	7	7	2233095	2233101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008321	GGC	2	6	2235342	2235347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_008321	AGC	2	6	2235476	2235481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_008321	A	6	6	2237039	2237044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008321	GAA	2	6	2237065	2237070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008321	ATTT	2	8	2237855	2237862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008321	ACA	2	6	2237912	2237917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_008321	GTA	2	6	2237991	2237996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008321	GGAT	2	8	2238037	2238044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_008321	TGA	2	6	2239172	2239177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008321	AAT	2	6	2239193	2239198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_008321	TGAT	2	8	2239271	2239278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008321	ATTT	2	8	2239280	2239287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008321	T	6	6	2239285	2239290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008321	TTGT	2	8	2239306	2239313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008321	ATA	2	6	2239428	2239433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008321	TGCG	2	8	2246556	2246563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_008321	TAA	2	6	2246637	2246642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008321	ATC	2	6	2246651	2246656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_008321	ACTA	2	8	2249129	2249136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_008321	GAA	2	6	2249258	2249263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_008321	A	6	6	2250210	2250215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008321	T	6	6	2250253	2250258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_008321	TAT	2	6	2250265	2250270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008321	GCG	2	6	2250309	2250314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_008321	TCG	2	6	2255879	2255884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008321	GCT	2	6	2255941	2255946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008321	AGC	2	6	2258643	2258648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_008321	T	7	7	2261556	2261562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008321	ATT	2	6	2261659	2261664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008321	ATT	2	6	2261695	2261700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_008321	TCATT	2	10	2263567	2263576	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5543	NC_008321	TAG	2	6	2264504	2264509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008321	GAACT	2	10	2264517	2264526	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5545	NC_008321	T	6	6	2264658	2264663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_008321	CCG	2	6	2264685	2264690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_008321	AAG	2	6	2267000	2267005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008321	TAT	2	6	2267059	2267064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008321	GAAC	2	8	2267098	2267105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_008321	ATT	2	6	2267130	2267135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_008321	TTTAA	2	10	2267149	2267158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_008321	TTTA	2	8	2267195	2267202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_008321	ATA	2	6	2267218	2267223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_008321	T	6	6	2267227	2267232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008321	A	6	6	2267240	2267245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008321	AAT	2	6	2267267	2267272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_008321	AT	3	6	2267280	2267285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008321	T	6	6	2267396	2267401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008321	ATA	2	6	2267441	2267446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_008321	TTG	2	6	2267459	2267464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008321	TG	3	6	2267484	2267489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008321	T	6	6	2267515	2267520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008321	TTG	2	6	2267564	2267569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008321	TAAT	2	8	2267589	2267596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008321	TGA	2	6	2267632	2267637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008321	ATGTG	2	10	2267639	2267648	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008321	TGTT	2	8	2267673	2267680	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008321	TTATT	2	10	2267686	2267695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_008321	ACA	2	6	2267793	2267798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_008321	ATA	2	6	2267808	2267813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_008321	TGT	2	6	2267822	2267827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_008321	A	7	7	2267835	2267841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008321	TGAA	2	8	2267853	2267860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008321	ATA	2	6	2267926	2267931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008321	CATT	2	8	2267947	2267954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_008321	TAGA	2	8	2270527	2270534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_008321	T	6	6	2270564	2270569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_008321	ATT	2	6	2270595	2270600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_008321	ATG	2	6	2270652	2270657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008321	ATAA	2	8	2271433	2271440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008321	CTG	2	6	2271449	2271454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_008321	CTT	2	6	2271456	2271461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_008321	CAT	2	6	2271542	2271547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_008321	ACA	2	6	2273332	2273337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_008321	CCA	2	6	2273344	2273349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_008321	T	6	6	2273358	2273363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008321	GTTATC	2	12	2274398	2274409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5588	NC_008321	GCAG	2	8	2274442	2274449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_008321	A	6	6	2274459	2274464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008321	TGAG	2	8	2274498	2274505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_008321	GCA	2	6	2279389	2279394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_008321	AAG	2	6	2279811	2279816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_008321	T	6	6	2279884	2279889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008321	TTGA	2	8	2279891	2279898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_008321	TAA	2	6	2280512	2280517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_008321	AG	3	6	2284504	2284509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_008321	CTG	2	6	2284591	2284596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_008321	GT	3	6	2284635	2284640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008321	AAT	2	6	2284676	2284681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008321	TGA	2	6	2284774	2284779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008321	TGA	2	6	2284818	2284823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008321	T	7	7	2284826	2284832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008321	TG	3	6	2284846	2284851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008321	ATCG	2	8	2284852	2284859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_008321	AGC	2	6	2284868	2284873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_008321	GATCGC	2	12	2284874	2284885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_008321	T	6	6	2284931	2284936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008321	CAA	2	6	2286476	2286481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_008321	TTC	2	6	2286492	2286497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_008321	ACG	2	6	2286568	2286573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_008321	T	7	7	2289561	2289567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008321	TTTTA	2	10	2289578	2289587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008321	A	7	7	2290804	2290810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008321	T	6	6	2290829	2290834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008321	TAAG	2	8	2290910	2290917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_008321	ACA	2	6	2292199	2292204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_008321	A	6	6	2292309	2292314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008321	A	6	6	2292322	2292327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008321	GACT	2	8	2292379	2292386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_008321	T	6	6	2292414	2292419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008321	A	6	6	2292423	2292428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008321	ACG	2	6	2292464	2292469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_008321	CAA	2	6	2292476	2292481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_008321	AGAA	2	8	2292587	2292594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_008321	GAT	2	6	2293921	2293926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_008321	A	6	6	2293959	2293964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008321	GCG	2	6	2293998	2294003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008321	GAT	3	9	2294038	2294046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_008321	T	6	6	2294049	2294054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_008321	GGA	2	6	2294057	2294062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_008321	GAT	2	6	2294790	2294795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_008321	TTA	2	6	2294838	2294843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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