MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008319	TGAT	2	8	1274237	1274244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_008319	GT	3	6	1274252	1274257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008319	CAA	2	6	1274290	1274295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_008319	CTT	2	6	1274300	1274305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_008319	GAC	2	6	1274309	1274314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_008319	A	6	6	1274344	1274349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008319	GAG	2	6	1274371	1274376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008319	GAGG	2	8	1274387	1274394	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008319	TGC	2	6	1274438	1274443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_008319	CCG	2	6	1277315	1277320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_008319	TTC	2	6	1279320	1279325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_008319	AAC	2	6	1279596	1279601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_008319	G	6	6	1280182	1280187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008319	AG	3	6	1280215	1280220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008319	CGTT	2	8	1285656	1285663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_008319	CATT	2	8	1286818	1286825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_008319	TGC	2	6	1287821	1287826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_008319	TGC	2	6	1287829	1287834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_008319	AATG	2	8	1291403	1291410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008319	TTCA	2	8	1291994	1292001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_008319	CTT	2	6	1297816	1297821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_008319	TCAA	2	8	1297836	1297843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_008319	A	8	8	1297856	1297863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008319	CGG	2	6	1298508	1298513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_008319	CAG	2	6	1298514	1298519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_008319	ACTG	2	8	1300986	1300993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_008319	CTT	2	6	1301006	1301011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_008319	AAC	2	6	1303398	1303403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_008319	AAT	2	6	1303463	1303468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_008319	GGA	2	6	1303532	1303537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008319	AGA	2	6	1303570	1303575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008319	CTT	2	6	1303610	1303615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_008319	GCA	2	6	1303674	1303679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_008319	A	6	6	1303716	1303721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008319	TGA	2	6	1303756	1303761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008319	TTC	2	6	1303769	1303774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_008319	GGA	2	6	1303775	1303780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008319	CGA	2	6	1303895	1303900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_008319	TA	3	6	1303914	1303919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008319	GTGG	2	8	1304069	1304076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008319	ACC	2	6	1304125	1304130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_008319	AG	3	6	1304253	1304258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_008319	TCAGA	2	10	1304259	1304268	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3544	NC_008319	CAG	2	6	1304295	1304300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_008319	TC	3	6	1305508	1305513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_008319	TAG	2	6	1305515	1305520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008319	GCGG	2	8	1306473	1306480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_008319	CCT	2	6	1308788	1308793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_008319	AGGGC	2	10	1308823	1308832	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_008319	GCA	2	6	1308833	1308838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_008319	GAG	2	6	1308851	1308856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008319	AG	3	6	1310468	1310473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008319	A	6	6	1310474	1310479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008319	GGA	2	6	1310486	1310491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_008319	CAA	2	6	1310498	1310503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_008319	A	7	7	1310707	1310713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_008319	GTG	2	6	1312684	1312689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_008319	CAAA	2	8	1313718	1313725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_008319	A	7	7	1313746	1313752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008319	TTG	2	6	1313828	1313833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008319	A	6	6	1313864	1313869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008319	TGC	2	6	1313889	1313894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_008319	A	6	6	1313937	1313942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008319	CAT	2	6	1316768	1316773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_008319	ATT	2	6	1316789	1316794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_008319	TAA	2	6	1316796	1316801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008319	CAAA	2	8	1316856	1316863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_008319	CT	3	6	1316939	1316944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_008319	GAA	2	6	1316946	1316951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008319	AAC	2	6	1319418	1319423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_008319	ATA	2	6	1319433	1319438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008319	T	6	6	1320629	1320634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008319	ACT	2	6	1320727	1320732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_008319	CT	3	6	1320750	1320755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_008319	CTTC	2	8	1320778	1320785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_008319	GTG	2	6	1320786	1320791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008319	TTTG	2	8	1320926	1320933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_008319	TAT	2	6	1320967	1320972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008319	ACG	2	6	1321024	1321029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_008319	TC	3	6	1321033	1321038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_008319	CA	3	6	1321091	1321096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_008319	TGT	3	9	1321136	1321144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008319	CAGC	2	8	1321170	1321177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_008319	AGA	2	6	1321211	1321216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_008319	GTT	2	6	1321285	1321290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008319	TTC	2	6	1321612	1321617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_008319	GTT	2	6	1321653	1321658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008319	CAG	2	6	1321712	1321717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_008319	CT	3	6	1321799	1321804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_008319	A	6	6	1321870	1321875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_008319	ATCT	2	8	1321913	1321920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_008319	GAT	2	6	1321995	1322000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008319	TGA	2	6	1322022	1322027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008319	TGT	2	6	1322028	1322033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_008319	TCA	2	6	1322120	1322125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008319	GAA	2	6	1322131	1322136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_008319	TA	3	6	1322162	1322167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008319	ATC	2	6	1322186	1322191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008319	GAA	2	6	1322211	1322216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008319	GAA	2	6	1322358	1322363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_008319	GTA	2	6	1322443	1322448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008319	AGA	2	6	1322455	1322460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008319	GGA	2	6	1322491	1322496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008319	ATA	2	6	1322555	1322560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008319	ACA	2	6	1322561	1322566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_008319	TGCT	2	8	1322623	1322630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_008319	CAT	2	6	1322631	1322636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_008319	GTA	2	6	1322664	1322669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008319	GCT	2	6	1322670	1322675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008319	TCT	2	6	1322691	1322696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_008319	A	6	6	1322728	1322733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_008319	GGA	2	6	1322754	1322759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_008319	AT	3	6	1322766	1322771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008319	CGA	2	6	1323991	1323996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_008319	GCC	2	6	1324149	1324154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_008319	AAGGC	2	10	1324159	1324168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3617	NC_008319	T	7	7	1324308	1324314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_008319	CTT	2	6	1324319	1324324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_008319	CTG	2	6	1324338	1324343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_008319	TGC	2	6	1324416	1324421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008319	GCA	2	6	1324463	1324468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_008319	CCAA	2	8	1324502	1324509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_008319	CTC	2	6	1324655	1324660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_008319	CTTA	2	8	1324693	1324700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_008319	A	6	6	1324757	1324762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_008319	TCC	2	6	1324786	1324791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_008319	CTC	2	6	1324806	1324811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_008319	A	6	6	1324886	1324891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008319	ACT	2	6	1324909	1324914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_008319	CAT	2	6	1326144	1326149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_008319	CAA	2	6	1326213	1326218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3764	NC_008319	AGTTG	2	10	1354019	1354028	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3765	NC_008319	TCT	2	6	1354086	1354091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3766	NC_008319	GTCAT	2	10	1354134	1354143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3767	NC_008319	TAC	2	6	1354158	1354163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3768	NC_008319	GA	3	6	1354186	1354191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3769	NC_008319	CAGGC	2	10	1358428	1358437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3771	NC_008319	AAAAG	2	10	1358810	1358819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3773	NC_008319	TAAG	2	8	1359014	1359021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3778	NC_008319	A	6	6	1359159	1359164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3782	NC_008319	AAC	2	6	1359477	1359482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3783	NC_008319	ACT	2	6	1359485	1359490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3785	NC_008319	GAA	2	6	1359600	1359605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3786	NC_008319	TGC	3	9	1359632	1359640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3793	NC_008319	GTC	2	6	1359917	1359922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3795	NC_008319	T	6	6	1360048	1360053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3798	NC_008319	AAT	2	6	1360135	1360140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3884	NC_008319	TCAA	2	8	1372015	1372022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3885	NC_008319	GTT	2	6	1372028	1372033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3889	NC_008319	ATT	2	6	1372896	1372901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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